/etc/apt/apt.confはどうなりましたか？
Aptフォルダーを参照してプロキシ設定を試しましたが、Ubuntu 11.04でapt.confファイルが見つかりませんでした。代替ファイルはありますか？
Apt.conf.dの99-synapticにプロキシ設定を追加しても、システムを再起動するたびに上書きされるため、役に立ちません。
/etc/apt/apt.confファイルは、存在する場合でも引き続き読み取られます。パッケージによって提供されるapt構成は、/etc/apt/apt.conf.d/に個別のファイルとしてインストールされるため、メインの構成ファイルで行ったローカルの変更に関係なく追加および更新できます。
したがって、ローカルの構成を変更する場合は、ファイルを作成するだけです。
以下を/etc/apt/apt.confに追加するだけで問題が解決します：Sudo vi /etc/apt/apt.confそして、これを最初の行に追加します：
Acquire::http::Proxy "http://proxy_address:8080/";