Thinkpad E430ノートブックを持っていますが、IntelのUSB 3.0コントローラーはUbuntu 12.04で認識できません。
USB-HDDのLEDは青ではなく白です(Windows 7では、USB 3.0ポートに接続すると青になり、2.0に接続すると白になります)。また、転送速度はWindows 7の65MB/sではなく約25MB/sです。
私はLinuxシステムに精通していないので、何が間違っているのか見当がつきません。ウェブを検索しましたが、解決策がありません。
カーネルを3.5.xにアップグレードすることを検討してください。 precise-updatesリポジトリからlinux-image-3.5.0-18-genericをインストールする可能性があるはずです。
この動きは、Intelチップセットを搭載した「ASRock Z77 Extreme6」マザーボードで、USB関連の問題をすべて解決しました。