ここは:
gnome-Tweak-toolで見つけようとしましたが、運がありません。 Ubuntu Gnome 13.04でGnome Shell v3.8.3を使用しています。
(未検証)
次を〜/ .config/gtk-3.0/gtk.cssに追加して、テーマを手動で編集します。
.window-frame {box-shadow:none;}
ソース: https://www.reddit.com/r/gnome/comments/2achwa/tweaking_mutter_window_shadows/