apt-getインストール、パスディレクトリ、および実行中の依存関係プログラム
私はUbuntuが初めてなので、非常に素人向けの説明を提示する場合はご容赦ください。
私のOS：Ubuntu 11.10サーバー、64ビットバージョン
3つのツールsamtools、bowtie、およびtophatを使用する必要があります。ただし、tophatはsamtoolsとボウタイに依存しています。依存係数は-上記の2つのツール（samtoolsとbowtie）へのパスが正確にどこにあるかを確認するためです。
これで、Sudo apt-get installを使用してsamtoolsとボウタイをインストールできます
- Samtoolsまたはbowtieのライブラリパスがどこにあるのか正確にはわかりません
- Tophatのインストールノートによると、圧縮ファイルからツールを抽出し、dirをこのファイルに変更して./configureを実行します。しかし、抽出されたディレクトリに./configureスクリプトが表示されません
Samtools および Bowtie および Tophat はサイトにあります。これが インストール方法 従おうとしています。
ライブラリがインストールされている場所を見つけるには、dpkg -L samtoolsとボウタイの同じことを試してください。