ダウンロード ShellEd bashスクリプトを編集できるEclipseプラグイン（更新サイトは私には機能しませんでした）。 Help -> Install new software -> Add -> Archiveからインストールしてください。
basheclipse をダウンロードし、内容をEclipse pluginsディレクトリプラグインに抽出します。
Eclipseを再起動します。新しいEclipseプロジェクトBashTestを作成します。
ファイルmyscript.shをプロジェクトに追加します。
#! /bin/bash
. _DEBUG.sh
echo 'kshitiz'
echo 'This is a test'
x=1
y=3
z=3
プロジェクトに_DEBUG.shを追加します（ダウンロードしたbasheclipseのZipに含まれています）。
Run -> Debug configurationsに移動し、Bash scriptカテゴリの下に新しい構成を作成します。 myscript.shを選択します。
次にDebugをクリックします。 Debugパースペクティブを開きます。
Window -> Preferences -> Shell script -> Interpretersに移動し、インタープリターが/bin/bashであることを確認します。私のデフォルトは/bin/dashでした。
スクリプトにブレークポイントを設定します。何らかの理由で、右クリックメニューにブレークポイントを設定するオプションが表示されませんが、Ctrl+Shift+Bは機能するはずです。 
スクリプトRun -> Run as -> Run Shell scriptを実行します。ブレークポイントはヒットしますが、スクリプトソースを見つけることができません（奇妙です！）。 Select Bash scriptをクリックしてmyscript.shを選択するだけです。
これで、コードをステップ実行して変数を分析できます。 
GNU Emacsユーザーの場合は、emacs-package realgud を使用できます。