問題は、一般的なLinuxファイルシステムが最大255文字のファイル名の長さしかサポートしないことです。それでも、FAT32ファイルシステムは長いファイル名をサポートし、Linuxはそれを問題なくサポートします！
解決策は、FAT32形式のパーティションにダウンロードすることです。外部ストレージはすべて動作するはずです（Windowsとの互換性のために、通常はペンドライブFAT32を保持します）。または、独自のパーティションを作成することもできます。
私はここで問題を解決するのではなく、代替案を提供します。
何らかの方法でTransmissionを使用することに決めていない場合は、 Vuze を使用できます。ダウンロードして試してみてください：Sudo apt-get install vuze