プラグインにこれを行うオプションはありません。
トラフィックの多いサイトでは、ページキャッシュガベージコレクションをより頻繁に実行することをお勧めします。これにより、ディスク上のキャッシュのサイズが合理的な量に保たれると思います。
パーティションがパーティションとして正しくマウントされていない限り、ディレクトリにクォータを設定することはできません。それがどのように機能するかを理解するために以下のリンクを見てください
http://www.linuxquestions.org/questions/linux-server-73/directory-quota-601140/#post3088656