Linuxの空のディレクトリまたはディレクトリ自体のハッシュ関数(sha1およびmd5)を計算できますか?
確かに、ファイルをtarballして、そのチェックサムを計算できます。
tar -c -O directory/ | md5sum
コンテンツチェックサムが必要な場合は、試すこともできます
find -s somedir -type f -exec md5sum {} \; | md5sum
本当にあなたがやりたいことに依存します...