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- 最初の違いはCDの内容です。 「サーバー」CDは、Ubuntuがデスクトップパッケージ（X、Gnome、KDEなどのパッケージ）と見なすものを含めませんが、サーバー関連のパッケージ（Apache2、Bind9など）は含めます。最小限のインストールでデスクトップCDを使用して、たとえばネットワークからApache2をインストールすると、サーバーCDを挿入してCD-ROMからApache2をインストールする場合とまったく同じ結果を得ることができます。
- Ubuntu Server Editionのインストールプロセスは、Desktop Editionとは少し異なります。デフォルトではUbuntu ServerにはGUIがないため、プロセスはメニュー駆動型であり、代替CDインストールプロセスに非常に似ています。
- 12.04より前は、Ubuntuサーバーはデフォルトでサーバー最適化カーネルをインストールします。 12.04以降、linux-image-serverはlinux-image-genericにマージされるため、UbuntuデスクトップとUbuntu Serverの間でカーネルに違いはありません。
- 12.04より前のUbuntu LTSリリースでは、Ubuntu Desktop Editionのサポートは3年間のみです。これは、Ubuntu LTS 12.04で5年に延長されました。対照的に、すべてのUbuntu LTS Server Editionリリースは5年間サポートされます。
カーネル設定以外は、Ubuntuデスクトップとサーバーは基本的に同じディストリビューションであり、デフォルトパッケージの選択が異なるだけであることに注意してください。どちらも同じパッケージとリポジトリを使用します。 apt-get install ubuntu-desktopを実行すると、Desktop Editionと同等の機能が得られます。
また、Ubuntu Server向けのパッケージは、デスクトップインストールでも同じように快適に実行できます。
サーバーCDまたはデスクトップCDのどちらを使用してインストールしても、同じUbuntuになります。違いは、デフォルトでインストールするパッケージの選択、つまりインストールプロセスの最後にどのソフトウェアを選択するかにあります。
Ubuntuのインストール済みのコピーで、デスクトップシステムからサーバーシステムに、またはその逆に移動することが可能です。 Ubuntuは、 taskselユーティリティ またはubuntu-desktopやubuntu-serverのようなメタパッケージ（少なくとも16.04の時点で標準のaptパッケージマネージャーで利用可能）で比較的簡単にできます。主にデスクトップコンピューター上のサーバーまたはサーバーソフトウェア（ssh_serverやApache2など）にデスクトップ環境をインストールすることもできます。
ただし、インストール時に、デスクトップ環境を備えたデスクトップシステムが必要なのか、サーバーシステムが必要なのかは、おそらく既にわかっているでしょう。そのため、サーバーとデスクトップ用に異なるインストールCDを用意することは、ソフトウェアの選択を少し簡単にする便利な要素にすぎません。
インストーラーは、「デスクトップ」バージョンのみがグラフィカルLive CDからインストールされるという意味で、異なる動作をします。他のバージョンは、Debianのインストーラーと同様のメニューベースのインストーラーを使用してインストールします。