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LD_LIBRARY_PATHを正しく設定します

Ubuntu 16.04のイメージでDockerを使用しています。私はこのドッカーを使用して実行しています：

  • Boost.pythonを使用してC++クラスをpythonにインポートする
  • MatlabのpythonパッケージをpythonのパッケージをMatlabランタイム（MCR）の助けを借りて）インポートします。

DockerにMCRをインストールする前に、次を使用してboostをインストールしました。

$ Sudo apt-get install -y libboost-all-dev

そして、C++クラスをラップしてPythonで呼び出すことができました。次に、MCRをインストールしました。要件の1つは、LD_LIBRARY_PATHをMatlabのライブラリに設定することです。

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

それは機能し、MATLABのpythonパッケージをpythonで実行できましたが、LD_LIBRARY_PATHの変更によりC++クラスラッパーのテストに失敗しました。たとえば、 、PythonでC++クラスをインポートしようとすると、次のエラーが発生します。

 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0: undefined symbol: XML_SetHashSalt

LD_LIBRARY_PATHの設定を解除すると、C++インポートは機能しますが、MCRが失敗します。したがって、C++クラスとMatlabのpythonパッケージを正常に実行するために、LD_LIBRARY_PATHはどうあるべきかという質問ですか？

ライブラリをLD_LIBRARY_PATHにブーストするパスを追加しようとしましたが、機能しなかったため、env値は次のようになります。

/usr/lib/x86_64-linux-gnu:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

[〜＃〜]編集[〜＃〜]

LD_LIBRARY_PATHを設定する前のC++ライブラリファイルの依存関係：

    linux-vdso.so.1 (0x00007ffcee0dc000)
    libpython3.4m.so.1.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0 (0x00007f9d69e59000)
    libboost_python-py34.so.1.55.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_python-py34.so.1.55.0 (0x00007f9d69c09000)
    libstdc++.so.6 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 (0x00007f9d698fe000)
    libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007f9d695fd000)
    libgcc_s.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libgcc_s.so.1 (0x00007f9d693e7000)
    libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007f9d6903c000)
    librt.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007f9d68e34000)
    libexpat.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libexpat.so.1 (0x00007f9d68c0b000)
    libz.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007f9d689f0000)
    libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007f9d687d3000)
    libdl.so.2 => /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007f9d685cf000)
    libutil.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libutil.so.1 (0x00007f9d683cc000)
    /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007f9d6a6c3000)

the LD_LIBRARY_PATHを設定した後：

    linux-vdso.so.1 (0x00007ffc42e9b000)
    libpython3.4m.so.1.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0 (0x00007fad9635b000)
    libboost_python-py34.so.1.55.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_python-py34.so.1.55.0 (0x00007fad9610b000)
    libstdc++.so.6 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6 (0x00007fad95d8a000)
    libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007fad95a89000)
    libgcc_s.so.1 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64/libgcc_s.so.1 (0x00007fad95873000)
    libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007fad954c8000)
    librt.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007fad952c0000)
    libexpat.so.1 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64/libexpat.so.1 (0x00007fad95095000)
    libz.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007fad94e7a000)
    libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007fad94c5d000)
    libdl.so.2 => /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007fad94a59000)
    libutil.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libutil.so.1 (0x00007fad94856000)
    /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007fad96bc5000)
environment-variableslibrariesmatlabboost
5
Coderji

私にとってそれが機能する唯一の方法は、LD_PRELOADを定義してシステムライブラリをポイントすることです。だから私の現在の環境は：

LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/opengl/lib/glnxa64
LD_PRELOAD=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libexpat.so

そこで、Dockerで、前述の環境変数を含む.matlabファイルを作成しました。次に、dockerfileに以下を追加しました。

services:
  Django: &Django
    build:
      context: .
      dockerfile: ./compose/local/Django/Dockerfile
    depends_on:
      - postgres
    volumes:
      - .:/app
      - shared_upload_tmp:/app_temp
      - media:/app/computation_server/media
    env_file:
      - ./.envs/.local/.Django
      - ./.envs/.local/.postgres
      - ./.envs/.production/.matlab
    ports:
      - "8800:8000"
    command: /start
0
Coderji

次の2つのオプションがあります。

  1. 上記のexportステートメントで共有ライブラリへのパスを接頭辞として付けます（おそらく$LD_LIBRARY_PATHがシステムで設定されていないため、設定されるパスはエクスポートステートメントで明示的に設定されているパスのみです） 。）

    export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib/:/usr/lib/:/usr/lib64/:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

    このexportステートメントは、.bashrc fyiに追加しない限り、Shellセッションの永続的な部分にはなりません。

  2. /etc/ld.so.conf.d/にMATLABライブラリパスを追加し、ldconfigを実行して、システム上のリンカーの新しいパスを識別します。

    （ところで私はMATLABライブラリ名を推測しています。ファイルの名前をMATLAB以外のすべての小文字やその他の名前にする必要があるかもしれません。基本的には、リンク処理中に参照されるライブラリ。makeファイルを調べて、これがどのように参照されるかを確認できます。）

    # Add the file '/etc/ld.so.conf.d/MATLAB' with the following lines 
/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64
/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64
/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64
/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

    次に、ldconfigを実行します。

    Sudo ldconfig

    リンカが通常のシステム検索パスを使用し、MATLABの新しい検索パスを取得するには、$LD_LIBRARY_PATH変数の設定を解除する必要がある場合があります。

    unset $LD_LIBRARY_PATH
3
111---

ワークステーションにも同様の問題がありました。これを回避するために、このパス/usr/lib/GLopsの下にフォルダーを作成し、次にGL librariesを Mesa rpms から抽出して、そのディレクトリに配置しました。最後に、~.tcshrcに次の行を追加しました

setenv LD_LIBRARY_PATH /usr/lib64/GLops/libGL.so
setenv LIBGL_ALWAYS_SOFTWARE 1
setenv LIBGL_ALWAYS_INDIRECT 1
setenv LIBGL_DIR3_DISABLE 1
setenv MESA_GL_VERSION_OVERRIDE 2.1

パス/usr/lib64/GLops/には、次のファイルが含まれています。

libGL.so  libGL.so.1  libGL.so.1.2.0  libxcb.so  libxcb.so.1  libxcb.so.1.1.0

私が持っているライブラリー/usr/lib64/GLops:/usr/lib/GLops

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user88036