ハイパースレッディングを無効にする必要がありますか？
私は大きな仕事をしていて、何がより良い結果をもたらすかを調べるためにトポロジーを実験しています（ntasks、ncores-per-cpu、nodesなどで遊んでいます）私はslurmを使用しています私のワークキューマネージャーとして。
2つのノード（CentOS 7、Bright 7で管理）があり、それぞれに2xIntel（R）Xeon（R）CPU E5-2680 v3 @ 2.50GHzがあります。つまり、12コアの2つのプロセッサ、すべてハイパースレッドなので、ノードごとに48コアがあるように見えます。 （プロセッサトポロジについては、以下を参照してくださいlstopoが提供します）
私の質問：BIOSでハイパースレッディングを無効にする必要がありますか、それともSLURMで無効にする必要がありますか？または、システムを2倍のコアがあるように扱いますか？--thread-per-core=1を指定しても効果がないようです。
私の仕事は、大きな環境モデル、大量のI/O、大量の行列計算などであり、実行には現在数日かかります。
SLURM FAQ を読んでいますが、進め方がまだわかりません。
基本的に、HTが無効になっている場合に可能なより自由なL2/L3キャッシュの恩恵を受けると思われる場合は、先に進んでBIOSからHTを無効にしてください。
ただし、並行して実行できる小さな操作が多数ある場合は、HTを有効のままにしておくと間違いなくメリットがあります。
http://lifehacker.com/how-hyper-threading-really-works-and-when-its-actuall-1394216262
Slurmはコアごとに割り当てます。SLURMはパフォーマンスではなく移植性を考慮して設計されています。したがって、割り当て方法は、「ハイパースレッディングが有効になっているシステムでも、リソースは通常、コアレベルのジョブに割り当てられることに注意してください（以下の注を参照）。2つの異なるジョブはコアを共有しません。」ハイパースレッディングとは何かを知っており、有効にすることができますが、特にソケットごとのコアを調べます。これはオープンソースであり、ハイパースレッドの最適化が適切であると確信しています。