W3 Total CacheプラグインのPrevent caching of objects after settings change
設定でBrowser caching
のチェックを外す必要があります。これにより、メディア(画像、ビデオなど)のURLからクエリ文字列が削除されます。
しかし、この場合、ブラウザのキャッシュが空になるか、クエリ文字列がURLに再度添付されるまで、メディアファイルは訪問者のブラウザによってキャッシュされたままになります。
P.S同じ設定ページのボタンを押して、メディアクエリ文字列を更新する必要があるかもしれません。