約5000行950列のcsvファイルがあります。まず、DataFrameにロードします。
val data = sqlContext.read
.format(csvFormat)
.option("header", "true")
.option("inferSchema", "true")
.load(file)
.cache()
その後、すべての文字列列を検索します
val featuresToIndex = data.schema
.filter(_.dataType == StringType)
.map(field => field.name)
それらにインデックスを付けたい。そのために、文字列列ごとにインデクサーを作成します
val stringIndexers = featuresToIndex.map(colName =>
new StringIndexer()
.setInputCol(colName)
.setOutputCol(colName + "Indexed"))
パイプラインを作成します
val pipeline = new Pipeline().setStages(stringIndexers.toArray)
しかし、このパイプラインで最初のデータフレームを変換しようとすると
val indexedDf = pipeline.fit(data).transform(data)
StackOverflowErrorが発生します
16/07/05 16:55:12 INFO DAGScheduler: Job 4 finished: countByValue at StringIndexer.scala:86, took 7.882774 s
Exception in thread "main" Java.lang.StackOverflowError
at scala.collection.immutable.Set$Set1.contains(Set.scala:84)
at scala.collection.immutable.Set$Set1.$plus(Set.scala:86)
at scala.collection.immutable.Set$Set1.$plus(Set.scala:81)
at scala.collection.mutable.SetBuilder.$plus$eq(SetBuilder.scala:22)
at scala.collection.mutable.SetBuilder.$plus$eq(SetBuilder.scala:20)
at scala.collection.generic.Growable$class.loop$1(Growable.scala:53)
at scala.collection.generic.Growable$class.$plus$plus$eq(Growable.scala:57)
at scala.collection.mutable.SetBuilder.$plus$plus$eq(SetBuilder.scala:20)
at scala.collection.TraversableLike$class.to(TraversableLike.scala:590)
at scala.collection.AbstractTraversable.to(Traversable.scala:104)
at scala.collection.TraversableOnce$class.toSet(TraversableOnce.scala:304)
at scala.collection.AbstractTraversable.toSet(Traversable.scala:104)
at org.Apache.spark.sql.catalyst.trees.TreeNode.containsChild$lzycompute(TreeNode.scala:86)
at org.Apache.spark.sql.catalyst.trees.TreeNode.containsChild(TreeNode.scala:86)
at org.Apache.spark.sql.catalyst.trees.TreeNode$$anonfun$4.apply(TreeNode.scala:280)
at scala.collection.Iterator$$anon$11.next(Iterator.scala:409)
...
私は何が間違っているのですか?ありがとう。
ある種の解決策を見つけたようです-use spark 2.0。以前は1.6.2を使用していました-これは発行時の最新バージョンでした。2.0のプレビューバージョンを使用しようとしました、しかし再現された問題もあります。
ほとんどの場合、すべてのスタックフレームを保持するのに十分なメモリがありません。 RandomForestModelをトレーニングすると、似たようなことが起こります。私にとって有効な回避策は、追加のパラメーターを使用してドライバーアプリケーション(Webサービス)を実行することです。
-XX:ThreadStackSize=81920 -Dspark.executor.extraJavaOptions='-XX:ThreadStackSize=81920'