作成しているJavaアプリケーションのクラスパスを介してアクセスするxmlファイルが必要です。Eclipseでそれを実現する方法
別のリソースフォルダを生成し、それを右クリックしてBuild Path > Use as Source Folder
を選択します。そうすれば、クラスパス上にありますが、Javaソースファイルと混合していません
ディレクトリ含む XMLをランタイムクラスパスに置き、className.Class.getResourceAsStream()
を使用してXMLを含むInputStreamを取得します。
Javaソースフォルダに入れて、リソースとして使用してください