次のxjcコマンドを実行すると、エラーが発生します。
$ xjc "ftp://ftp.ncbi.nih.gov/bioproject/Schema/Core.xsd"
parsing a schema...
compiling a schema...
[ERROR] Two declarations cause a collision in the ObjectFactory class.
line 340 of ftp://ftp.ncbi.nih.gov/bioproject/Schema/Core.xsd
[ERROR] (Related to above error) This is the other declaration.
line 475 of ftp://ftp.ncbi.nih.gov/bioproject/Schema/Core.xsd
JAXBバインディングとXJCの競合は理解していますが、現在のスキーマの競合がどこにあるかはわかりません。
どうすれば修正できますか?
ありがとう、
ピエール
更新:ここにエラーのコンテキストがあります:
$ curl -s "ftp://ftp.ncbi.nih.gov/bioproject/Schema/Core.xsd" | sed 's/^[ \t]*//' | cat -n | egrep -w -A 10 -B 10 '(340|475)'
330 <xs:element maxOccurs="1" name="Description"
331 type="xs:string" minOccurs="0">
332 <xs:annotation>
333 <xs:documentation>
334 Optionally provide description especially when "eOther" is selected
335 </xs:documentation>
336 </xs:annotation>
337 </xs:element>
338 <xs:element name="BioSampleSet" minOccurs="0" maxOccurs="1"><xs:annotation><xs:documentation>Identifier of the BioSample when known</xs:documentation>
339 </xs:annotation>
340 <xs:complexType><xs:sequence><xs:element name="ID" maxOccurs="unbounded" type="xs:token"></xs:element>
341 </xs:sequence>
342 </xs:complexType>
343 </xs:element>
344 </xs:sequence>
345 <xs:attribute name="sample_scope" use="required">
346 <xs:annotation>
347 <xs:documentation>
348 The scope and purity of the biological sample used for the study
349 </xs:documentation>
350 </xs:annotation>
--
465 <xs:documentation>Please, fill Description element when choose "eOther"</xs:documentation>
466 </xs:annotation>
467 </xs:enumeration>
468 </xs:restriction>
469 </xs:simpleType>
470 </xs:attribute>
471 </xs:complexType>
472 </xs:element>
473 <xs:element name="TargetBioSampleSet">
474 <xs:annotation><xs:documentation>Set of Targets references to BioSamples</xs:documentation></xs:annotation>
475 <xs:complexType>
476 <xs:sequence>
477 <xs:element name="ID" type="xs:token" minOccurs="1" maxOccurs="unbounded"></xs:element>
478 </xs:sequence>
479 </xs:complexType>
480 </xs:element>
481 </xs:choice>
482 <xs:element name="Method" minOccurs="1">
483 <xs:annotation>
484 <xs:documentation>
485 The core experimental approach used to obtain the data that is submitted to archival databases
JAXBの最も公式な非公式ガイド から引用します。
スキーマに類似した外観の要素/タイプ名が含まれる場合、「2つの宣言によりObjectFactoryクラスで衝突が発生する」エラーが発生する可能性があります。より正確には、すべてのタイプと多くの要素(正確にはどの要素がファクトリを取得し、何を説明しないのが難しいか)ごとに、XJCは同じパッケージのObjectFactoryクラスで1つのメソッドを生成します。 ObjectFactoryクラスは、XJCがいくつかのファイルを生成するパッケージごとに作成されます。メソッドの名前はXML要素/タイプ名から派生し、2つの要素/タイプが同じメソッド名を生成しようとするとエラーが報告されます。
つまり、2つのオプションがあります。
1つ目は、このような外部バインディングXMLを定義することです
<jaxb:bindings xmlns:jaxb="http://Java.Sun.com/xml/ns/jaxb"
xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema"
version="1.0">
<jaxb:bindings schemaLocation="Core.xsd">
<jaxb:bindings node="//xs:element[@name='BioSampleSet']/xs:complexType">
<jaxb:factoryMethod name="TypeBioSampleSet"/>
</jaxb:bindings>
<jaxb:bindings node="//xs:element[@name='TargetBioSampleSet']/xs:complexType">
<jaxb:factoryMethod name="TypeTargetBioSampleSet"/>
</jaxb:bindings>
</jaxb:bindings>
</jaxb:bindings>
生成されたObjectFactory
クラスでは、createTypeBioSampleSet
およびcreateTypeTargetBioSampleSet
(JAXBは指定した名前をWordに追加しますcreate
)という2つのメソッドを作成します。 BioSampleSet
およびTargetBioSampleSet
オブジェクトの生成に使用されます。
(bothタイプのバインディングを定義する必要はありません。)
JAXBが指定されたスキーマからクラスを生成することを拒否する理由は正確にはわかりませんが、1つのバインディング(たとえばBioSampleSet
)のみを指定した場合、他のタイプのファクトリメソッドはcreateTypeProjectProjectTypeSubmissionWhateverThisAndThatTargetTargetSampleBioCatDogWoofTypeIDoNotKnowWhatElse
そのため、JAXBはこの長いメソッド識別子で窒息したと考えています。これはJAXBの実装の詳細だと思います。
他の解決策は、BioSampleSet
の基本型を作成し、このように両方の場所で使用することです
<xs:element name="ProjectTypeSubmission">
...
<xs:element name="Target">
...
<xs:element name="BioSampleSet" type="typeBioSampleSet" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
...
</xs:element>
...
<xs:element name="TargetBioSampleSet" type="typeBioSampleSet"/>
...
<xs:element/>
...
<xs:complexType name="typeBioSampleSet">
<xs:sequence>
<xs:element name="ID" maxOccurs="unbounded" type="xs:token"></xs:element>
</xs:sequence>
</xs:complexType>
最善の解決策は、すべての匿名型宣言をスキーマから削除することです。このスキーマは(少なくとも私には)混乱しているように見えるので、それができるなら、それをしてください。