これがお粗末な質問であるかどうかはお許しください。しかし、WindowsでJSDocを使用する方法についてはまったく困惑しています。私はJSDoc-Toolkitを知っていますが、少し古くなっており、GoogleコードリポジトリではJSDoc 3を使用することをお勧めしています。 GithubからJSDocをダウンロードし、jsdoc-masterフォルダーをローカルディスクに解凍しましたが、それを使用してファイルを解析する方法に関する確かな情報が見つかりません。
インストールは project-page に文書化されていません。
github-page で説明されています。