.desktopファイルを作成できます。
$ cd Desktop
$ touch Eclipse.desktop
お気に入りのテキストエディター(geditなど)で開きます。
$ gedit Eclipse.desktop
これをそのファイルに追加します。
[Desktop Entry]
Type=Application
Name=Name of your application
Icon=/path/to/icon
Exec=/path/to/application
最後に、実行可能にします。
$ chmod u+x Eclipse.desktop
最終結果は次のようになります。