type map
は、MPIの重要ですが、混乱を招く概念です。タイプマップを表示または印刷するルーチンが欲しいのですが。
たとえば(MPI-3標準から取得)、
MPI_TYPE_CREATE_RESIZED(MPI_INT, -3, 9, type1)
タイプマップになります
{(lb_marker, -3), (int, 0), (ub_marker, 6)}.
そのタイプをもう一度使用します。
MPI_TYPE_CONTIGUOUS(2, type1, type2)
タイプマップは
{(lb_marker, -3), (int, 0), (int,9), (ub_marker, 15)}
そのタイプマップを自動的に表示する方法が欲しいのですが。
確かに、MPI_Type_get_contents
とMPI_Type_get_envelope
を使用して、組み込み型に到達するまで再帰的に下降することができます。これはかなり大きな苦痛であり、私のためにこれを行うための何らかのツールが20年存在すると思っていたでしょう。
有望であるが、完全には機能していないいくつかのツール:
私は〜2001年からMPImapを見つけました ここ 。まず、最新のTcl/TK用に更新し、いくつかのメモリエラーに対処するためにパッチを適用する必要があります。 GUIが応答しなくなります。代わりに、実行時に呼び出すことができるライブラリ/ルーチンを探しています。
MPIDU_Datatype_deubg
は、MPICH固有の内部タイプダンプルーチンです。タイプマップは表示されません(データループ表現が表示され、再び閉じます)
かつて、XMPIと呼ばれるデバッガーがあり、その機能の中にMPIタイプマップを表示する機能がリストされています。このデバッガーはLAM-MPI固有のようで、get_contents/get_envelopeを使用しません。
Rob Latham が言ったように、良い既存の解決策はありません。 tim によって与えられたリンクの助けを借りて、私は Github で利用可能なこの関数を作成しました。 連続+サイズ変更テスト( ここ )の例を取り上げました。出力は次のとおりです。
_contiguous + resize
"(LB, -3), (MPI_INT, 0), (MPI_INT, 9), (UB, 15)"
_
この関数を使用すると、printMapDatatype(mydatatype)
を実行する必要があります。これがあなたが探していたものだったと思います。
次の場合の関数は次のとおりです。
_MPI_Aint printdatatype( MPI_Datatype datatype, MPI_Aint prevExtentTot ) {
int *array_of_ints;
MPI_Aint *array_of_adds;
MPI_Datatype *array_of_dtypes;
int num_ints, num_adds, num_dtypes, combiner;
int i, j;
MPI_Type_get_envelope( datatype, &num_ints, &num_adds, &num_dtypes, &combiner );
array_of_ints = (int *) malloc( num_ints * sizeof(int) );
array_of_adds = (MPI_Aint *) malloc( num_adds * sizeof(MPI_Aint) );
array_of_dtypes = (MPI_Datatype *) malloc( num_dtypes * sizeof(MPI_Datatype) );
MPI_Aint extent, subExtent;
MPI_Type_extent(datatype, &extent);
switch (combiner) {
case MPI_COMBINER_NAMED:
// To print the specific type, we can match against the predefined forms.
if (datatype == MPI_BYTE) printf( "(MPI_BYTE, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_LB) printf( "(MPI_LB, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_PACKED) printf( "(MPI_PACKED, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_UB) printf( "(MPI_UB, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_CHAR) printf( "(MPI_CHAR, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_DOUBLE) printf( "(MPI_DOUBLE, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_FLOAT) printf( "(MPI_FLOAT, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_INT) printf( "(MPI_INT, %ld)", prevExtentTot );
else if (datatype == MPI_LONG) printf( "(MPI_LONG, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_LONG_DOUBLE) printf( "(MPI_LONG_DOUBLE, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_LONG_LONG) printf( "(MPI_LONG_LONG, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_LONG_LONG_INT) printf( "(MPI_LONG_LONG_INT, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_SHORT) printf( "(MPI_SHORT, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_SIGNED_CHAR) printf( "(MPI_SIGNED_CHAR, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_UNSIGNED) printf( "(MPI_UNSIGNED, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) printf( "(MPI_UNSIGNED_CHAR, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) printf( "(MPI_UNSIGNED_LONG, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_UNSIGNED_LONG_LONG)printf( "(MPI_UNSIGNED_LONG_LONG, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) printf( "(MPI_UNSIGNED_SHORT, %ld)", prevExtentTot);
else if (datatype == MPI_WCHAR) printf( "(MPI_WCHAR, %ld)", prevExtentTot);
free( array_of_ints );
free( array_of_adds );
free( array_of_dtypes );
return prevExtentTot;
break;
case MPI_COMBINER_DUP:
MPI_Type_get_contents( datatype, num_ints, num_adds, num_dtypes, array_of_ints, array_of_adds, array_of_dtypes );
printdatatype( array_of_dtypes[0], prevExtentTot);
printf(", \n");
break;
case MPI_COMBINER_CONTIGUOUS:
MPI_Type_get_contents( datatype, num_ints, num_adds, num_dtypes, array_of_ints, array_of_adds, array_of_dtypes );
MPI_Type_extent(array_of_dtypes[0], &subExtent); // no need to do in loop because same type
for (i=0; i < array_of_ints[0]; i++) {
prevExtentTot = printdatatype( array_of_dtypes[0], prevExtentTot);
prevExtentTot += subExtent;
printf(", ");
}
break;
case MPI_COMBINER_VECTOR:
MPI_Type_get_contents( datatype, num_ints, num_adds, num_dtypes, array_of_ints, array_of_adds, array_of_dtypes );
MPI_Type_extent(array_of_dtypes[0], &subExtent); // no need to do in loop because same type
printf("[");
for (i = 0; i < array_of_ints[0]; i++) { //count
printf( "BL : %d - ", array_of_ints[1]);
for (j = 0; j < array_of_ints[2]; j++) { // stride
if (j < array_of_ints[1]) { // if in blocklength
prevExtentTot = printdatatype( array_of_dtypes[0], prevExtentTot);
printf(", ");
}
prevExtentTot += subExtent;
}
}
printf("], ");
break;
case MPI_COMBINER_HVECTOR:
case MPI_COMBINER_HVECTOR_INTEGER:{
MPI_Aint backupPrevExtent = prevExtentTot;
MPI_Type_get_contents( datatype, num_ints, num_adds, num_dtypes, array_of_ints, array_of_adds, array_of_dtypes );
MPI_Type_extent(array_of_dtypes[0], &subExtent); // no need to do in loop because same type
printf("[");
for (i = 0; i < array_of_ints[0]; i++) { //count
printf( "BL : %d - ", array_of_ints[1]);
for (j = 0; j < array_of_ints[1]; j++) { // blocklength
prevExtentTot = printdatatype( array_of_dtypes[0], prevExtentTot);
printf(", ");
prevExtentTot += subExtent;
}
prevExtentTot = backupPrevExtent + array_of_adds[0]; // + stride un byte
}
printf("], ");
break;
}
case MPI_COMBINER_INDEXED:{
MPI_Aint tmpPrevExtent;
int count, blocklength;
MPI_Type_get_contents( datatype, num_ints, num_adds, num_dtypes, array_of_ints, array_of_adds, array_of_dtypes );
MPI_Type_extent(array_of_dtypes[0], &subExtent); // no need to do in loop because same type
printf("<");
count = array_of_ints[0];
for (i = 0; i < count; i++) { // count
blocklength = array_of_ints[i + 1]; // array of blocklength
tmpPrevExtent = prevExtentTot;
tmpPrevExtent += array_of_ints[count + 1 + i] * subExtent; // + displacement * size of block
printf( "BL : %d - ", blocklength);
for (j = 0; j < blocklength; j++) { // blocklength
tmpPrevExtent = printdatatype( array_of_dtypes[0], tmpPrevExtent);
printf(", ");
tmpPrevExtent += subExtent;
}
}
printf(">, ");
prevExtentTot = tmpPrevExtent;
break;
}
case MPI_COMBINER_HINDEXED:
case MPI_COMBINER_HINDEXED_INTEGER:{
MPI_Aint tmpPrevExtent;
int count, blocklength;
MPI_Type_get_contents( datatype, num_ints, num_adds, num_dtypes, array_of_ints, array_of_adds, array_of_dtypes );
MPI_Type_extent(array_of_dtypes[0], &subExtent); // no need to do in loop because same type
printf("<");
count = array_of_ints[0];
for (i = 0; i < count; i++) { // count
blocklength = array_of_ints[i + 1]; // array of blocklength
tmpPrevExtent = prevExtentTot;
tmpPrevExtent += array_of_adds[i]; // + displacement in byte
printf( "BL : %d - ", blocklength);
for (j = 0; j < blocklength; j++) {
tmpPrevExtent = printdatatype( array_of_dtypes[0], tmpPrevExtent);
printf(", ");
tmpPrevExtent += subExtent;
}
}
printf(">, ");
prevExtentTot = tmpPrevExtent;
break;
}
case MPI_COMBINER_INDEXED_BLOCK:{
MPI_Aint tmpPrevExtent;
int count;
MPI_Type_get_contents( datatype, num_ints, num_adds, num_dtypes, array_of_ints, array_of_adds, array_of_dtypes );
MPI_Type_extent(array_of_dtypes[0], &subExtent); // no need to do in loop because same type
printf("<");
count = array_of_ints[0];
for (i = 0; i < count; i++) { // count
tmpPrevExtent = prevExtentTot;
tmpPrevExtent += array_of_ints[i + 2] * subExtent; // + displacement * size of block
printf( "BL : %d - ", array_of_ints[i + 1]);
for (j = 0; j < array_of_ints[1]; j++) { // blocklength
tmpPrevExtent = printdatatype( array_of_dtypes[0], tmpPrevExtent);
printf(", ");
tmpPrevExtent += subExtent;
}
}
printf(">, ");
prevExtentTot = tmpPrevExtent;
break;
}
case MPI_COMBINER_STRUCT:
case MPI_COMBINER_STRUCT_INTEGER:{
MPI_Aint tmpPrevExtent;
MPI_Type_get_contents( datatype, num_ints, num_adds, num_dtypes, array_of_ints, array_of_adds, array_of_dtypes );
printf( "{");
for (i = 0; i < array_of_ints[0]; i++) { // count
tmpPrevExtent = prevExtentTot + array_of_adds[i]; // Origin + displacement
printf( "BL : %d - ", array_of_ints[i + 1]);
tmpPrevExtent = printdatatype( array_of_dtypes[i], tmpPrevExtent);
tmpPrevExtent += subExtent;
printf(", ");
}
printf("}, ");
prevExtentTot = tmpPrevExtent;
break;
}
case MPI_COMBINER_SUBARRAY:
// I don't know what is interresting to display here...
printf("... subarray not handled ...");
break;
case MPI_COMBINER_DARRAY:
// Same
printf("... darray not handled ...");
break;
case MPI_COMBINER_RESIZED:
MPI_Type_get_contents( datatype, num_ints, num_adds, num_dtypes, array_of_ints, array_of_adds, array_of_dtypes );
prevExtentTot = printdatatype( array_of_dtypes[0], prevExtentTot);
printf(", \n");
break;
default:
printf( "Unrecognized combiner type\n" );
}
free( array_of_ints );
free( array_of_adds );
free( array_of_dtypes );
return prevExtentTot;
}
void printMapDatatype(MPI_Datatype datatype) {
MPI_Aint lb, ub;
MPI_Type_lb(datatype, &lb);
MPI_Type_ub(datatype, &ub);
printf("\"(LB, %ld), ", lb);
printdatatype(datatype, 0);
printf("(UB, %ld)\"\n", ub);
}
_