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利用可能なメモリ（キャッシュ）にもかかわらずOOM

メモリの半分近くがFSキャッシュに使用されているにもかかわらず、OOMキラーに遭遇しています。私たちはメモリ統計を毎分1回記録しています（topによって報告されています）が、十分な可用性があるようです。

...

Mem:  15339640k total, 15268304k used,    71336k free,     3152k buffers
Swap:        0k total,        0k used,        0k free,  6608384k cached

Mem:  15339640k total, 14855280k used,   484360k free,    13748k buffers
Swap:        0k total,        0k used,        0k free,  6481852k cached

[OOM killer: postgres killed]

Mem:  15339640k total,  8212200k used,  7127440k free,    32776k buffers
Swap:        0k total,        0k used,        0k free,  2394444k cached

...

SyslogからのOOMの詳細：

...
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840462] wal-e invoked oom-killer: gfp_mask=0x201da, order=0, oom_adj=0, oom_score_adj=0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840469] wal-e cpuset=/ mems_allowed=0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840474] Pid: 7963, comm: wal-e Not tainted 3.2.0-43-virtual #68-Ubuntu
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840477] Call Trace:
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840498]  [<ffffffff81119711>] dump_header+0x91/0xe0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840502]  [<ffffffff81119a95>] oom_kill_process+0x85/0xb0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840506]  [<ffffffff81119e3a>] out_of_memory+0xfa/0x220
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840511]  [<ffffffff8111f823>] __alloc_pages_nodemask+0x8c3/0x8e0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840520]  [<ffffffff81216e00>] ? noalloc_get_block_write+0x30/0x30
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840528]  [<ffffffff811566c6>] alloc_pages_current+0xb6/0x120
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840534]  [<ffffffff81116637>] __page_cache_alloc+0xb7/0xd0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840539]  [<ffffffff81118602>] filemap_fault+0x212/0x3c0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840553]  [<ffffffff81138c32>] __do_fault+0x72/0x550
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840557]  [<ffffffff8113c2ea>] handle_pte_fault+0xfa/0x200
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840562]  [<ffffffff8100638e>] ? xen_pmd_val+0xe/0x10
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840567]  [<ffffffff81005309>] ? __raw_callee_save_xen_pmd_val+0x11/0x1e
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840571]  [<ffffffff8113d559>] handle_mm_fault+0x269/0x370
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840576]  [<ffffffff8100a56d>] ? xen_force_evtchn_callback+0xd/0x10
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840581]  [<ffffffff8100ad42>] ? check_events+0x12/0x20
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840589]  [<ffffffff8165b3cb>] do_page_fault+0x14b/0x520
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840594]  [<ffffffff81160d64>] ? kmem_cache_free+0x104/0x110
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840600]  [<ffffffff811ba2c8>] ? ep_remove+0xa8/0xc0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840604]  [<ffffffff811bb133>] ? sys_epoll_ctl+0xb3/0x3d0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840614]  [<ffffffff81658035>] page_fault+0x25/0x30
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840617] Mem-Info:
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840618] Node 0 DMA per-cpu:
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840622] CPU    0: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840624] CPU    1: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840627] CPU    2: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840629] CPU    3: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840631] Node 0 DMA32 per-cpu:
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840634] CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:  30
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840637] CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:  47
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840639] CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd:  15
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840641] CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd:   2
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840643] Node 0 Normal per-cpu:
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840646] CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840648] CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:  14
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840650] CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840653] CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd:   1
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840658] active_anon:3616567 inactive_anon:4798 isolated_anon:0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840660]  active_file:98 inactive_file:168 isolated_file:20
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840661]  unevictable:1597 dirty:73 writeback:0 unstable:0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840662]  free:16921 slab_reclaimable:17631 slab_unreclaimable:7534
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840663]  mapped:1614529 shmem:1613928 pagetables:124012 bounce:0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840666] Node 0 DMA free:7888kB min:4kB low:4kB high:4kB active_anon:0kB inactive_anon:0kB active_file:0kB inactive_file:0kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:7632kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:0kB shmem:0kB slab_reclaimable:0kB slab_unreclaimable:0kB kernel_stack:0kB pagetables:0kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? yes
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840681] lowmem_reserve[]: 0 4016 15112 15112
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840686] Node 0 DMA32 free:48368kB min:4176kB low:5220kB high:6264kB active_anon:3776804kB inactive_anon:28kB active_file:0kB inactive_file:20kB unevictable:932kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:4112640kB mlocked:932kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:1458536kB shmem:1458632kB slab_reclaimable:17604kB slab_unreclaimable:8088kB kernel_stack:1872kB pagetables:190616kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:437 all_unreclaimable? yes
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840698] lowmem_reserve[]: 0 0 11095 11095
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840703] Node 0 Normal free:11428kB min:11548kB low:14432kB high:17320kB active_anon:10689464kB inactive_anon:19164kB active_file:528kB inactive_file:652kB unevictable:5456kB isolated(anon):0kB isolated(file):80kB present:11362176kB mlocked:5456kB dirty:292kB writeback:0kB mapped:4999580kB shmem:4997080kB slab_reclaimable:52920kB slab_unreclaimable:22048kB kernel_stack:2584kB pagetables:305432kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:1974 all_unreclaimable? yes
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840715] lowmem_reserve[]: 0 0 0 0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840720] Node 0 DMA: 2*4kB 3*8kB 1*16kB 3*32kB 3*64kB 3*128kB 2*256kB 1*512kB 2*1024kB 2*2048kB 0*4096kB = 7888kB
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840752] Node 0 DMA32: 5813*4kB 2636*8kB 114*16kB 15*32kB 5*64kB 1*128kB 1*256kB 0*512kB 1*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 48372kB
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840776] Node 0 Normal: 1888*4kB 10*8kB 46*16kB 4*32kB 3*64kB 2*128kB 1*256kB 1*512kB 0*1024kB 1*2048kB 0*4096kB = 11760kB
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840788] 1615243 total pagecache pages
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840790] 0 pages in swap cache
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840801] Swap cache stats: add 0, delete 0, find 0/0
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840803] Free swap  = 0kB
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840805] Total swap = 0kB
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.909794] 3934192 pages RAM
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.909804] 99282 pages reserved
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.909809] 18899146 pages shared
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.909811] 2198511 pages non-shared
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.909817] [ pid ]   uid  tgid total_vm      rss cpu oom_adj oom_score_adj name
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.909835] [  332]     0   332     4308      109   1       0             0 upstart-udev-br
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.909845] [  346]     0   346     5384      271   2     -17         -1000 udevd
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.909851] [  408]     0   408     5364      174   2     -17         -1000 udevd
...
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.910703] [ 7963]   111  7963    17456     2966   0       0             0 wal-e
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.910707] [ 7968]   111  7968  1639372     2351   3       0             0 postgres
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.910711] [ 7969]   111  7969  1639371     1934   2       0             0 postgres
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.910716] Out of memory: Kill process 12443 (postgres) score 418 or sacrifice child
Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.910733] Killed process 12443 (postgres) total-vm:6555152kB, anon-rss:4600kB, file-rss:6396572kB
Jun 10 05:45:30 db kernel: [11209159.293083] postgres invoked oom-killer: gfp_mask=0x201da, order=0, oom_adj=0, oom_score_adj=0
Jun 10 05:45:31 db kernel: [11209159.293091] postgres cpuset=/ mems_allowed=0
Jun 10 05:45:31 db kernel: [11209159.293095] Pid: 6508, comm: postgres Not tainted 3.2.0-43-virtual #68-Ubuntu
Jun 10 05:45:31 db kernel: [11209159.293098] Call Trace:
Jun 10 05:45:31 db kernel: [11209159.293111]  [<ffffffff81119711>] dump_header+0x91/0xe0
Jun 10 05:45:31 db kernel: [11209159.293115]  [<ffffffff81119a95>] oom_kill_process+0x85/0xb0
Jun 10 05:45:31 db kernel: [11209159.293119]  [<ffffffff81119e3a>] out_of_memory+0xfa/0x220
...

これらの解像度を1秒あたり約1回に増やすことができますが、ここでOOMを使用する理由はありますか？ （-- http://bl0rg.krunch.be/oom-frag.html を見てきましたが、はるかに大きな絶対メモリ量で作業しており、そのほとんどはカーネルのFSキャッシュ。）

以下のpostgresql.confの関連部分も含めます。

shared_buffers = 6GB
effective_cache_size = 8GB
postgresqloom
12
Yang

あなた（そして私と非常によく似た症状の場合）は本当にメモリ不足になり、cached番号に混乱したようです。

Linuxがメモリ要求が増加したときに大きなディスクキャッシュを解放しない場合があります

特に（理由がよくわかりません）、postgresの_shared_buffers_が「キャッシュ」（ページキャッシュ）に報告されることがあります。あなたの場合、topの_6481852k cached_はOOM-killerのログのこの行と一致します：

_Jun 10 05:45:25 db kernel: [11209156.840788] 1615243 total pagecache pages
_

（1615243 * 4KB〜= 6481852k）-OOM-killerを呼び出す前にページキャッシュが実際に削除されなかったことを意味します。

それでも、ファイルに裏付けされたページはほとんどありません（_active_file:98 inactive_file:168_は/ proc/meminfoの Active（file）/ Inactive（file） に類似していると思います）。

https://www.depesz.com/2012/06/09/how-much-ram-is-postgresql-using/ の投稿は、postgresのシャットダウンが「キャッシュ」の削減につながるセッションの例を示しています_shared_buffers_のサイズによって（にスクロールします） "そして、それはほとんどがディスクキャッシュから外れました-共有バッファに使用されたため、期待どおりです。"）-残念ながらそれはしませんpostgresのバージョンも、実験に使用されたカーネルも示しません。

PG 9.3で3.13.0-67 x86_64を使用しています。 9.3では、Sys V共有メモリ（shmget）を 匿名mmap(...R+W, MAP_SHARED|MAP_ANONYMOUS|MAP_HASSEMAPHORE...)+fork() に切り替えました（9.4では、これは dynamic_shared_memory_type で構成可能になりました）。しかし、これらのmmap（）が「キャッシュされた」に表示されるはずである理由、および https://access.redhat.com/solutions/406773 だけが「キャッシュされた」と言う理由に関する説明は見つかりませんでした：ページキャッシュ内のメモリ（ディスクキャッシュと共有メモリ）」

多くの種類の共有メモリがあることを考えると 両方とも啓蒙され混乱しています...

4
Nickolay

  1. 世界のすべてを愛するために、サーバーのスワップスペースを構成します。
    本当にスワップ領域が必要です 。 私がそう言っているのは私だけではありません 、 これは、このあたりの普遍的な真実です 。 （<-これらは3つのリンクです）
    もちろん、十分な数のRAMデータベースサーバーが定期的にスワップしない）必要があります-そうしない場合解決策はお金です（あなたはあなたをあなたのベンダーに連れて行き、より多くのRAMを獲得するために使用します）。

  2. これで十分なRAMがあり、問題が発生した場合に使用できるようにスワップできるので、（メモリのオーバーコミットを無効にすることで）OOMキラーを無効にすることができます Postgresの人々が言うように 。
    （代替ソリューションを適用して、OOM-KillerにPostgresを絶対に殺さないように指示することもできますが、システムの残りのプロセスでロシアンルーレットをプレイしているだけです...）

  3. （オプション） ほとんどのLinuxディストリビューションのデフォルトの動作がBad、Wrongであり、malloc（）の動作に関するPOSIX仕様に違反する理由を詳しく説明するサーバー障害に関する回答を記述します 。誰もがそれについて聞くのに飽き飽きするまでそれを繰り返します。

また、カーネルのキャッシュメモリはpostgres（またはその他のアプリケーション）で使用できることに注意してください。計算では、メモリを空きメモリまたは利用可能なメモリとして考慮してください。

ここで何が起こっているのかを推測しなければならない場合、複雑なクエリがあると思います。Postgresは、実行するためにRAMを要求しています。そのRAM」LinuxはPostgresに「確かに、あなたはそれを持つことができる」と伝えます。
そして、Postgresが実際にuseを試みたとき、RAMこれは（申し立てによると）Linuxが認識しないことを前提として[〜＃〜] have [〜＃〜]RAMコミットされているためPostgresを約束しました）-OOMキラーはRAMを解放するように指示されます、そして最も多くのメモリを使用しているプログラム（データベースサーバー）を忠実に強制終了します。

Postgresは適切に設計されたプログラムです。 RAM=を持たせることができないと言われた場合は、それを正常に処理することを要求しています（lessで行うか、ユーザーへのメッセージで中止することにより）。

8
voretaq7