2D numpy配列があります。この配列の値の一部はNaN
です。この配列を使用して特定の操作を実行したい。たとえば、配列について考えます。
[[ 0. 43. 67. 0. 38.]
[ 100. 86. 96. 100. 94.]
[ 76. 79. 83. 89. 56.]
[ 88. NaN 67. 89. 81.]
[ 94. 79. 67. 89. 69.]
[ 88. 79. 58. 72. 63.]
[ 76. 79. 71. 67. 56.]
[ 71. 71. NaN 56. 100.]]
各行を一度に1つずつ取得し、逆の順序で並べ替えて、行から最大3つの値を取得し、それらの平均を取得しようとしています。私が試したコードは次のとおりです。
# nparr is a 2D numpy array
for entry in nparr:
sortedentry = sorted(entry, reverse=True)
highest_3_values = sortedentry[:3]
avg_highest_3 = float(sum(highest_3_values)) / 3
これは、NaN
を含む行では機能しません。私の質問は、2D numpy配列のすべてのNaN
値をゼロに変換する簡単な方法があるので、ソートや他のことをしようとすることに何の問題もありません。
これは動作するはずです:
from numpy import *
a = array([[1, 2, 3], [0, 3, NaN]])
where_are_NaNs = isnan(a)
a[where_are_NaNs] = 0
上記の場合、where_are_NaNsは次のとおりです。
In [12]: where_are_NaNs
Out[12]:
array([[False, False, False],
[False, False, True]], dtype=bool)
A
は2D配列です。
import numpy as np
A[np.isnan(A)] = 0
関数isnan
は、NaN
値の場所を示すブール配列を生成します。ブール配列は、同じ形状の配列にインデックスを付けるために使用できます。マスクのように考えてください。
nan_to_num() についてはどうですか?
drake's answer を使用して nan_to_num
を使用するコード例:
>>> import numpy as np
>>> A = np.array([[1, 2, 3], [0, 3, np.NaN]])
>>> A = np.nan_to_num(A)
>>> A
array([[ 1., 2., 3.],
[ 0., 3., 0.]])
np.where
を使用して、NaN
がある場所を見つけることができます。
import numpy as np
a = np.array([[ 0, 43, 67, 0, 38],
[ 100, 86, 96, 100, 94],
[ 76, 79, 83, 89, 56],
[ 88, np.nan, 67, 89, 81],
[ 94, 79, 67, 89, 69],
[ 88, 79, 58, 72, 63],
[ 76, 79, 71, 67, 56],
[ 71, 71, np.nan, 56, 100]])
b = np.where(np.isnan(a), 0, a)
In [20]: b
Out[20]:
array([[ 0., 43., 67., 0., 38.],
[ 100., 86., 96., 100., 94.],
[ 76., 79., 83., 89., 56.],
[ 88., 0., 67., 89., 81.],
[ 94., 79., 67., 89., 69.],
[ 88., 79., 58., 72., 63.],
[ 76., 79., 71., 67., 56.],
[ 71., 71., 0., 56., 100.]])
nanがnanと等しくなることはありません
if z!=z:z=0
2D配列の場合
for entry in nparr:
if entry!=entry:entry=0
1次元配列の例であるラムダ関数を使用できます。
import numpy as np
a = [np.nan, 2, 3]
map(lambda v:0 if np.isnan(v) == True else v, a)
これにより結果が得られます。
[0, 2, 3]
numpy.nan_to_num を使用できます:
numpy.nan_to_num(x):nanをzeroおよびinfwithfinite numbers.
例(ドキュメントを参照):
>>> np.set_printoptions(precision=8)
>>> x = np.array([np.inf, -np.inf, np.nan, -128, 128])
>>> np.nan_to_num(x)
array([ 1.79769313e+308, -1.79769313e+308, 0.00000000e+000,
-1.28000000e+002, 1.28000000e+002])