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ルート権限なしでpythonパッケージをインストールする方法？

私はnumpy/scipy/pynestを使用して、Mac OS Xで研究コンピューティングを行っています。パフォーマンスのために、大学から400ノードのクラスター（Linuxを使用）を借りていますタスクを並行して実行できるようにします。問題は、クラスターに余分なパッケージをインストールできないことです（Sudoまたはインストールツールはありません）。それらはraw python自体のみを提供します。

クラスターでスクリプトを実行するにはどうすればよいですか？パッケージをインストールせずに解釈および実行できるように、モジュールを統合する方法はありますか（numpyとscipyにはコンパイル済みのバイナリもいくつかあります）？

pythonnumpyinstallationscipy
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Skyler

パッケージをインストールするのにroot権限は必要ありませんホームディレクトリ内。次のようなコマンドでそれを行うことができます

pip install --user numpy

またはソースから

python setup.py install --user

https://stackoverflow.com/a/7143496/284795 を参照してください

最初の選択肢ははるかに便利なので、サーバーにpipまたはeasy_installがない場合は、管理者に丁寧に追加してもらい、メリットを説明する必要があります（そうはなりません）個々のパッケージのリクエストに悩まされました）。

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Colonel Panic

virtualenv パッケージを使用して仮想環境を作成できます。

これにより、Python実行可能ファイル）の新しいコピーと新しいsite-packagesディレクトリを持つフォルダー（たとえばvenv）が作成され、そこに任意の数のパッケージを「インストール」できますしたがって、source venv/bin/activateを使用して環境をアクティブにすると、Pythonこれらのパッケージをインストールしたのと同等の環境になります。

これはSGEクラスターで機能しますが、仮想環境のアクティブ化方法はクラスターの構成によって異なる場合があります。

次の手順を使用して、独自のサイトパッケージディレクトリ内のクラスターにvirtualenvをインストールしてみてください。

  1. here からvirtualenvをダウンロードし、クラスターに配置します

  2. setup.pyを使用して特定のローカルディレクトリにインストールし、独自のサイトパッケージとして機能させます。

    python setup.py build
python setup.py install --install-base /path/to/local-site-packages

  3. そのディレクトリをPYTHONPATHに追加します。

    export PYTHONPATH="/path/to/local-site-packages:${PYTHONPATH}"

  4. Virtualenvを作成します。

    virtualenv venv
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David Robinson

PythonディストリビューションAnacondaは、この質問で説明した問題の多くを解決します。Anacondaは、管理者またはルートアクセスを必要とせず、ホームディレクトリにインストールできます。 （scipy、numpy、sklearnなど）と、追加パッケージが必要な場合に追加パッケージをインストールするcondaインストーラー。

https://www.continuum.io/downloads からダウンロードできます

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Brian Cain

次を呼び出して、任意のパスからモジュールをインポートできます。

sys.path.append()

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john graham