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効率的な循環バッファー?

効率的な 循環バッファー in python(バッファー内の整数値の平均を取ることを目標としています)を作成したいです。

これはリストを使用して値を収集する効率的な方法ですか?

def add_to_buffer( self, num ):
    self.mylist.pop( 0 )
    self.mylist.append( num )

より効率的なものは何ですか(そしてその理由)?

93
jedierikb

私は使うだろう - collections.dequemaxlen引数付き

>>> import collections
>>> d = collections.deque(maxlen=10)
>>> d
deque([], maxlen=10)
>>> for i in xrange(20):
...     d.append(i)
... 
>>> d
deque([10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19], maxlen=10)

dequeのドキュメントには recipe があり、これはあなたが望むものに似ています。それが最も効率的であるという私の主張は、一流のコードを作成する習慣がある信じられないほど熟練した乗組員によってCで実装されているという事実に完全にかかっています。

182
aaronasterling

リストの先頭からポップすると、リスト全体がコピーされるため、非効率的です

代わりに、固定サイズのリスト/配列と、アイテムを追加/削除するときにバッファ内を移動するインデックスを使用する必要があります

12
John La Rooy

MoonCactusの答え に基づいて、ここにcircularlistクラスがあります。彼のバージョンとの違いは、ここc[0]は常に最も古い追加要素であるc[-1]最新の追加要素、c[-2]最後から2番目...これはアプリケーションにとってより自然です。

c = circularlist(4)
c.append(1); print c, c[0], c[-1]    #[1]              1, 1
c.append(2); print c, c[0], c[-1]    #[1, 2]           1, 2
c.append(3); print c, c[0], c[-1]    #[1, 2, 3]        1, 3
c.append(8); print c, c[0], c[-1]    #[1, 2, 3, 8]     1, 8
c.append(10); print c, c[0], c[-1]   #[10, 2, 3, 8]    2, 10
c.append(11); print c, c[0], c[-1]   #[10, 11, 3, 8]   3, 11

クラス:

class circularlist(object):
    def __init__(self, size, data = []):
        """Initialization"""
        self.index = 0
        self.size = size
        self._data = list(data)[-size:]

    def append(self, value):
        """Append an element"""
        if len(self._data) == self.size:
            self._data[self.index] = value
        else:
            self._data.append(value)
        self.index = (self.index + 1) % self.size

    def __getitem__(self, key):
        """Get element by index, relative to the current index"""
        if len(self._data) == self.size:
            return(self._data[(key + self.index) % self.size])
        else:
            return(self._data[key])

    def __repr__(self):
        """Return string representation"""
        return self._data.__repr__() + ' (' + str(len(self._data))+' items)'

[編集済み]:オプションのdataパラメーターを追加して、既存のリストから初期化できるようにします。例:

circularlist(4, [1, 2, 3, 4, 5])      #  [2, 3, 4, 5] (4 items)
circularlist(4, set([1, 2, 3, 4, 5])) #  [2, 3, 4, 5] (4 items)
circularlist(4, (1, 2, 3, 4, 5))      #  [2, 3, 4, 5] (4 items)
9
Basj

Pythonのdequeは遅いです。代わりにnumpy.rollを使用することもできます シェイプ(n、)または(n、1)のnumpy配列の数値をどのように回転させますか?

このベンチマークでは、dequeは448msです。 Numpy.rollは29msです http://scimusing.wordpress.com/2013/10/25/ring-buffers-in-pythonnumpy/

9
Orvar Korvar

dequeクラスを使用しても問題ありませんが、質問(平均)の要件については、これが私の解決策です。

>>> from collections import deque
>>> class CircularBuffer(deque):
...     def __init__(self, size=0):
...             super(CircularBuffer, self).__init__(maxlen=size)
...     @property
...     def average(self):  # TODO: Make type check for integer or floats
...             return sum(self)/len(self)
...
>>>
>>> cb = CircularBuffer(size=10)
>>> for i in range(20):
...     cb.append(i)
...     print "@%s, Average: %s" % (cb, cb.average)
...
@deque([0], maxlen=10), Average: 0
@deque([0, 1], maxlen=10), Average: 0
@deque([0, 1, 2], maxlen=10), Average: 1
@deque([0, 1, 2, 3], maxlen=10), Average: 1
@deque([0, 1, 2, 3, 4], maxlen=10), Average: 2
@deque([0, 1, 2, 3, 4, 5], maxlen=10), Average: 2
@deque([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6], maxlen=10), Average: 3
@deque([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7], maxlen=10), Average: 3
@deque([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8], maxlen=10), Average: 4
@deque([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9], maxlen=10), Average: 4
@deque([1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10], maxlen=10), Average: 5
@deque([2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11], maxlen=10), Average: 6
@deque([3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12], maxlen=10), Average: 7
@deque([4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13], maxlen=10), Average: 8
@deque([5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14], maxlen=10), Average: 9
@deque([6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15], maxlen=10), Average: 10
@deque([7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16], maxlen=10), Average: 11
@deque([8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17], maxlen=10), Average: 12
@deque([9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18], maxlen=10), Average: 13
@deque([10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19], maxlen=10), Average: 14
6
SmartElectron

Python Cookbook からの解決策、リングバッファインスタンスがいっぱいになったときの再分類を含む)はどうでしょうか。

class RingBuffer:
    """ class that implements a not-yet-full buffer """
    def __init__(self,size_max):
        self.max = size_max
        self.data = []

    class __Full:
        """ class that implements a full buffer """
        def append(self, x):
            """ Append an element overwriting the oldest one. """
            self.data[self.cur] = x
            self.cur = (self.cur+1) % self.max
        def get(self):
            """ return list of elements in correct order """
            return self.data[self.cur:]+self.data[:self.cur]

    def append(self,x):
        """append an element at the end of the buffer"""
        self.data.append(x)
        if len(self.data) == self.max:
            self.cur = 0
            # Permanently change self's class from non-full to full
            self.__class__ = self.__Full

    def get(self):
        """ Return a list of elements from the oldest to the newest. """
        return self.data

# sample usage
if __name__=='__main__':
    x=RingBuffer(5)
    x.append(1); x.append(2); x.append(3); x.append(4)
    print(x.__class__, x.get())
    x.append(5)
    print(x.__class__, x.get())
    x.append(6)
    print(x.data, x.get())
    x.append(7); x.append(8); x.append(9); x.append(10)
    print(x.data, x.get())

実装における設計上の注目すべき選択は、これらのオブジェクトがライフタイムのある時点で非フルバッファーからフルバッファーに非可逆状態遷移を経るため(およびその時点で動作が変化する)、self.__class__。これはPython 2.2でも動作します。両方のクラスに同じスロットがある限りです(たとえば、このレシピのRingBufferと__Fullなどの2つのクラシッククラスで正常に動作します) 。

インスタンスのクラスを変更することは多くの言語で奇妙かもしれませんが、このレシピのように、振る舞いに大きな影響を与える、時折、大規模で、不可逆的で離散的な状態変化を表す他の方法に対するPythonの代替手段です。 Pythonはあらゆる種類のクラスでサポートしています。

クレジット:セバスチャン・ケイム

4
d8aninja

ここには多くの素晴らしい答えが既にありますが、言及されたオプションのタイミングの直接的な比較を見つけることができませんでした。したがって、以下の比較で私の謙虚な試みを見つけてください。

テスト目的でのみ、クラスはlistベースのバッファーとcollections.dequeベースのバッファ、およびNumpy.rollベースのバッファ。

updateメソッドは、一度に1つの値のみを追加して、単純に保つことに注意してください。

import numpy
import timeit
import collections


class CircularBuffer(object):
    buffer_methods = ('list', 'deque', 'roll')

    def __init__(self, buffer_size, buffer_method):
        self.content = None
        self.size = buffer_size
        self.method = buffer_method

    def update(self, scalar):
        if self.method == self.buffer_methods[0]:
            # Use list
            try:
                self.content.append(scalar)
                self.content.pop(0)
            except AttributeError:
                self.content = [0.] * self.size
        Elif self.method == self.buffer_methods[1]:
            # Use collections.deque
            try:
                self.content.append(scalar)
            except AttributeError:
                self.content = collections.deque([0.] * self.size,
                                                 maxlen=self.size)
        Elif self.method == self.buffer_methods[2]:
            # Use Numpy.roll
            try:
                self.content = numpy.roll(self.content, -1)
                self.content[-1] = scalar
            except IndexError:
                self.content = numpy.zeros(self.size, dtype=float)

# Testing and Timing
circular_buffer_size = 100
circular_buffers = [CircularBuffer(buffer_size=circular_buffer_size,
                                   buffer_method=method)
                    for method in CircularBuffer.buffer_methods]
timeit_iterations = 1e4
timeit_setup = 'from __main__ import circular_buffers'
timeit_results = []
for i, cb in enumerate(circular_buffers):
    # We add a convenient number of convenient values (see equality test below)
    code = '[circular_buffers[{}].update(float(j)) for j in range({})]'.format(
        i, circular_buffer_size)
    # Testing
    eval(code)
    buffer_content = [item for item in cb.content]
    assert buffer_content == range(circular_buffer_size)
    # Timing
    timeit_results.append(
        timeit.timeit(code, setup=timeit_setup, number=int(timeit_iterations)))
    print '{}: total {:.2f}s ({:.2f}ms per iteration)'.format(
        cb.method, timeit_results[-1],
        timeit_results[-1] / timeit_iterations * 1e3)

私のシステムでは、これは以下をもたらします:

list:  total 1.06s (0.11ms per iteration)
deque: total 0.87s (0.09ms per iteration)
roll:  total 6.27s (0.63ms per iteration)
4
djvg

このかなり古い Pythonレシピ も見ることができます。

NumPy配列を使用した自分のバージョンは次のとおりです。

#!/usr/bin/env python

import numpy as np

class RingBuffer(object):
    def __init__(self, size_max, default_value=0.0, dtype=float):
        """initialization"""
        self.size_max = size_max

        self._data = np.empty(size_max, dtype=dtype)
        self._data.fill(default_value)

        self.size = 0

    def append(self, value):
        """append an element"""
        self._data = np.roll(self._data, 1)
        self._data[0] = value 

        self.size += 1

        if self.size == self.size_max:
            self.__class__  = RingBufferFull

    def get_all(self):
        """return a list of elements from the oldest to the newest"""
        return(self._data)

    def get_partial(self):
        return(self.get_all()[0:self.size])

    def __getitem__(self, key):
        """get element"""
        return(self._data[key])

    def __repr__(self):
        """return string representation"""
        s = self._data.__repr__()
        s = s + '\t' + str(self.size)
        s = s + '\t' + self.get_all()[::-1].__repr__()
        s = s + '\t' + self.get_partial()[::-1].__repr__()
        return(s)

class RingBufferFull(RingBuffer):
    def append(self, value):
        """append an element when buffer is full"""
        self._data = np.roll(self._data, 1)
        self._data[0] = value
3
scls

これはライブラリを必要としません。リストを拡大し、インデックスごとに循環します。

フットプリントは非常に小さく(ライブラリなし)、少なくともデキューの2倍の速度で実行されます。これは移動平均を実際に計算するのに適していますが、アイテムは上記のように年齢でソートされたままにならないことに注意してください。

class CircularBuffer(object):
    def __init__(self, size):
        """initialization"""
        self.index= 0
        self.size= size
        self._data = []

    def record(self, value):
        """append an element"""
        if len(self._data) == self.size:
            self._data[self.index]= value
        else:
            self._data.append(value)
        self.index= (self.index + 1) % self.size

    def __getitem__(self, key):
        """get element by index like a regular array"""
        return(self._data[key])

    def __repr__(self):
        """return string representation"""
        return self._data.__repr__() + ' (' + str(len(self._data))+' items)'

    def get_all(self):
        """return a list of all the elements"""
        return(self._data)

平均値を取得するには、例えば:

q= CircularBuffer(1000000);
for i in range(40000):
    q.record(i);
print "capacity=", q.size
print "stored=", len(q.get_all())
print "average=", sum(q.get_all()) / len(q.get_all())

結果:

capacity= 1000000
stored= 40000
average= 19999

real 0m0.024s
user 0m0.020s
sys  0m0.000s

これは、デキューと同等の時間の約1/3です。

2
MoonCactus

シリアルプログラミングを行う前に、この問題が発生しました。ちょうど1年前の時点で、効率的な実装も見つからなかったため、 C拡張として1つ を記述し、 pypi の下でも利用可能になりましたan MITライセンス。これは非常に基本的で、8ビットの符号付き文字のバッファのみを処理しますが、長さが柔軟であるため、Structまたはその上にあるものが必要な場合は現在、Google検索では最近いくつかのオプションがありますが、それらも確認してください。

1
sirlark

Githubから:

class CircularBuffer:

    def __init__(self, size):
        """Store buffer in given storage."""
        self.buffer = [None]*size
        self.low = 0
        self.high = 0
        self.size = size
        self.count = 0

    def isEmpty(self):
        """Determines if buffer is empty."""
        return self.count == 0

    def isFull(self):
        """Determines if buffer is full."""
        return self.count == self.size

    def __len__(self):
        """Returns number of elements in buffer."""
        return self.count

    def add(self, value):
        """Adds value to buffer, overwrite as needed."""
        if self.isFull():
            self.low = (self.low+1) % self.size
        else:
            self.count += 1
        self.buffer[self.high] = value
        self.high = (self.high + 1) % self.size

    def remove(self):
        """Removes oldest value from non-empty buffer."""
        if self.count == 0:
            raise Exception ("Circular Buffer is empty");
        value = self.buffer[self.low]
        self.low = (self.low + 1) % self.size
        self.count -= 1
        return value

    def __iter__(self):
        """Return elements in the circular buffer in order using iterator."""
        idx = self.low
        num = self.count
        while num > 0:
            yield self.buffer[idx]
            idx = (idx + 1) % self.size
            num -= 1

    def __repr__(self):
        """String representation of circular buffer."""
        if self.isEmpty():
            return 'cb:[]'

        return 'cb:[' + ','.join(map(str,self)) + ']'

https://github.com/heineman/python-data-structures/blob/master/2.%20Ubiquitous%20Lists/circBuffer.py

1
Ijaz Ahmad Khan

あなたの答えは正しくありません。循環バッファーのメインには2つの原則があります( https://en.wikipedia.org/wiki/Circular_buffer

  1. バッファの長さが設定されます。
  2. 先入先出;
  3. アイテムを追加または削除するとき、他のアイテムは位置を移動しないでください

以下のコード:

def add_to_buffer( self, num ):
    self.mylist.pop( 0 )
    self.mylist.append( num )

コードを使用して、リストがいっぱいになっている状況を考えてみましょう。

self.mylist = [1, 2, 3, 4, 5]

6を追加すると、リストは次のように変更されます。

self.mylist = [2, 3, 4, 5, 6]

リスト内の1を期待するアイテムの位置が変更されました

コードはキューであり、サークルバッファーではありません。

Basjの答えは、最も効率的なものだと思います。

ところで、サークルバッファーは、アイテムを追加する操作のパフォーマンスを悪化させる可能性があります。

1
Johnny Wong

元の質問は、「効率的循環バッファ」でした。要求されたこの効率によると、aaronasterlingからの答えは間違いなく正しいようです。 Pythonでプログラムされた専用クラスを使用し、時間処理をcollections.dequeと比較すると、dequeでx5.2倍の加速が示されます!これをテストする非常に簡単なコードは次のとおりです。

class cb:
    def __init__(self, size):
        self.b = [0]*size
        self.i = 0
        self.sz = size
    def append(self, v):
        self.b[self.i] = v
        self.i = (self.i + 1) % self.sz

b = cb(1000)
for i in range(10000):
    b.append(i)
# called 200 times, this lasts 1.097 second on my laptop

from collections import deque
b = deque( [], 1000 )
for i in range(10000):
    b.append(i)
# called 200 times, this lasts 0.211 second on my laptop

両端キューをリストに変換するには、次を使用します。

my_list = [v for v in my_deque]

その後、deque項目へのO(1)ランダムアクセスを取得します。もちろん、これは、一度設定した後にdequeに多くのランダムアクセスを行う必要がある場合にのみ価値があります。

0
Schmouk

これは、最新のテキストメッセージを保持するためのバッファに同じプリンシパルを適用しています。

import time
import datetime
import sys, getopt

class textbffr(object):
    def __init__(self, size_max):
        #initialization
        self.posn_max = size_max-1
        self._data = [""]*(size_max)
        self.posn = self.posn_max

    def append(self, value):
        #append an element
        if self.posn == self.posn_max:
            self.posn = 0
            self._data[self.posn] = value   
        else:
            self.posn += 1
            self._data[self.posn] = value

    def __getitem__(self, key):
        #return stored element
        if (key + self.posn+1) > self.posn_max:
            return(self._data[key - (self.posn_max-self.posn)])
        else:
            return(self._data[key + self.posn+1])


def print_bffr(bffr,bffer_max): 
    for ind in range(0,bffer_max):
        stored = bffr[ind]
        if stored != "":
            print(stored)
    print ( '\n' )

def make_time_text(time_value):
    return(str(time_value.month).zfill(2) + str(time_value.day).zfill(2)
      + str(time_value.hour).zfill(2) +  str(time_value.minute).zfill(2)
      + str(time_value.second).zfill(2))


def main(argv):
    #Set things up 
    starttime = datetime.datetime.now()
    log_max = 5
    status_max = 7
    log_bffr = textbffr(log_max)
    status_bffr = textbffr(status_max)
    scan_count = 1

    #Main Loop
    # every 10 secounds write a line with the time and the scan count.
    while True: 

        time_text = make_time_text(datetime.datetime.now())
        #create next messages and store in buffers
        status_bffr.append(str(scan_count).zfill(6) + " :  Status is just fine at : " + time_text)
        log_bffr.append(str(scan_count).zfill(6) + " : " + time_text + " : Logging Text ")

        #print whole buffers so far
        print_bffr(log_bffr,log_max)
        print_bffr(status_bffr,status_max)

        time.sleep(2)
        scan_count += 1 

if __== '__main__':
    main(sys.argv[1:])  
0
David Torrens