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警告！ *** HDF5ライブラリバージョンの不一致エラー*** python pandas windows

私はpandas/pythonを使用して、DataFrameをHDFStore形式で保存しています。 my_data_frame.to_hdf（arguments ...）コマンドを適用すると、エラーメッセージが表示されます：警告！ *** HDF5ライブラリバージョンの不一致エラー***と私のプログラムが停止します。

Python 3.5.2 :: Anaconda 4.1.1（64ビット）を使用して、Windows 7（64ビット）で作業しています。

私はこのエラーメッセージについて読んでいましたが、私のコンピューターにインストールされているHDF5のバージョンとAnacondasが使用しているバージョンとの間の問題です。 this 投稿によると、シンプルな "conda install -c anaconda hdf5 = 1.8.18"私の問題を解決できるかもしれませんが、それでも同じメッセージエラーが発生します。

助けてくれてありがとう。

ここにエラーの完全なログを入れます：

 
警告！ *** HDF5ライブラリのバージョン不一致エラー*** 
このアプリケーションのコンパイルに使用されるHDF5ヘッダーファイルは、このアプリケーションのリンク先のHDF5ライブラリで使用されるバージョンと一致しません
。
アプリケーションが続行すると、データの破損またはセグメンテーションエラーが発生する可能性があります。 
アプリケーションを再コンパイルするか、 'LD_LIBRARY_PATH'などの共有ライブラリ関連の
設定を確認する必要があります。
環境を設定して、この警告を無効にすることができます
変数 'HDF5_DISABLE_VERSION_CHECK'の値を '1'に設定します。
 2以上に設定すると、警告メッセージが完全に抑制されます。
ヘッダーは1.8.15、ライブラリは1.8.18 
 HDF5構成の概要
 ================================= 
 
 Gエネラル情報：
 ------------------- 
 HDF5バージョン：1.8.18 
構成日：2017-05- 31 
構成：NMake Makefiles 
構成モード：CMAKE 3.8.0 
ホストシステム：Windows-6.3.9600 
 Uname情報：Windows 
バイトセックス：リトルエンディアン
ライブラリ：
インストールポイント：C：/ bld/hdf5_1496269860661/_b_env/Library 
 
コンパイルオプション：
- ----------------- 
コンパイルモード：RELEASE 
 Cコンパイラ：C：/ Program Files（x86）/ Microsoft Visual Studio 
 14.0/VC/bin/AMD64/cl.exe 
 CFLAGS：/ DWIN32/D_WINDOWS /W3
 H5_CFLAGS：
 AM_CFLAGS：
 CPPFLAGS：
 H5_CPPFLAGS：
 AM_CPPFLAGS：
共有Cライブラリ：YES 
静的Cライブラリ：YES 
静的にリンクされた実行ファイル：OFF 
 LDFLAGS：/machine:x64
 AM_LDFLAGS：
追加ライブラリ：C：/ bld/hdf5_1496269860661/_b_env/Library/lib/z。
 lib 
アーカイバ： 
 Ranlib：
デバッグパッケージ：
 APIトレース：オフ
 
言語：
 --------- -
 Fortran：OFF 
 Fortranコンパイラ：
 Fortran 2003コンパイラ：
 Fortranフラグ：
 H5 Fortranフラグ：
 AM Fortranフラグ：
共有Fortranライブラリy：YES 
静的Fortranライブラリ：YES 
 
 C++：ON 
 C++コンパイラ：C：/ Program Files（x86）/ Microsoft Visual Studio 
 14.0/VC/bin/AMD64/cl.exe 
 C++フラグ：/ DWIN32/D_WINDOWS/W3/GR /EHsc
 H5 C++フラグ：
 AM C++フラグ：
共有C++ライブラリ：YES 
静的C++ライブラリ：YES 
 
機能：
 --------- 
パラレルHDF5：OFF 
高レベルライブラリ：ON 
スレッドセーフ：ON 
デフォルトAPIマッピング：v18 
非推奨のパブリックシンボル：ON 
 I/Oフィルター（外部）：DEFLATE 
 MPE：
直接VFD：
 dmalloc：
ファイルバッファーをクリアする書き込み前：ON 
メモリチェッカーを使用：OFF 
関数スタックトレース：OFF 
厳密なファイル形式のチェック：OFF 
最適化計測：
pythonwindowspandashdf5
11
oso_ted

MacOSで私のために機能した唯一の手順は、virtualenvを作成することでした：

virtualenv -p python3 myenv
. myenv/bin/activate
pip3 install h5py==1.10.4 # or whichever version you want

絶対に何も機能しませんでした！

brew install hdf5が必要になる場合があります

役に立たなかったgithubの問題：

https://github.com/h5py/h5py/issues/1068

0
jtlz2

誰かがこの問題を抱えており、pipやcondaなどを使用してアンインストールしてもまったく問題ない場合：私はすべての/libパスと手動で削除されたlibhdf5*ファイル、次にインストール済みhdf5 with macports。

0
Brooke Polak