了解しました。2つのリストがあります。
[1, 2, 3, 4, 5]
、[4, 5, 6, 7]
など、重複するアイテムを持つことができます。[1, 2, 3, 4, 5]
、[3.5, 4, 5, 6, 7]
[9, 1, 1, 8, 7]
、[8, 6, 7]
。既存の順序が保持されるようにリストをマージし、最後の可能な有効な位置でマージし、データが失われないようにしたい。さらに、最初のリストは巨大かもしれません。私の現在の作業コードは次のとおりです。
master = [1,3,9,8,3,4,5]
addition = [3,4,5,7,8]
def merge(master, addition):
n = 1
while n < len(master):
if master[-n:] == addition[:n]:
return master + addition[n:]
n += 1
return master + addition
私が知りたいのは-これを行うためのより効率的な方法はありますか?それは機能しますが、アプリケーションで大きなランタイムに遭遇する可能性があるため、これには少し不安があります-文字列の大きなリストをマージしています。
編集:[1,3,9,8,3,4,5]、[3,4,5,7,8]のマージは次のようになると思います:[1,3,9,8、- ,4,5、7,8]。わかりやすくするために、重複部分を強調表示しました。
[9、1、1、8、7]、[8、6、7]は[9、1、1、8、7、8、6、7]にマージする必要があります
これは実際にはそれほど難しいことではありません。結局のところ、基本的にあなたがしているのは、Aの最後のどの部分文字列がBのどの部分文字列と一致するかをチェックすることだけです。
def merge(a, b):
max_offset = len(b) # can't overlap with greater size than len(b)
for i in reversed(range(max_offset+1)):
# checks for equivalence of decreasing sized slices
if a[-i:] == b[:i]:
break
return a + b[i:]
次の方法で、テストデータを使用してテストできます。
test_data = [{'a': [1,3,9,8,3,4,5], 'b': [3,4,5,7,8], 'result': [1,3,9,8,3,4,5,7,8]},
{'a': [9, 1, 1, 8, 7], 'b': [8, 6, 7], 'result': [9, 1, 1, 8, 7, 8, 6, 7]}]
all(merge(test['a'], test['b']) == test['result'] for test in test_data)
これは、重なりが生じる可能性のあるスライスのすべての可能な組み合わせを実行し、重なりが見つかった場合はその結果を記憶します。何も見つからない場合は、i
の最後の結果を使用します。これは常に0
になります。いずれにせよ、a
のすべてとb[i]
を超えるすべてを返します(オーバーラップの場合、それはオーバーラップしない部分です。オーバーラップしない場合、それがすべてです)
コーナーケースでは、いくつかの最適化を行うことができることに注意してください。たとえば、ここでの最悪のケースは、解決策を見つけることなくリスト全体を実行することです。最悪の場合に短絡する可能性のあるクイックチェックを最初に追加できます
def merge(a, b):
if a[-1] not in b:
return a + b
...
実際、そのソリューションをさらに一歩進めて、おそらくアルゴリズムをはるかに高速にすることができます
def merge(a, b):
while True:
try:
idx = b.index(a[-1]) + 1 # leftmost occurrence of a[-1] in b
except ValueError: # a[-1] not in b
return a + b
if a[-idx:] == b[:idx]:
return a + b[:idx]
ただし、次のような場合は、最長のオーバーラップが見つからない可能性があります。
a = [1,2,3,4,1,2,3,4]
b = [3,4,1,2,3,4,5,6]
# result should be [1,2,3,4,1,2,3,4,5,6], but
# this algo produces [1,2,3,4,1,2,3,4,1,2,3,4,5,6]
rindex
の代わりにindex
を使用して、最短ではなく最長のスライスに一致させるように修正することもできますが、それが速度にどのように影響するかはわかりません。確かに遅いですが、取るに足らないかもしれません。結果をメモして最短の結果を返すこともできますが、これはより良いアイデアかもしれません。
def merge(a, b):
results = []
while True:
try:
idx = b.index(a[-1]) + 1 # leftmost occurrence of a[-1] in b
except ValueError: # a[-1] not in b
results.append(a + b)
break
if a[-idx:] == b[:idx]:
results.append(a + b[:idx])
return min(results, key=len)
最長のオーバーラップをマージすると、すべての場合で最短の結果が生成されるため、どちらが機能するはずです。
次のことを試すことができます。
>>> a = [1, 3, 9, 8, 3, 4, 5]
>>> b = [3, 4, 5, 7, 8]
>>> matches = (i for i in xrange(len(b), 0, -1) if b[:i] == a[-i:])
>>> i = next(matches, 0)
>>> a + b[i:]
[1, 3, 9, 8, 3, 4, 5, 7, 8]
アイデアは、i
(b[:i]
)の最初のb
要素をi
(a[-i:]
)の最後のa
要素でチェックすることです。 i
は、可能な限り一致させたいので、b
の長さから1(xrange(len(b), 0, -1)
)まで降順で取得します。 i
を使用して最初のそのようなnext
を取得し、それが見つからない場合はゼロ値(next(..., 0)
)を使用します。 i
を見つけた瞬間から、インデックスa
からb
の要素をi
に追加します。
可能な最適化がいくつかあります。
最長のオーバーラップはmaster [-len(addition)]で始まるため、master [1]で開始する必要はありません。
list.index
に呼び出しを追加すると、サブリストの作成や各インデックスのリストの比較を回避できます。
このアプローチにより、コードもかなり理解しやすくなります(そして、cythonまたはpypyを使用して最適化するのが簡単になります)。
master = [1,3,9,8,3,4,5]
addition = [3,4,5,7,8]
def merge(master, addition):
first = addition[0]
n = max(len(master) - len(addition), 1) # (1)
while 1:
try:
n = master.index(first, n) # (2)
except ValueError:
return master + addition
if master[-n:] == addition[:n]:
return master + addition[n:]
n += 1
些細な最適化の1つは、master
リスト全体を反復することではありません。つまり、while n < len(master)
をfor n in range(min(len(addition), len(master)))
に置き換えます(ループ内でn
をインクリメントしないでください)。一致するものがない場合、比較対象のスライスの長さが同じでなくても、現在のコードはmaster
リスト全体を反復処理します。
もう1つの懸念は、master
とaddition
を比較するためにスライスを取得していることです。これにより、毎回2つの新しいリストが作成され、実際には必要ありません。このソリューション( Boyer-Moore に触発された)はスライスを使用しません:
_def merge(master, addition):
overlap_lens = (i + 1 for i, e in enumerate(addition) if e == master[-1])
for overlap_len in overlap_lens:
for i in range(overlap_len):
if master[-overlap_len + i] != addition[i]:
break
else:
return master + addition[overlap_len:]
return master + addition
_
ここでの考え方は、master
のaddition
の最後の要素のすべてのインデックスを生成し、それぞれに_1
_を追加することです。有効なオーバーラップはmaster
の最後の要素で終了する必要があるため、これらの値のみが可能なオーバーラップの長さです。次に、前の要素も並んでいるかどうかを確認できます。
この関数は現在、master
がaddition
よりも長いことを前提としています(そうでない場合は、_master[-overlap_len + i]
_でIndexError
を取得する可能性があります)。保証できない場合は、_overlap_lens
_ジェネレーターに条件を追加します。
また、欲張りではありません。つまり、空でない最小のオーバーラップを探します(merge([1, 2, 2], [2, 2, 3])
は_[1, 2, 2, 2, 3]
_を返します)。それが「可能な限り最後の有効な位置でマージする」という意味だと思います。貪欲なバージョンが必要な場合は、_overlap_lens
_ジェネレーターを逆にします。
私は最適化を提供しませんが、問題を見る別の方法を提供します。私には、これは http://en.wikipedia.org/wiki/Longest_common_substring_problem の特定のケースのように見えます。ここで、部分文字列は常にリスト/文字列の最後にあります。次のアルゴリズムは動的計画法バージョンです。
def longest_common_substring(s1, s2):
m = [[0] * (1 + len(s2)) for i in xrange(1 + len(s1))]
longest, x_longest = 0, 0
for x in xrange(1, 1 + len(s1)):
for y in xrange(1, 1 + len(s2)):
if s1[x - 1] == s2[y - 1]:
m[x][y] = m[x - 1][y - 1] + 1
if m[x][y] > longest:
longest = m[x][y]
x_longest = x
else:
m[x][y] = 0
return x_longest - longest, x_longest
master = [1,3,9,8,3,4,5]
addition = [3,4,5,7,8]
s, e = longest_common_substring(master, addition)
if e - s > 1:
print master[:s] + addition
master = [9, 1, 1, 8, 7]
addition = [8, 6, 7]
s, e = longest_common_substring(master, addition)
if e - s > 1:
print master[:s] + addition
else:
print master + addition
[1, 3, 9, 8, 3, 4, 5, 7, 8]
[9, 1, 1, 8, 7, 8, 6, 7]
に基づく https://stackoverflow.com/a/30056066/541208 :
def join_two_lists(a, b):
index = 0
for i in xrange(len(b), 0, -1):
#if everything from start to ith of b is the
#same from the end of a at ith append the result
if b[:i] == a[-i:]:
index = i
break
return a + b[index:]
まず、わかりやすくするために、whileループをforループに置き換えることができます。
def merge(master, addition):
for n in xrange(1, len(master)):
if master[-n:] == addition[:n]:
return master + addition[n:]
return master + addition
次に、考えられるすべてのスライスを比較する必要はありませんが、master
のスライスがaddition
の最初の要素で始まるスライスのみを比較します。
def merge(master, addition):
indices = [len(master) - i for i, x in enumerate(master) if x == addition[0]]
for n in indices:
if master[-n:] == addition[:n]:
return master + addition[n:]
return master + addition
したがって、次のようにスライスを比較する代わりに:
1234123141234
3579
3579
3579
3579
3579
3579
3579
3579
3579
3579
3579
3579
3579
これらの比較のみを行っています。
1234123141234
| | |
| | 3579
| 3579
3579
これによりプログラムがどれだけ高速化されるかは、データの性質によって異なります。リストに含まれる繰り返し要素が少ないほど、優れています。
addition
のインデックスのリストを生成して、それ自体のスライスが常にmaster
の最後の要素で終わるようにして、比較の数をさらに制限することもできます。
上記のすべてのソリューションは、マージタスクにfor/whileループを使用するという点で類似しています。私は最初に@JuniorCompressorと@TankorSmashによるソリューションを試しましたが、これらのソリューションは2つの大規模なリスト(たとえば、約数百万の要素を持つリスト)をマージするには遅すぎます。
pandasを使用してリストを大きなサイズで連結する方が、はるかに時間効率が良いことがわかりました。
import pandas as pd, numpy as np
trainCompIdMaps = pd.DataFrame( { "compoundId": np.random.permutation( range(800) )[0:80], "partition": np.repeat( "train", 80).tolist()} )
testCompIdMaps = pd.DataFrame( {"compoundId": np.random.permutation( range(800) )[0:20], "partition": np.repeat( "test", 20).tolist()} )
# row-wise concatenation for two pandas
compoundIdMaps = pd.concat([trainCompIdMaps, testCompIdMaps], axis=0)
mergedCompIds = np.array(compoundIdMaps["compoundId"])