複数の数値列に機能がある場合、pysparkのDataFrameでML(KMeansなど)を実行する簡潔な方法があるかどうか疑問に思っています。
つまりIris
データセットの場合:
(a1=5.1, a2=3.5, a3=1.4, a4=0.2, id=u'id_1', label=u'Iris-setosa', binomial_label=1)
機能ベクトルを新しい列として手動で追加し、元の列をコードで繰り返しハードコーディングして、DataSetを再作成せずにKMeansを使用したいと思います。
私が改善したい解決策:
from pyspark.mllib.linalg import Vectors
from pyspark.sql.types import Row
from pyspark.ml.clustering import KMeans, KMeansModel
iris = sqlContext.read.parquet("/opt/data/iris.parquet")
iris.first()
# Row(a1=5.1, a2=3.5, a3=1.4, a4=0.2, id=u'id_1', label=u'Iris-setosa', binomial_label=1)
df = iris.map(lambda r: Row(
id = r.id,
a1 = r.a1,
a2 = r.a2,
a3 = r.a3,
a4 = r.a4,
label = r.label,
binomial_label=r.binomial_label,
features = Vectors.dense(r.a1, r.a2, r.a3, r.a4))
).toDF()
kmeans_estimator = KMeans()\
.setFeaturesCol("features")\
.setPredictionCol("prediction")\
kmeans_transformer = kmeans_estimator.fit(df)
predicted_df = kmeans_transformer.transform(df).drop("features")
predicted_df.first()
# Row(a1=5.1, a2=3.5, a3=1.4, a4=0.2, binomial_label=1, id=u'id_1', label=u'Iris-setosa', prediction=1)
私は次のような解決策を探しています:
feature_cols = ["a1", "a2", "a3", "a4"]
prediction_col_name = "prediction"
<dataframe independent code for KMeans>
<New dataframe is created, extended with the `prediction` column.>
VectorAssembler
を使用できます:
from pyspark.ml.feature import VectorAssembler
ignore = ['id', 'label', 'binomial_label']
assembler = VectorAssembler(
inputCols=[x for x in df.columns if x not in ignore],
outputCol='features')
assembler.transform(df)
ML Pipelineを使用してk-meansと組み合わせることができます。
from pyspark.ml import Pipeline
pipeline = Pipeline(stages=[assembler, kmeans_estimator])
model = pipeline.fit(df)