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"IsADirectoryError：[Errno 21]はディレクトリです："ファイルです

データをテストとトレーニングセットに別のフォルダーに分割しました。次に、患者データをロードする必要があります。各患者には8つの画像があります。

def load_dataset(root_dir, split):
"""
load the data set numpy arrays saved by the preprocessing script
:param root_dir: path to input data
:param split: defines whether to load the training or test set
:return: data: dictionary containing one dictionary ({'data', 'seg', 'pid'}) per patient
"""
in_dir = os.path.join(root_dir, split)
data_paths = [os.path.join(in_dir, f) for f in os.listdir(in_dir)]
data_and_seg_arr = [np.load(ii, mmap_mode='r') for ii in data_paths]
pids = [ii.split('/')[-1].split('.')[0] for ii in data_paths]
data = OrderedDict()
for ix, pid in enumerate(pids):
    data[pid] = {'data': data_and_seg_arr[ix][..., 0], 'seg': data_and_seg_arr[ix][..., 1], 'pid': pid}
return data

しかし、エラーは言った：

File "/home/zhe/Research/Seg/heart_seg/data_loader.py", line 61, in load_dataset
data_and_seg_arr = [np.load(ii, mmap_mode='r') for ii in data_paths]
File "/home/zhe/Research/Seg/heart_seg/data_loader.py", line 61, in <listcomp>
data_and_seg_arr = [np.load(ii, mmap_mode='r') for ii in data_paths]
File "/home/zhe/anaconda3/envs/tf_env/lib/python3.6/site-packages/numpy/lib/npyio.py", line 372, in load
fid = open(file, "rb")
IsADirectoryError: [Errno 21] Is a directory: './data/preprocessed_data/train/Patient009969'

すでにファイル名であり、ディレクトリではありません。ありがとう！

pythonnumpyload
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Zhuo

パス内にファイルとディレクトリの両方がありますか？ os.listdirはファイルとディレクトリの両方をリストするため、np.loadでディレクトリを開こうとすると、そのエラーが発生します。エラーを回避するためにファイルのみをフィルタリングできます。

data_paths = [os.path.join(in_dir, f) for f in os.listdir(in_dir)]
data_paths = [i for i in data_paths if os.path.isfile(i)]

または、1行ですべて一緒に：

data_paths = [i for i in (os.path.join(in_dir, f) for f in os.listdir(in_dir)) if os.path.isfile(i)]
2
solarc

私は同じ問題を抱えていましたが、スクリプトpythonが同じパスにあるData/Train_Data/myDataset /（my images）からData/Train_Data /（my images）にパスを変更することで解決しましたデータとして。このヘルプを願っています。

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Sirine Attia