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numpyとscipyをPythonにインストールする方法は？

Phyton 2.7.5のnumpyとscipyをインストールしようとするのはうんざりです。クラスのインストールが最終目標なので、pythonのこのバージョンが必要です（ http://class-code.net / ）およびmontepython（ http://montepython.net/ ）。

（ubuntu 12.04があります）

Numpyまたはscipyをインポートしようとすると、毎回次のエラーが発生します：

$ phyton2.7
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined        symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

>> import scipy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/__init__.py", line 78, in <module>
  from numpy import show_config as show_numpy_config
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

私が試したエラーを取り除くために：

  1. python要件を満たす：$ Sudo apt-get install build-essential python-dev gfortran
  2. Apt-getでインストール：$ Sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-matplotlib ipython ipython-notebook python-pandas python-sympy python-nose
  3. Pipを使用したインストール要件：$ Sudo pip install requests
  4. ...そしてpipでインストールしようとしました：$ Sudo pip install numpyおよび$ Sudo pip install scipy
  5. 私はすでに環境変数を持っています：export PYTHONPATH=/usr/lib/python2.7/dist-packages:${PYTHONPATH} numpyとscipy（以前のubuntuバージョン10.xで）を最後にインストールしたとき、これはうまくいきました。

  6. Sudo sh -c "wget http://python-distribute.org/distribute_setup.py -O- | python"Sudo sh -c "wget https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py -O- | python"そして、（4）のように両方をpipでインストールします

    しかし、python-distribute.orgのサーバーはダウンしているようです。次のエラーが表示されました。

    http://python-distribute.org/distribute_setup.py
Resolving python-distribute.org (python-distribute.org)... failed: Name or service not known.
wget: unable to resolve Host address `python-distribute.org'

  7. また、シナプスおよびUbuntuソフトウェアセンターからnumpyとscipyをインストールしようとしました

私はこの試みのそれぞれに失敗しましたが、今はどうすればいいのかわかりません。何か不足していますか？ numpyとscipyをPythonに正しくインストールするにはどうすればよいですか？どんなアイデアでも大歓迎です。

私がする時

echo $PYTHONPATH

私は得る

/usr/lib/python2.7/dist-packages
pythonsoftware-installation
36
Jorge

OK、 インストールガイド に従ってください。

  1. python 2.7（既に持っている）が必要だと書かれています：

    $ python --version
Python 2.7.4

  2. 次に、numpyパッケージも必要であると言われています、バージョン> = 1.4.1：

     apt-cacheポリシーpython-numpy 
 python-numpy：
インストール済み：（なし）
候補：1：1.7.1-1ubuntu1 
バージョン表：
 1：1.7.1-1ubuntu1 0 
 500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring/main AMD64パッケージ

    ご覧のとおり、numpyバージョン1.7.1が利用できるので、インストールを続行します。

    Sudo apt-get install python-numpy

  3. さて、cythonが必要だと言っています。そのパッケージが利用可能かどうかを確認しましょう：

    apt-cacheポリシーcython 
 cython：
 Installed：（none）
 Candidate：0.17.4-0ubuntu1 
 Version table：
 0.17.4 -0ubuntu1 0 
 500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring/main AMD64パッケージ

    持っています、インストールします：

    Sudo apt-get install cython

    依存関係の他のパッケージもインストールされていることに注意してください。

  4. 奇妙なことに、scipyモジュールも必要です。

    Sudo apt-get install python-scipy

  5. テスト。ターミナルでpythonを開き、次を入力します。

    $ python
Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) 
[GCC 4.7.3] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import numpy
>>> import scipy
>>> import cython
>>> exit()

    上記はエラーなしでなければなりません。何か問題が発生した場合は、上に行ってガイドをもう一度読んでください。ステップを忘れた/スキップしました。

  6. ページからCLASSソースをダウンロードし、ターミナルのディレクトリに移動し、それを展開して作成します。

    cd where/the/tar/is 
 tar zxf class_v2.0.2.tar.gz 
 cd class_v2.0.2 
 make

    ここで、完了するまで待機します。これが完了したら、pythonディレクトリに移動して、マジックを開始します。ディレクトリから移動せずにこれを実行します：

    cd python 
 python setup.py build 
 python setup.py install --user

    これで、ユーザーディレクトリにCLASSがインストールされました。テストする必要があります！

    python
Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26)
[GCC 4.7.3] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> from classy import Class
>>> exit()

    ここまではすべてがすてきです。

  7. 真実の時間、コードディレクトリにmonthypython tarballをダウンロードします。

    cd〜
 mkdir code 
 cd code 
 wget https://www.dropbox.com/s/l7mnhwsktp1m8b5/montepython_v1.2.5.tar.bz2?dl=1 -O montepython_v1 .2.5.tar.bz2 
 tar jxf montepython_v1.2.5.tar.bz2

    インストール手順では いくつかの注意事項 これはこの特殊なケース（新規インストール）には関係ありませんが、montepythonを更新するときに重要になる場合があります。

  8. この変更は重要です。 CLASSをインストールした場所を覚えていますか？ここで、Monte Pythonを教えてください。私の場合、それは/home/braiam/src/class_v2.0.2/classです。あなたのものとは異なるかもしれません。 findを使用して検索できます。

    find ~ -name class -print

    さて、私はあなたが好きなものを使ってdefault.confファイルを変更し（nanoを使用します）、rootパスを変更するので、完全なファイルは次のようになります：

    # Fill in the relevant path to your personal distribution. 
# If you create a new file out of this one, please remember to call
# MontePython.py with the option '-conf my.conf'

# At minimum, this file should contain one line:
# ** path['cosmo'] =  path to the cosmological code you are using. Note, if you are
# using a modified version of class, be sure that the path contains the Word
# class, otherwise the code might not recognise it.

# If you want to use a data folder different from the one present in the folder
# you are executing the code, please also add:
# ** path['data']  =  /path/to/the/other/data/

root = '/home/braiam/src/class_v2.0.2/'

path['cosmo']           = root+'/class/'

    ファイルを保存して終了します。

  9. モンテパイソンをテストしてください！すべてが正常であれば、montepythongディレクトリでcode/MontePython.py --helpを実行でき、すべてが実行されるはずです。

    〜/ src/montepython $ code/MontePython.py --help 
 usage：MontePython.py [-h] [-N number steps] [-o output folder] 
 [-p input param file] [-c input cov matrix] 
 [-j jumping method] [-f jumping factor] 
 [-conf configuration file] [-chain_number chain number] 
 [ -rチェーンから再起動] [-bf最適なファイルから再起動] 
 [-info [目的のファイルの情報を計算[目的のファイルの情報を計算...]]] 
 [-bins desiredビンの数、デフォルトは20] [-no_mean] 
 [-comp比較フォルダー] 
 [カスタムニーズの追加プロットファイル] [-noplot] [-all] 
 [-ext出力ファイルの拡張子を変更] 
 [-fontsize希望のフォントサイズ、デフォルトは15] 
 [-ticksize希望のティックサイズ、デフォルトは13] 
 
 Monte Python、Pのモンテカルロコードython 
 
 optional arguments：
-h、--helpこのヘルプメッセージを表示して終了
-Nステップ数
-o出力フォルダー
-p入力パラメーターファイル
-c入力covマトリックス
-jジャンプ方法
-fジャンプ係数
-conf構成ファイル
-chain_numberチェーン番号
-rチェーンからの再起動
-bf最適なファイルからの再起動
-info [目的のファイルの情報を計算[目的のファイルの情報を計算... ]] 
-bins希望するビン数、デフォルトは20 
-no_mean 
-comp比較フォルダー
-カスタムニーズ用の追加プロットファイル
 -noplot 
-all 
-ext出力ファイルの拡張子の変更
-fontsize希望のフォントサイズ、デフォルトは15 
-ticksize希望のティックサイズ、デフォルトは13

これで、montepythonがインストールされ、ロールする準備ができました！

41
Braiam