次の入力ファイルがあります。
"Name",97.7,0A,0A,65M,0A,100M,5M,75M,100M,90M,90M,99M,90M,0#,0N#,
そして、私はそれを読んでいます:
#!/usr/bin/env python
import pandas as pd
import sys
import numpy as np
filename = sys.argv[1]
df = pd.read_csv(filename,header=None)
for col in df.columns[2:]:
df[col] = df[col].str.extract(r'(\d+\.*\d*)').astype(np.float)
print df
ただし、エラーが発生します
df[col] = df[col].str.extract(r'(\d+\.*\d*)').astype(np.float)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pandas/core/generic.py", line 2241, in __getattr__
return object.__getattribute__(self, name)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pandas/core/base.py", line 188, in __get__
return self.construct_accessor(instance)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pandas/core/base.py", line 528, in _make_str_accessor
raise AttributeError("Can only use .str accessor with string "
AttributeError: Can only use .str accessor with string values, which use np.object_ dtype in pandas
これはpandas 0.14では問題なく動作しましたが、pandas 0.17.0では動作しません。
最後の列が空であるために発生しているので、これはNaN
に変換されます。
In [417]:
t="""'Name',97.7,0A,0A,65M,0A,100M,5M,75M,100M,90M,90M,99M,90M,0#,0N#,"""
df = pd.read_csv(io.StringIO(t), header=None)
df
Out[417]:
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 \
0 'Name' 97.7 0A 0A 65M 0A 100M 5M 75M 100M 90M 90M 99M 90M 0#
15 16
0 0N# NaN
範囲を最後の行までスライスすると、動作します:
In [421]:
for col in df.columns[2:-1]:
df[col] = df[col].str.extract(r'(\d+\.*\d*)').astype(np.float)
df
Out[421]:
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16
0 'Name' 97.7 0 0 65 0 100 5 75 100 90 90 99 90 0 0 NaN
または、object
dtypeである列を選択してコードを実行することもできます(これは 'Name'エントリであるため、最初の列をスキップします)。
In [428]:
for col in df.select_dtypes([np.object]).columns[1:]:
df[col] = df[col].str.extract(r'(\d+\.*\d*)').astype(np.float)
df
Out[428]:
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16
0 'Name' 97.7 0 0 65 0 100 5 75 100 90 90 99 90 0 0 NaN
この場合、そのシリーズでstr.replace()
メソッドを使用する必要がありますが、最初にstr
タイプに変換する必要があります。
df1.Patient = 's125','s45',s588','s244','s125','s123'
df1 = pd.read_csv("C:\\Users\\Gangwar\\Desktop\\competitions\\cancer prediction\\kaggle_to_students.csv")
df1.Patient = df1.Patient.astype(str)
df1['Patient'] = df1['Patient'].str.replace('s','').astype(int)
Eclipseでの作業中にこのエラーが発生しました。プロジェクトインタープリターは何らかの方法で(更新後)Python 2.7にリセットされました。Python 3.6に戻すと、この問題は解決されました。その結果、いくつかのクラッシュ、再起動、警告が発生しました。
私はこれがここで提起された問題の解決策ではないことを知っていますが、このエラーを検索した後にこのページに来たので、他の人にとっては役に立つかもしれないと思いました。