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Pandas-r dataframeをpandasに戻す方法？

以下を使用してpandas dfをrに変換しました：

import pandas as pd
import pandas.rpy.common as com
import rpy2.robjects as ro
from rpy2.robjects.packages import importr
rdf = com.convert_to_r_dataframe(df)

Rdfをpandas dfに戻すにはどうすればよいですか？

df = f(rdf) ?
pythonrpandas
33
Tampa

Rpy2リリース2.4.0以降、_rpy2_とpandasの間でデータフレームを相互に変換することは、オプションのモジュールとして含まれています。これを使用すると、明示的に変換する必要はなく、その場で行われます。

ドキュメントには例が含まれています（Jupyterノートブックとしても利用できます-ページの上部近くにあるリンク）： https://rpy2.github.io/doc/latest/html/pandas.html#interoperability-with-パンダ

注：この質問に対する元の回答では、次のことが推奨されていました。

_from rpy2.robjects import pandas2ri
pandas2ri.activate()
_

何らかの理由で明示的に変換したい場合、関数はpandas2ri.py2ri()およびpandas2ri.ri2py()です（これらはpandas2ri.pandas2ri()およびpandas2ri.ri2pandas()でした）。

24
lgautier

Lgautierによって提案されているように、それはpandas2ri。

Rpyデータフレーム（rdf）をpandas dataframe（pd_df）：

from rpy2.robjects import pandas2ri

pd_df = pandas2ri.ri2py_dataframe(rdf)
10
huojun

あなたのインポートを考えると、それはそうです：

com.convert_robj(rdf)

例えば、

In [480]: dfrm
Out[480]:
           A          B  C
0   0.454459  49.916767  1
1   0.943284  50.878174  1
2   0.974856  50.335679  2
3   0.776600  50.782104  1
4   0.553895  50.084505  1
5   0.514018  50.719019  2
6   0.915413  50.513962  0
7   0.771571  49.859855  2
8   0.068619  49.409657  0
9   0.728141  50.945174  2
10  0.388115  47.879653  1
11  0.960172  49.680258  0
12  0.015216  50.067968  0
13  0.495024  50.286287  1
14  0.565954  49.909771  1
15  0.992279  49.009696  1
16  0.179934  49.554256  0
17  0.521243  47.854791  0
18  0.551241  51.076262  1
19  0.713271  49.418503  0
20  0.801716  50.660304  1

In [481]: rdfrm = com.convert_to_r_dataframe(dfrm)

In [482]: rdfrm
Out[482]:
<DataFrame - Python:0x14905cf8 / R:0x1600ee98>
[FloatVector, FloatVector, IntVector]
  A: <class 'rpy2.robjects.vectors.FloatVector'>
  <FloatVector - Python:0xf9d0b00 / R:0x140e2620>
[0.454459, 0.943284, 0.974856, ..., 0.551241, 0.713271, 0.801716]
  B: <class 'rpy2.robjects.vectors.FloatVector'>
  <FloatVector - Python:0xf9d0878 / R:0x125aa240>
[49.916767, 50.878174, 50.335679, ..., 51.076262, 49.418503, 50.660304]
  C: <class 'rpy2.robjects.vectors.IntVector'>
  <IntVector - Python:0x11fceef0 / R:0x13f0d918>
[       1,        1,        2, ...,        1,        0,        1]

In [483]: com.convert_robj(rdfrm)
Out[483]:
           A          B  C
0   0.454459  49.916767  1
1   0.943284  50.878174  1
2   0.974856  50.335679  2
3   0.776600  50.782104  1
4   0.553895  50.084505  1
5   0.514018  50.719019  2
6   0.915413  50.513962  0
7   0.771571  49.859855  2
8   0.068619  49.409657  0
9   0.728141  50.945174  2
10  0.388115  47.879653  1
11  0.960172  49.680258  0
12  0.015216  50.067968  0
13  0.495024  50.286287  1
14  0.565954  49.909771  1
15  0.992279  49.009696  1
16  0.179934  49.554256  0
17  0.521243  47.854791  0
18  0.551241  51.076262  1
19  0.713271  49.418503  0
20  0.801716  50.660304  1

ドキュメントで：

In [475]: com.convert_robj?
Type:       function
String Form:<function convert_robj at 0x13e85848>
File:       /mnt/epd/7.3-2_pandas0.12/lib/python2.7/site-packages/pandas/rpy/common.py
Definition: com.convert_robj(obj, use_pandas=True)
Docstring:
Convert rpy2 object to a pandas-friendly form

Parameters
----------
obj : rpy2 object

Returns
-------
Non-rpy data structure, mix of NumPy and pandas objects
8
ely

pandasを使用してrpy2データフレーム、_r_df_を読み取ります。これにより、非推奨の警告「FutureWarning：from_items is deprecated。Use DataFrame.from_dict（dict（items）、...）代わりに」

type(r_df)は「rpy2.robjects.vectors.DataFrame」です。
type(pd_df)は「pandas.core.frame.DataFrame」です

pd_df = pd.DataFrame.from_dict({ key : np.asarray(r_df.rx2(key)) for key in r_df.names })

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Rock Pereira