カテゴリ変数(バイナリ)と連続変数を含むデータセットがあります。連続変数を予測するために線形回帰モデルを適用しようとしています。カテゴリ変数と連続ターゲット変数間の相関関係を確認する方法を教えてください。
現在のコード:
import pandas as pd
df_hosp = pd.read_csv('C:\Users\LAPPY-2\Desktop\LengthOfStay.csv')
data = df_hosp[['lengthofstay', 'male', 'female', 'dialysisrenalendstage', 'asthma', \
'irondef', 'pneum', 'substancedependence', \
'psychologicaldisordermajor', 'depress', 'psychother', \
'fibrosisandother', 'malnutrition', 'hemo']]
print data.corr()
Lengthofstayを除くすべての変数はカテゴリカルです。これでうまくいくでしょうか?
カテゴリ変数をダミー変数 here に変換し、変数をnumpy.arrayに配置します。例えば:
data.csv:
age,size,color_head
4,50,black
9,100,blonde
12,120,brown
17,160,black
18,180,brown
データを抽出する:
import numpy as np
import pandas as pd
df = pd.read_csv('data.csv')
df:
カテゴリー変数color_head
をダミー変数に変換します。
df_dummies = pd.get_dummies(df['color_head'])
del df_dummies[df_dummies.columns[-1]]
df_new = pd.concat([df, df_dummies], axis=1)
del df_new['color_head']
df_new:
それをnumpy配列に入れます:
x = df_new.values
相関を計算します。
correlation_matrix = np.corrcoef(x.T)
print(correlation_matrix)
出力:
array([[ 1. , 0.99574691, -0.23658011, -0.28975028],
[ 0.99574691, 1. , -0.30318496, -0.24026862],
[-0.23658011, -0.30318496, 1. , -0.40824829],
[-0.28975028, -0.24026862, -0.40824829, 1. ]])
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