ここに状況があります:
Amazon S3からgzipされたxmlドキュメントを取得します
import boto
from boto.s3.connection import S3Connection
from boto.s3.key import Key
conn = S3Connection('access Id', 'secret access key')
b = conn.get_bucket('mydev.myorg')
k = Key(b)
k.key('documents/document.xml.gz')
私はファイルでそれらを読みました
import gzip
f = open('/tmp/p', 'w')
k.get_file(f)
f.close()
r = gzip.open('/tmp/p', 'rb')
file_content = r.read()
r.close()
質問
ストリームを直接解凍してコンテンツを読み取るにはどうすればよいですか?
一時ファイルを作成したくありません。見た目が良くありません。
はい、 zlib
module を使用してバイトストリームを解凍できます。
import zlib
def stream_gzip_decompress(stream):
dec = zlib.decompressobj(32 + zlib.MAX_WBITS) # offset 32 to skip the header
for chunk in stream:
rv = dec.decompress(chunk)
if rv:
yield rv
32のオフセットは、gzipヘッダーが予期されているがスキップされたことをzlib
ヘッダーに通知します。
S3キーオブジェクトはイテレータなので、次のことができます。
for data in stream_gzip_decompress(k):
# do something with the decompressed data
私は同じことをしなければならなかった、そしてこれは私がそれをした方法である:
import gzip
f = StringIO.StringIO()
k.get_file(f)
f.seek(0) #This is crucial
gzf = gzip.GzipFile(fileobj=f)
file_content = gzf.read()
Python3xおよびboto3-の場合
そのため、BytesIOを使用して圧縮ファイルをバッファーオブジェクトに読み込み、zipfileを使用して圧縮解除されたストリームを非圧縮データとして開き、データを1行ずつ取得することができました。
import io
import zipfile
import boto3
import sys
s3 = boto3.resource('s3', 'us-east-1')
def stream_Zip_file():
count = 0
obj = s3.Object(
bucket_name='MonkeyBusiness',
key='/Daily/Business/Banana/{current-date}/banana.Zip'
)
buffer = io.BytesIO(obj.get()["Body"].read())
print (buffer)
z = zipfile.ZipFile(buffer)
foo2 = z.open(z.infolist()[0])
print(sys.getsizeof(foo2))
line_counter = 0
for _ in foo2:
line_counter += 1
print (line_counter)
z.close()
if __name__ == '__main__':
stream_Zip_file()
ファイルをダウンロードせずにPIPEを試してコンテンツを読むことができます
import subprocess
c = subprocess.Popen(['-c','zcat -c <gzip file name>'], Shell=True, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)
for row in c.stdout:
print row
さらに、「/ dev/fd /」+ str(c.stdout.fileno())は、他のプログラムに渡すことができるFIFOファイル名(名前付きパイプ))を提供します。