下の腫瘍の位置を脳の左側または右側として画像で見つける必要があります。
輪郭とキャニーエッジ検出を使用して側面を検出しようとしましたが、機能していないようです
# Find Canny edges
edged = cv2.Canny(img, 30, 200)
cv2.waitKey(0)
# Finding Contours
# Use a copy of the image e.g. edged.copy()
# since findContours alters the image
contours, hierarchy = cv2.findContours(edged,
cv2.RETR_EXTERNAL, cv2.CHAIN_APPROX_NONE)
cv2.imshow('Canny Edges After Contouring', edged)
cv2.waitKey(0)
print("Number of Contours found = " + str(len(contours)))
# Draw all contours
# -1 signifies drawing all contours
cv2.drawContours(img, contours, -1, (0, 255, 0), 3)
アプローチは、腫瘍の色が薄いという観察を利用してカラーセグメンテーションを実行することです。まず、脳が画像の中心ではなく片側に配置されている場合に備えて、脳のROIを抽出します。ここから画像をHSV色空間に変換し、下限と上限の色範囲を定義し、次に cv2.inRange()
を使用して色のしきい値処理を実行します。これにより、バイナリマスクが得られます。ここからは、マスクの左半分と右半分を切り取り、次に cv2.countNonZero()
を使用して両側のピクセルを数えます。ピクセル数が多い側が腫瘍のある側になります。
大津の敷居->
検出された脳のROI ->
抽出されたROI
# Load image, grayscale, Otsu's threshold, and extract ROI
image = cv2.imread('1.jpg')
gray = cv2.cvtColor(image, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
thresh = cv2.threshold(gray, 0, 255, cv2.THRESH_BINARY + cv2.THRESH_OTSU)[1]
x,y,w,h = cv2.boundingRect(thresh)
ROI = image[y:y+h, x:x+w]
抽出されたROIの色分割後のバイナリマスク
# Color segmentation on ROI
hsv = cv2.cvtColor(ROI, cv2.COLOR_BGR2HSV)
lower = np.array([0, 0, 152])
upper = np.array([179, 255, 255])
mask = cv2.inRange(hsv, lower, upper)
左半分と右半分をトリミング
# Crop left and right half of mask
x, y, w, h = 0, 0, image.shape[1]//2, image.shape[0]
left = mask[y:y+h, x:x+w]
right = mask[y:y+h, x+w:x+w+w]
各半分のピクセル数
左のピクセル:1252
右のピクセル:12
# Count pixels
left_pixels = cv2.countNonZero(left)
right_pixels = cv2.countNonZero(right)
左半分に多くのピクセルがあるため、腫瘍は脳の左半分にあります
完全なコード
import numpy as np
import cv2
# Load image, grayscale, Otsu's threshold, and extract ROI
image = cv2.imread('1.jpg')
gray = cv2.cvtColor(image, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
thresh = cv2.threshold(gray, 0, 255, cv2.THRESH_BINARY + cv2.THRESH_OTSU)[1]
x,y,w,h = cv2.boundingRect(thresh)
ROI = image[y:y+h, x:x+w]
# Color segmentation on ROI
hsv = cv2.cvtColor(ROI, cv2.COLOR_BGR2HSV)
lower = np.array([0, 0, 152])
upper = np.array([179, 255, 255])
mask = cv2.inRange(hsv, lower, upper)
# Crop left and right half of mask
x, y, w, h = 0, 0, ROI.shape[1]//2, ROI.shape[0]
left = mask[y:y+h, x:x+w]
right = mask[y:y+h, x+w:x+w+w]
# Count pixels
left_pixels = cv2.countNonZero(left)
right_pixels = cv2.countNonZero(right)
print('Left pixels:', left_pixels)
print('Right pixels:', right_pixels)
cv2.imshow('mask', mask)
cv2.imshow('thresh', thresh)
cv2.imshow('ROI', ROI)
cv2.imshow('left', left)
cv2.imshow('right', right)
cv2.waitKey()
このHSV色しきい値スクリプトを使用して、色の下限と上限を決定しました
import cv2
import sys
import numpy as np
def nothing(x):
pass
# Create a window
cv2.namedWindow('image')
# create trackbars for color change
cv2.createTrackbar('HMin','image',0,179,nothing) # Hue is from 0-179 for Opencv
cv2.createTrackbar('SMin','image',0,255,nothing)
cv2.createTrackbar('VMin','image',0,255,nothing)
cv2.createTrackbar('HMax','image',0,179,nothing)
cv2.createTrackbar('SMax','image',0,255,nothing)
cv2.createTrackbar('VMax','image',0,255,nothing)
# Set default value for MAX HSV trackbars.
cv2.setTrackbarPos('HMax', 'image', 179)
cv2.setTrackbarPos('SMax', 'image', 255)
cv2.setTrackbarPos('VMax', 'image', 255)
# Initialize to check if HSV min/max value changes
hMin = sMin = vMin = hMax = sMax = vMax = 0
phMin = psMin = pvMin = phMax = psMax = pvMax = 0
img = cv2.imread('1.jpg')
output = img
waitTime = 33
while(1):
# get current positions of all trackbars
hMin = cv2.getTrackbarPos('HMin','image')
sMin = cv2.getTrackbarPos('SMin','image')
vMin = cv2.getTrackbarPos('VMin','image')
hMax = cv2.getTrackbarPos('HMax','image')
sMax = cv2.getTrackbarPos('SMax','image')
vMax = cv2.getTrackbarPos('VMax','image')
# Set minimum and max HSV values to display
lower = np.array([hMin, sMin, vMin])
upper = np.array([hMax, sMax, vMax])
# Create HSV Image and threshold into a range.
hsv = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2HSV)
mask = cv2.inRange(hsv, lower, upper)
output = cv2.bitwise_and(img,img, mask= mask)
# Print if there is a change in HSV value
if( (phMin != hMin) | (psMin != sMin) | (pvMin != vMin) | (phMax != hMax) | (psMax != sMax) | (pvMax != vMax) ):
print("(hMin = %d , sMin = %d, vMin = %d), (hMax = %d , sMax = %d, vMax = %d)" % (hMin , sMin , vMin, hMax, sMax , vMax))
phMin = hMin
psMin = sMin
pvMin = vMin
phMax = hMax
psMax = sMax
pvMax = vMax
# Display output image
cv2.imshow('image',output)
# Wait longer to prevent freeze for videos.
if cv2.waitKey(waitTime) & 0xFF == ord('q'):
break
cv2.destroyAllWindows()
canny
とfindContours
は、この種の問題に対する適切な解決策ではありません。単純な解決策が必要な場合は、しきい値法を使用してください。大津敷居も良い結果になります。