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ValueError：シーケンスを使って配列要素を設定する

このPythonコード：

import numpy as p

def firstfunction():
    UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray = []
    MeanOutputHeader=['TestID','ConditionName','FilterType','RRMean','HRMean','dZdtMaxVoltageMean','BZMean','ZXMean'
                      ,'LVETMean','Z0Mean','StrokeVolumeMean','CardiacOutputMean','VelocityIndexMean']
    dataMatrix = BeatByBeatMatrixOfMatrices[column]
    roughTrimmedMatrix = p.array(dataMatrix[1:,1:17])


    trimmedMatrix = p.array(roughTrimmedMatrix,dtype=p.float64)  #ERROR THROWN HERE


    myMeans = p.mean(trimmedMatrix,axis=0,dtype=p.float64)
    conditionMeansArray = [TestID,testCondition,'UnfilteredBefore',myMeans[3], myMeans[4], myMeans[6], myMeans[9]
                      , myMeans[10], myMeans[11], myMeans[12], myMeans[13], myMeans[14], myMeans[15]]
    UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray.append(conditionMeansArray)
    secondfunction(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray)
    return

def secondfunction(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray):
    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]
    return

firstfunction()

このエラーメッセージを投げます：

File "mypath\mypythonscript.py", line 3484, in secondfunction
RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]
ValueError: setting an array element with a sequence.

エラーメッセージが表示されないようにするために、上記の壊れたコードの問題を解決するための対処方法を誰かに教えてもらえますか？

編集：マトリックスの内容を取得するためにprintコマンドを実行しましたが、これが出力されたものです。

UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArrayは次のとおりです。

[['TestID', 'ConditionName', 'FilterType', 'RRMean', 'HRMean', 'dZdtMaxVoltageMean', 'BZMean', 'ZXMean', 'LVETMean', 'Z0Mean', 'StrokeVolumeMean', 'CardiacOutputMean', 'VelocityIndexMean'],
[u'HF101710', 'PreEx10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.90670000000000006, 66.257731979420001, 1.8305673000000002, 0.11750000000000001, 0.15120546389880002, 0.26870546389879996, 27.628261216480002, 86.944190346160013, 5.767261352345999, 0.066259118585869997],
[u'HF101710', '25W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.68478571428571422, 87.727887206978565, 2.2965444125714285, 0.099642857142857144, 0.14952476549885715, 0.24916762264164286, 27.010483303721429, 103.5237336525, 9.0682762747642869, 0.085022572648242867],
[u'HF101710', '50W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.54188235294117659, 110.74841107829413, 2.6719262705882354, 0.077705882352917643, 0.15051306356552943, 0.2282189459185294, 26.768787504858825, 111.22827075238826, 12.329456404418824, 0.099814258468417641],
[u'HF101710', '75W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.4561904761904762, 131.52996981880955, 3.1818159523809522, 0.074714285714290493, 0.13459344175047619, 0.20930772746485715, 26.391156337028569, 123.27387909873812, 16.214243779323812, 0.1205685359981619]]

私には5行13列のマトリックスのように見えますが、異なるデータがスクリプトを実行されるときに行数は変わります。私がこれに追加しているのと同じデータです。

編集2：ただし、スクリプトはエラーをスローしています。だから私はあなたの考えがここで起こっている問題を説明しているとは思わない。ありがとう、結構です。他のアイデア？

編集3：

参考までに、この問題のコード行を置き換えると、

    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]

代わりにこれで：

    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray)[1:,3]

それからスクリプトのその部分はエラーを投げることなくうまく働きますが、それからこのコード行はさらに下の行に続きます：

p.ylim(.5*RRDuringArray.min(),1.5*RRDuringArray.max())

このエラーを投げます：

File "mypath\mypythonscript.py", line 3631, in CreateSummaryGraphics
  p.ylim(.5*RRDuringArray.min(),1.5*RRDuringArray.max())
TypeError: cannot perform reduce with flexible type

そのため、matplotlibでylimを使用できるようにするにはデータ型を指定する必要がありますが、それでもデータ型を指定すると、この投稿を開始したエラーメッセージが表示されます。

pythonarraysnumpyslice
147
MedicalMath

あなたが私たちに示したコードから、私たちが言うことができる唯一のことはあなたが多次元配列のような形ではないリストから配列を作成しようとしているということです。例えば

numpy.array([[1,2], [2, 3, 4]])

または

numpy.array([[1,2], [2, [3, 4]]])

入力リストの形状は多次元配列に変換できる（一般化された） "ボックス"ではないため、このエラーメッセージが表示されます。そのためおそらくUnFilteredDuringExSummaryOfMeansArrayは異なる長さのシーケンスを含みます。

編集：このエラーメッセージのもう1つの原因は、float型の配列の要素として文字列を使用しようとしていることです。

numpy.array([1.2, "abc"], dtype=float)

それはあなたの編集に従って試みているものです。文字列と浮動小数点数の両方を含むNumPy配列が本当に必要な場合は、dtype objectを使用することができます。これにより、配列は任意のPythonオブジェクトを保持できます。

numpy.array([1.2, "abc"], dtype=object)

あなたのコードが何を達成するのかを知らずに、私はこれがあなたが望むものであるかどうか判断できません。

199
Sven Marnach

PythonのValueError：

ValueError: setting an array element with a sequence.

それが言うことを正確に意味する、あなたは単一の数字スロットに数字のシーケンスを詰め込もうとしています。さまざまな状況でスローされる可能性があります。

1。あなたがPythonのTupleまたはリストを渡して、でこぼこの配列要素として解釈される場合：

import numpy

numpy.array([1,2,3])               #good

numpy.array([1, (2,3)])            #Fail, can't convert a Tuple into a numpy 
                                   #array element


numpy.mean([5,(6+7)])              #good

numpy.mean([5,Tuple(range(2))])    #Fail, can't convert a Tuple into a numpy 
                                   #array element


def foo():
    return 3
numpy.array([2, foo()])            #good


def foo():
    return [3,4]
numpy.array([2, foo()])            #Fail, can't convert a list into a numpy 
                                   #array element

2。 1を超える長さの配列配列をnumpy配列要素に詰め込もうとします。

x = np.array([1,2,3])
x[0] = np.array([4])         #good



x = np.array([1,2,3])
x[0] = np.array([4,5])       #Fail, can't convert the numpy array to fit 
                             #into a numpy array element

Numpy配列が作成されていて、numpyは多値タプルまたは配列を単一要素のスロットに詰め込む方法を知りません。与えられたものが1つの数に評価されることを期待します。もしそうでなければ、Numpyは配列要素にシーケンスを設定する方法を知らないと答えます。

29
Eric Leschinski

私の場合は、Tensorflowでこのエラーが発生しました。理由は、長さやシーケンスが異なる配列を入力しようとしたからです。

例：

import tensorflow as tf

input_x = tf.placeholder(tf.int32,[None,None])



Word_embedding = tf.get_variable('embeddin',shape=[len(vocab_),110],dtype=tf.float32,initializer=tf.random_uniform_initializer(-0.01,0.01))

embedding_look=tf.nn.embedding_lookup(Word_embedding,input_x)

with tf.Session() as tt:
    tt.run(tf.global_variables_initializer())

    a,b=tt.run([Word_embedding,embedding_look],feed_dict={input_x:example_array})
    print(b)

そして私の配列が

example_array = [[1,2,3],[1,2]]

それから私はエラーになります：

ValueError: setting an array element with a sequence.

しかし、私がパディングするなら：

example_array = [[1,2,3],[1,2,0]]

今それは働いています。

10
Aaditya Ura

私の場合、問題は別でした。 intのリストのリストを配列に変換しようとしていました。問題は、他のリストとは長さが異なるリストが1つあることでした。あなたがそれを証明したいならば、あなたはしなければなりません：

print([i for i,x in enumerate(list) if len(x) != 560])

私の場合、長さ参照は560でした。

4
Andrés M. Jiménez

numpyで同様の問題を抱えている場合のための非常に単純な解決策は以下のようになります。

値を割り当てるための配列を定義するときにdtype=objectを定義する。例えば：

out = np.empty_like(lil_img, dtype=object)
4
Adam Liu

私の場合、問題はデータフレームX []の散布図にあります。

ax.scatter(X[:,0],X[:,1],c=colors,    
       cmap=CMAP, edgecolor='k', s=40)  #c=y[:,0],

#ValueError: setting an array element with a sequence.
#Fix with .toarray():
colors = 'br'
y = label_binarize(y, classes=['Irrelevant','Relevant'])
ax.scatter(X[:,0].toarray(),X[:,1].toarray(),c=colors,   
       cmap=CMAP, edgecolor='k', s=40)
2
Max Kleiner