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ラベル付きのRの水平樹状図

hclust関数の出力から樹状図を描画しようとしています。樹形図がデフォルトではなく水平に配置されていることを願っています。

_require(graphics)
hc <- hclust(dist(USArrests), "ave")
plot(hc)
_

as.dendrogram()のようなplot(as.dendrogram(hc.poi),horiz=TRUE)関数を使用しようとしましたが、結果には意味のあるラベルがありません：

enter image description here

plot(hc.poi,labels=c(...))のないas.dendrogram()を使用すると、_labels=_引数を渡すことができますが、樹形図は水平ではなく垂直になります。樹状図を同時に水平に配置し、ユーザー指定のラベルを割り当てる方法はありますか？ありがとう！

pdate：USArrestsデータセットの例として、州名の最初の2文字の略語をラベルとして使用して、何らかの形でlabsをプロットに渡したいとします。関数：

labs = substr(rownames(USArrests),1,2)

与える

_ [1] "Al" "Al" "Ar" "Ar" "Ca" "Co" "Co" "De" "Fl" "Ge" "Ha"
[12] "Id" "Il" "In" "Io" "Ka" "Ke" "Lo" "Ma" "Ma" "Ma" "Mi"
[23] "Mi" "Mi" "Mi" "Mo" "Ne" "Ne" "Ne" "Ne" "Ne" "Ne" "No"
[34] "No" "Oh" "Ok" "Or" "Pe" "Rh" "So" "So" "Te" "Te" "Ut"
[45] "Ve" "Vi" "Wa" "We" "Wi" "Wy"
_
rdendrogramhclust
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alittleboy

定義されたラベルを水平樹状図で表示するには、1つの解決策は、データフレームの行名を新しいラベルに設定することです（すべてのラベルは一意である必要があります）。

require(graphics)
labs = paste("sta_",1:50,sep="") #new labels
USArrests2<-USArrests #new data frame (just to keep original unchanged)
rownames(USArrests2)<-labs #set new row names
hc <- hclust(dist(USArrests2), "ave")
par(mar=c(3,1,1,5)) 
plot(as.dendrogram(hc),horiz=T)

enter image description here

編集-ggplot2を使用したソリューション

labs = paste("sta_",1:50,sep="") #new labels
rownames(USArrests)<-labs #set new row names
hc <- hclust(dist(USArrests), "ave")

library(ggplot2)
library(ggdendro)

#convert cluster object to use with ggplot
dendr <- dendro_data(hc, type="rectangle") 

#your own labels (now rownames) are supplied in geom_text() and label=label
ggplot() + 
  geom_segment(data=segment(dendr), aes(x=x, y=y, xend=xend, yend=yend)) + 
  geom_text(data=label(dendr), aes(x=x, y=y, label=label, hjust=0), size=3) +
  coord_flip() + scale_y_reverse(expand=c(0.2, 0)) + 
  theme(axis.line.y=element_blank(),
        axis.ticks.y=element_blank(),
        axis.text.y=element_blank(),
        axis.title.y=element_blank(),
        panel.background=element_rect(fill="white"),
        panel.grid=element_blank())

enter image description here

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Didzis Elferts

dendrapplyを使用すると、デンドロを好きなようにカスタマイズできます。

enter image description here

colLab <- function(n) {
  if(is.leaf(n)) {
    a <- attributes(n)
    attr(n, "label") <- substr(a$label,1,2)             #  change the node label 
    attr(n, "nodePar") <- c(a$nodePar, lab.col = 'red') #   change the node color
  }
  n
}

require(graphics)
hc <- hclust(dist(USArrests), "ave")
clusDendro <- as.dendrogram(hc)
clusDendro <- dendrapply(clusDendro, colLab)
op <- par(mar = par("mar") + c(0,0,0,2))
plot(clusDendro,horiz=T)
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agstudy