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行列のNA / NaN / Infを削除します

私は2つのことを試してみたい:

  1. NA/NaN/Infを含む行を削除する方法
  2. データポイントの値をNA/NaN/Infから0に設定するにはどうすればよいですか。

これまでのところ、私はNA値に次のものを使用しようとしましたが、警告を受けていました。

> eg <- data[rowSums(is.na(data)) == 0,]
 Error in rowSums(is.na(data)) : 
       'x' must be an array of at least two dimensions
     In addition: Warning message:
     In is.na(data) : is.na() applied to non-(list or vector) of type 'closure'
16
user2199881

私は私の好みの方法で帽子を指輪に投げ込むと思います:

# sample data
m <- matrix(c(1,2,NA,NaN,1,Inf,-1,1,9,3),5)
# remove all rows with non-finite values
m[!rowSums(!is.finite(m)),]
# replace all non-finite values with 0
m[!is.finite(m)] <- 0
34
Joshua Ulrich
_library(functional)
m[apply(m, 1, Compose(is.finite, all)),]
_

デモンストレーション:

_m <- matrix(c(1,2,3,NA,4,5), 3)
m
##      [,1] [,2]
## [1,]    1   NA
## [2,]    2    4
## [3,]    3    5

m[apply(m, 1, Compose(is.finite, all)),]
##      [,1] [,2]
## [1,]    2    4
## [2,]    3    5
_

注:Compose(is.finite, all)function(x) all(is.finite(x))と同等です

値を0に設定するには、マトリックスインデックスを使用します。

_m[!is.finite(m)] <- 0
m
##      [,1] [,2]
## [1,]    1    0
## [2,]    2    4
## [3,]    3    5
_
13

NaRV.omit(x)は、質問1の推奨オプションです。ニーモニックNaRVは「通常の値ではない」という意味です。

require(IDPmisc)
m <- matrix(c(1,2,3,NA,5, NaN, 7, 8, 9, Inf, 11, 12, -Inf, 14, 15), 5)
> m
     [,1] [,2] [,3]
[1,]    1  NaN   11
[2,]    2    7   12
[3,]    3    8 -Inf
[4,]   NA    9   14
[5,]    5  Inf   15
> NaRV.omit(m)
     [,1] [,2] [,3]
[1,]    2    7   12
attr(,"na.action")
[1] 1 3 4 5
attr(,"class")
[1] "omit"
9
BruceSpencer.Ca

ちょうど別の方法(最初の質問):

m <- structure(c(1, 2, 3, NA, 4, 5, Inf, 5, 6, NaN, 7, 8), 
              .Dim = c(4L, 3L))
#      [,1] [,2] [,3]
# [1,]    1    4    6
# [2,]    2    5  NaN
# [3,]    3  Inf    7
# [4,]   NA    5    8

m[complete.cases(m * 0), , drop=FALSE]
#      [,1] [,2] [,3]
# [1,]    1    4    6

第二部についてのマシューの答え以外には何も考えられません。

3
Arun