順序付けと樹状図のないヒートマップ

Question

2列100万行のファイルがあります!!データを注文したので、注文せずにプロットしたいだけです。樹状図や並べ替えを行わずに、heatmap.2を使用してヒートマップを作成するにはどうすればよいですか？

使うとき

heatmap.2(x, dendrogram="none")

Error: cannot allocate vector of size 4660.6 Gb

だが

"Rowv"なしで試しました

heatmap.2(x, Rowv=FALSE) 

Warning message:
In heatmap.2(x, Rowv = FALSE) :
  Discrepancy: Rowv is FALSE, while dendrogram is `column'. Omitting row dendogram.

Answer 1

私はあなたがそこに両方の​​議論を持っていると思います、あなたはそれらをまとめる必要があります。

# Generate some sample data.
n<-1e6*2
m<-matrix(rnorm(n),ncol=2)
# Plot heatmap without reordering or dendrogram.
heatmap.2(m,dendrogram='none', Rowv=FALSE, Colv=FALSE,trace='none')

このような大量のデータをプロットすることがいつ役立つか想像するのは難しいですが、おそらくあなたは何かを考えています。