Stargazerは、lm(およびその他の)オブジェクト用の非常に優れたラテックステーブルを作成します。最尤法でモデルを近似したとします。スターゲイザーに見積もり用のlmのようなテーブルを作成してもらいたいのですが。これどうやってするの?
少しハッキーですが、1つの方法は、私の見積もりを含む「偽の」lmオブジェクトを作成することかもしれません。summary(my.fake.lm.object)が機能する限り、これは機能すると思います。それは簡単に実行できますか?
例:
library(stargazer)
N <- 200
df <- data.frame(x=runif(N, 0, 50))
df$y <- 10 + 2 * df$x + 4 * rt(N, 4) # True params
plot(df$x, df$y)
model1 <- lm(y ~ x, data=df)
stargazer(model1, title="A Model") # I'd like to produce a similar table for the model below
ll <- function(params) {
## Log likelihood for y ~ x + student's t errors
params <- as.list(params)
return(sum(dt((df$y - params$const - params$beta*df$x) / params$scale, df=params$degrees.freedom, log=TRUE) -
log(params$scale)))
}
model2 <- optim(par=c(const=5, beta=1, scale=3, degrees.freedom=5), lower=c(-Inf, -Inf, 0.1, 0.1),
fn=ll, method="L-BFGS-B", control=list(fnscale=-1), hessian=TRUE)
model2.coefs <- data.frame(coefficient=names(model2$par), value=as.numeric(model2$par),
se=as.numeric(sqrt(diag(solve(-model2$hessian)))))
stargazer(model2.coefs, title="Another Model", summary=FALSE) # Works, but how can I mimic what stargazer does with lm objects?
より正確に言うと、lmオブジェクトを使用すると、stargazerはテーブルの上部に従属変数を適切に出力し、対応する推定値の下の括弧内にSEを含め、テーブルの下部にR ^ 2と観測数を示します。上記のように最尤法で推定された「カスタム」モデルで同じ動作を取得する(簡単な)方法はありますか?
最適な出力をlmオブジェクトとしてドレスアップするための私の微妙な試みは次のとおりです。
model2.lm <- list() # Mimic an lm object
class(model2.lm) <- c(class(model2.lm), "lm")
model2.lm$rank <- model1$rank # Problematic?
model2.lm$coefficients <- model2$par
names(model2.lm$coefficients)[1:2] <- names(model1$coefficients)
model2.lm$fitted.values <- model2$par["const"] + model2$par["beta"]*df$x
model2.lm$residuals <- df$y - model2.lm$fitted.values
model2.lm$model <- df
model2.lm$terms <- model1$terms # Problematic?
summary(model2.lm) # Not working
私はちょうどこの問題を抱えていて、stargazer内のcoef
se
およびomit
関数を使用してこれを克服しました...例:.
stargazer(regressions, ...
coef = list(... list of coefs...),
se = list(... list of standard errors...),
omit = c(sequence),
covariate.labels = c("new names"),
dep.var.labels.include = FALSE,
notes.append=FALSE), file="")
最初にダミーのlm
オブジェクトをインスタンス化し、次にそれをドレスアップする必要があります。
#...
model2.lm = lm(y ~ ., data.frame(y=runif(5), beta=runif(5), scale=runif(5), degrees.freedom=runif(5)))
model2.lm$coefficients <- model2$par
model2.lm$fitted.values <- model2$par["const"] + model2$par["beta"]*df$x
model2.lm$residuals <- df$y - model2.lm$fitted.values
stargazer(model2.lm, se = list(model2.coefs$se), summary=FALSE, type='text')
# ===============================================
# Dependent variable:
# ---------------------------
# y
# -----------------------------------------------
# const 10.127***
# (0.680)
#
# beta 1.995***
# (0.024)
#
# scale 3.836***
# (0.393)
#
# degrees.freedom 3.682***
# (1.187)
#
# -----------------------------------------------
# Observations 200
# R2 0.965
# Adjusted R2 0.858
# Residual Std. Error 75.581 (df = 1)
# F Statistic 9.076 (df = 3; 1)
# ===============================================
# Note: *p<0.1; **p<0.05; ***p<0.01
(そしてもちろん、残りの要約統計量が正しいことを確認してください)
スターゲイザーの使用にどれだけ熱心に取り組んでいるかはわかりませんが、ほうきとxtableパッケージを使用してみることができます。問題は、最適モデルの標準エラーが表示されないことです。
library(broom)
library(xtable)
xtable(tidy(model1))
xtable(tidy(model2))