summarise
のplyr
関数でddply
を使用すると、空のカテゴリはデフォルトで削除されます。 .drop = FALSE
を追加して、この動作を変更できます。ただし、summarise
をdplyr
と共に使用する場合、これは機能しません。結果に空のカテゴリを保持する別の方法はありますか?
偽データの例を次に示します。
library(dplyr)
df = data.frame(a=rep(1:3,4), b=rep(1:2,6))
# Now add an extra level to df$b that has no corresponding value in df$a
df$b = factor(df$b, levels=1:3)
# Summarise with plyr, keeping categories with a count of zero
plyr::ddply(df, "b", summarise, count_a=length(a), .drop=FALSE)
b count_a
1 1 6
2 2 6
3 3 0
# Now try it with dplyr
df %.%
group_by(b) %.%
summarise(count_a=length(a), .drop=FALSE)
b count_a .drop
1 1 6 FALSE
2 2 6 FALSE
まさに私が望んでいたものではありません。 dplyr
の.drop=FALSE
と同じ結果を得るためのplyr
メソッドはありますか?
dplyr 0.8group_by
が、あなたが要求したことだけを行う.drop
引数を取得したため:
df = data.frame(a=rep(1:3,4), b=rep(1:2,6))
df$b = factor(df$b, levels=1:3)
df %>%
group_by(b, .drop=FALSE) %>%
summarise(count_a=length(a))
#> # A tibble: 3 x 2
#> b count_a
#> <fct> <int>
#> 1 1 6
#> 2 2 6
#> 3 3 0
@ Moody_Mudskipper's answerに追加する注意事項:.drop=FALSE
を使用すると、1つ以上のグループ化変数が因子としてコード化されていない場合に予期しない結果が生じる可能性があります。以下の例を参照してください。
library(dplyr)
data(iris)
# Add an additional level to Species
iris$Species = factor(iris$Species, levels=c(levels(iris$Species), "empty_level"))
# Species is a factor and empty groups are included in the output
iris %>% group_by(Species, .drop=FALSE) %>% tally
#> Species n
#> 1 setosa 50
#> 2 versicolor 50
#> 3 virginica 50
#> 4 empty_level 0
# Add character column
iris$group2 = c(rep(c("A","B"), 50), rep(c("B","C"), each=25))
# Empty groups involving combinations of Species and group2 are not included in output
iris %>% group_by(Species, group2, .drop=FALSE) %>% tally
#> Species group2 n
#> 1 setosa A 25
#> 2 setosa B 25
#> 3 versicolor A 25
#> 4 versicolor B 25
#> 5 virginica B 25
#> 6 virginica C 25
#> 7 empty_level <NA> 0
# Turn group2 into a factor
iris$group2 = factor(iris$group2)
# Now all possible combinations of Species and group2 are included in the output,
# whether present in the data or not
iris %>% group_by(Species, group2, .drop=FALSE) %>% tally
#> Species group2 n
#> 1 setosa A 25
#> 2 setosa B 25
#> 3 setosa C 0
#> 4 versicolor A 25
#> 5 versicolor B 25
#> 6 versicolor C 0
#> 7 virginica A 0
#> 8 virginica B 25
#> 9 virginica C 25
#> 10 empty_level A 0
#> 11 empty_level B 0
#> 12 empty_level C 0
Created on 2019-03-13 by the reprex package (v0.2.1)
問題はまだ開いていますが、その間、特にデータがすでにファクタリングされているため、「tidyr」のcomplete
を使用して、探しているものを取得できます。
library(tidyr)
df %>%
group_by(b) %>%
summarise(count_a=length(a)) %>%
complete(b)
# Source: local data frame [3 x 2]
#
# b count_a
# (fctr) (int)
# 1 1 6
# 2 2 6
# 3 3 NA
置換値をゼロにしたい場合は、fill
でそれを指定する必要があります。
df %>%
group_by(b) %>%
summarise(count_a=length(a)) %>%
complete(b, fill = list(count_a = 0))
# Source: local data frame [3 x 2]
#
# b count_a
# (fctr) (dbl)
# 1 1 6
# 2 2 6
# 3 3 0
これは質問で尋ねられたものとまったく同じではありませんが、少なくともこの単純な例では、xtabsを使用して同じ結果を得ることができます。たとえば:
dplyrを使用:
df %>%
xtabs(formula = ~ b) %>%
as.data.frame()
以下:
as.data.frame(xtabs( ~ b, df))
結果(両方の場合に等しい):
b Freq
1 1 6
2 2 6
3 3 0