GitHubでRパッケージを作成しています LW1949 、これはGitHubで別のRパッケージ jvamisc に依存しています。を使用してLW1949をインストールしようとすると
_require(devtools)
devtools::install_github("user/LW1949")
_
「_Skipping 1 packages not available: jvamisc
_」というメッセージが表示されます。
この依存関係を見つけるために、LW1949パッケージ(NAMESPACE内)のimport(jvamisc)
部分をCRANではなくGithubにポイントするにはどうすればよいですか?
確かにこの質問は以前に尋ねられ、回答されたものですが、私はそれを検索することに成功しませんでした(おそらく、検索用語が非常に一般的である-R、パッケージ、GitHubなど)。私は Travis CI と Packrat を偶然見つけました。どちらも使用していません。彼らが役立つかどうかはわかりません。できるだけ簡単な修正をしたいと思います。 (みんなじゃないの?)
R Studioバージョン0.98.1103でRバージョン3.1.3 for Windowsを使用しています。
この質問はごく最近回答されたようで、devtoolsのgithubリポジトリの this issue で対処されています。
パッケージ開発者のPOV:
1)する:
devtools::use_package("jvamisc")
devtools::document()
依存関係をDESCRIPTIONファイルのImports
フィールドに追加します。
2)DESCRIPTIONファイルにフィールド「Remotes:」を手動で追加し、github Rでパッケージを探す場所を指定します。
#in DESCRIPTION
Imports: ...,
jvamisc,
...
Remotes: JVAdams/jvamisc
エンドユーザーPOV:
1)エンドユーザーはdevtoolsの最新の開発バージョン(または少なくともcommit#f21ca3516cに対応するもの)を持っている必要があります。どういうわけか、彼にdevtoolsのバージョンを更新するように「強制」する必要があります(インストール手順にこれを入れただけだと思います...これ以上の方法は考えられません)
devtools::install_github(“hadley/devtools”, ref = “f21ca3516c”)
2)devtoolsパッケージをアンロード/再ロードしたときにRセッションを再起動します
3)通常のinstall_githubを実行します
require(devtools)
devtools::install_github("user/LW1949")
この機能は遅かれ早かれdevtoolsのCRANバージョンに追加されるので、ユーザーがdevバージョンをフェッチする必要はなく、直接ステップ3)に進みます。
手順と追加オプションの詳細は this vignette にあります
実際の解決策はDESCRIPTIONファイルに次の行を追加するようです
Remotes: hadley/testthat
devtoolsのドキュメントを参照してください:
# Git
Remotes: git::https://github.com/hadley/ggplot2.git
# Bitbucket
Remotes: bitbucket::sulab/mygene.r@default, dannavarro/lsr-package
# Bioconductor
Remotes: bioc::3.3/SummarizedExperiment#117513, bioc::release/Biobase
# SVN
Remotes: svn::https://github.com/hadley/stringr
# URL
Remotes: url::https://github.com/hadley/stringr/archive/master.Zip
# Local
Remotes: local::/pkgs/testthat
# Gitorious
Remotes: gitorious::r-mpc-package/r-mpc-package