xtable
を使用してデータフレームをテーブル形式で印刷するようにknitrしようとしています:
```{r xtable,fig.width=10, fig.height=8, message=FALSE, results = 'asis', echo=FALSE, warning=FALSE, fig.cap='long caption', fig.scap='short',tidy=FALSE}
print(xtable(d),format="markdown")
```
これはデータフレームd
です:
d <- structure(list(Hostname = structure(c(8L, 8L, 9L, 5L, 6L, 7L,
1L, 2L, 3L, 4L), .Label = c("db01", "db02", "farm01", "farm02",
"tom01", "tom02", "tom03", "web01", "web03"), class = "factor"),
Date = structure(c(6L, 10L, 5L, 3L, 2L, 1L, 8L, 9L, 7L, 4L
), .Label = c("10/5/2015 1:15", "10/5/2015 1:30", "10/5/2015 2:15",
"10/5/2015 4:30", "10/5/2015 8:30", "10/5/2015 8:45", "10/6/2015 8:15",
"10/6/2015 8:30", "9/11/2015 5:00", "9/11/2015 6:00"), class = "factor"),
Cpubusy = c(31L, 20L, 30L, 20L, 18L, 20L, 41L, 21L, 29L,
24L), UsedPercentMemory = c(99L, 98L, 95L, 99L, 99L, 99L,
99L, 98L, 63L, 99L)), .Names = c("Hostname", "Date", "Cpubusy",
"UsedPercentMemory"), class = "data.frame", row.names = c(NA,
-10L))
私がここで見逃しているアイデアはありますか?
Pierreのソリューションは機能しますが、これは理想的には自動的に行われるはずです。幸いなことに、これを機能させるためにニットフックを使用することができます。
つまり、次のコードが与えられます。
```{r}
d
```
Knitrは、フォーマット関数を手動で呼び出さなくても、適切にフォーマットされたテーブルを自動的に生成する必要があります。
これが私がそのために使用しているいくつかのコードです。これをknitrドキュメントの先頭に配置する必要がありますまたはドキュメントをコンパイルするコードに:
opts_chunk$set(render = function (object, ...) {
if (pander_supported(object))
pander(object, style = 'rmarkdown')
else if (isS4(object))
show(object)
else
print(object)
})
これはpander
を使用し、さらにヘルパー関数pander_supported
を必要とします。
library(pander)
pander_supported = function (object)
UseMethod('pander_supported')
pander_supported.default = function (object)
any(class(object) %in% sub('^pander\\.', '', methods('pander')))
pander.table = function (x, ...)
pander(`rownames<-`(rbind(x), NULL), ...)
より良いフォーマットのために、私はこれらのデフォルトも使用します:
panderOptions('table.split.table', Inf)
panderOptions('table.alignment.default',
function (df) ifelse(sapply(df, is.numeric), 'right', 'left'))
panderOptions('table.alignment.rownames', 'left')