R Markdownの新しいバージョンはpandocに基づいているため、出力形式を簡単に変更できます。
私の問題は、たとえばからマークダウン形式のテーブルを取得することです。 LATEXテーブルとHTMLテーブルはpandoc変換に耐えられないため、回帰モデル。
さまざまなモデル(stargazer、texreg、asprtable ...)からLATEX/HTML出力を生成するパッケージを知っており、他のオブジェクトからではなく、データフレームとマトリックスからマークダウンテーブルを生成する関数/パッケージを知っています。
助言がありますか?
私の コメントの上 詳細:
再現可能な例のいくつかのモデルを定義します。
lm0 <- lm(hp ~ wt, mtcars)
lm1 <- lm(qsec ~ hp, mtcars)
lm2 <- lm(qsec ~ wt, mtcars)
それらから比較表を作成します。
require(memisc)
mtable123 <- mtable('Model 1' = lm0,
'Model 2' = lm1,
'Model 3' = lm2,
summary.stats = c('R-squared','F','p','N'))
pander
を呼び出すだけで、マークダウンテーブルをレンダリングします。
pander(mtable123)
結果をお楽しみください:
--------------------------------------------------
Model 1 Model 2 Model 3
----------------- ---------- ---------- ----------
**(Intercept)** -1.821\ 20.556***\ 18.875***\
(32.325) (0.542) (1.103)
**wt** 46.160***\ \ -0.319\
(9.625) (0.328)
**hp** \ -0.018***\ \
(0.003)
**R-squared** 0.434 0.502 0.031
**F** 22.999 30.190 0.945
**p** 0.000 0.000 0.339
**N** 32 32 32
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Roman Tsegelskyi GSoC 2014でこの素晴らしい機能を実装していただきありがとうございます。
HTMLまたはLATEXテーブルを生成するだけです。コードチャンクにresults = 'asis'を追加するだけです。出力はそのままになります。
たとえば、xtableを使用するこのコードは私にとってはうまくいきます。
```{r,results='asis'}
x<-rnorm(100)
y<-rnorm(100)
lm <- lm(y~x)
library(xtable)
print(xtable(summary(lm)),type='html')
```
SjPlot(回帰出力を簡単に表示するための優れたライブラリ)を使用する別の方法は、no.output機能を使用することです。
library(sjmisc)
library(sjPlot)
library(magrittr)
lm(qsec ~ wt, mtcars) %>%
sjt.lm(no.output = TRUE, show.se = TRUE) %>%
return() %>% .[["knitr"]] %>% asis_output
Huxtableパッケージは、適切にフォーマットされた回帰表を出力できるようになりました。ドキュメントを参照してください https://hughjonesd.github.io/huxtable/huxreg.html
私はこれを、人気のある(そして新しい)knitrおよびkableExtraパッケージを使用する例で更新しています。
library(knitr)
library(xtable)
lm(hp ~ wt, mtcars) %>%
summary() %>%
xtable() %>%
kable()
これで、Hao Zhuの kableExtra パッケージで利用できるすべてのクールな表フォーマット機能にアクセスできます。