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Rの関数のソースコードを表示

lmまたはclass::knnを使用してソースコードを表示できますが、princompのコードを表示できませんでした。この関数（または他の何か）はRで書かれたものでしたか、それとも他のバイトコードが使用されましたか？ パッケージ内のS4関数のソースコードを表示するにはどうすればよいですか？ のアドバイスを使用しても、ソースコードを見つけることができませんでした。助けてくれてありがとう。

> princomp
function (x, ...) 
UseMethod("princomp")
<bytecode: 0x9490010>
<environment: namespace:stats>
ropen-sourcestatisticsmachine-learning
17
schemacs

関数によって使用される対応するメソッドを使用して尋ねる必要があります。これを試して：

princomp # this is what you did without having a good enough answer
methods(princomp) # Next step, ask for the method: 'princomp.default'
getAnywhere('princomp.default') # this will show you the code

あなたが探しているコードは：

function (x, cor = FALSE, scores = TRUE, covmat = NULL, subset = rep(TRUE, 
    nrow(as.matrix(x))), ...) 
{
    cl <- match.call()
    cl[[1L]] <- as.name("princomp")
    if (!missing(x) && !missing(covmat)) 
        warning("both 'x' and 'covmat' were supplied: 'x' will be ignored")
    z <- if (!missing(x)) 
        as.matrix(x)[subset, , drop = FALSE]
    if (is.list(covmat)) {
        if (any(is.na(match(c("cov", "n.obs"), names(covmat))))) 
            stop("'covmat' is not a valid covariance list")
        cv <- covmat$cov
        n.obs <- covmat$n.obs
        cen <- covmat$center
    }
    else if (is.matrix(covmat)) {
        cv <- covmat
        n.obs <- NA
        cen <- NULL
    }
    else if (is.null(covmat)) {
        dn <- dim(z)
        if (dn[1L] < dn[2L]) 
            stop("'princomp' can only be used with more units than variables")
        covmat <- cov.wt(z)
        n.obs <- covmat$n.obs
        cv <- covmat$cov * (1 - 1/n.obs)
        cen <- covmat$center
    }
    else stop("'covmat' is of unknown type")
    if (!is.numeric(cv)) 
        stop("PCA applies only to numerical variables")
    if (cor) {
        sds <- sqrt(diag(cv))
        if (any(sds == 0)) 
            stop("cannot use cor=TRUE with a constant variable")
        cv <- cv/(sds %o% sds)
    }
    edc <- eigen(cv, symmetric = TRUE)
    ev <- edc$values
    if (any(neg <- ev < 0)) {
        if (any(ev[neg] < -9 * .Machine$double.eps * ev[1L])) 
            stop("covariance matrix is not non-negative definite")
        else ev[neg] <- 0
    }
    cn <- paste("Comp.", 1L:ncol(cv), sep = "")
    names(ev) <- cn
    dimnames(edc$vectors) <- if (missing(x)) 
        list(dimnames(cv)[[2L]], cn)
    else list(dimnames(x)[[2L]], cn)
    sdev <- sqrt(ev)
    sc <- if (cor) 
        sds
    else rep(1, ncol(cv))
    names(sc) <- colnames(cv)
    scr <- if (scores && !missing(x) && !is.null(cen)) 
        scale(z, center = cen, scale = sc) %*% edc$vectors
    if (is.null(cen)) 
        cen <- rep(NA_real_, nrow(cv))
    edc <- list(sdev = sdev, loadings = structure(edc$vectors, 
        class = "loadings"), center = cen, scale = sc, n.obs = n.obs, 
        scores = scr, call = cl)
    class(edc) <- "princomp"
    edc
}
<environment: namespace:stats>

これはあなたが求めていたものだと思います。

37
Jilber Urbina
> stats:::princomp.default

私はこれにそれを見つけました： Rのソースコードを表示

5
schemacs