web-dev-qa-db-ja.com

Rオブジェクトが関数または「for」ループで印刷されないのはなぜですか？

Dddという名前のR行列があります。これを入力すると、すべてが正常に機能します。

i <- 1
shapiro.test(ddd[,y])
ad.test(ddd[,y]) 
stem(ddd[,y]) 
print(y)

シャピロウィルク、アンダーソンダーリン、およびすべてのステムへの呼び出しは、同じ列を抽出します。

このコードを「for」ループに入れると、Shapiro WilkとAnderson Darlingの呼び出しは機能しなくなりますが、stem＆leafの呼び出しとprintの呼び出しは機能し続けます。

for (y in 7:10) {
    shapiro.test(ddd[,y])
    ad.test(ddd[,y]) 
    stem(ddd[,y]) 
    print(y)
}

The decimal point is 1 digit(s) to the right of the |

  0 | 0
  0 | 899999
  1 | 0

[1] 7

関数を作成しようとすると、同じことが起こります。 SWとADは機能しません。他の呼び出しは行います。

> D <- function (y) {
+ shapiro.test(ddd[,y])
+ ad.test(ddd[,y]) 
+ stem(ddd[,y]) 
+ print(y)  }

> D(9)

  The decimal point is at the |

   9 | 000
   9 | 
  10 | 00000

[1] 9

すべての呼び出しが同じように動作しないのはなぜですか？

rfor-loopprintingr-faq
53
Sal Leggio

関数内にあるため、ループ内で自動印刷はオフになります。出力を表示したい場合は、どちらの場合も明示的にprintする必要があります。 [1] 9を取得しているのは、yの値を明示的に出力しているためです。

これを行うことを検討する方法の例を次に示します。

> DF <- data.frame(A = rnorm(100), B = rlnorm(100))
> y <- 1
> shapiro.test(DF[,y])

    Shapiro-Wilk normality test

data:  DF[, y] 
W = 0.9891, p-value = 0.5895

したがって、自動印刷が可能です。ループでは、これを行う必要があります。

for(y in 1:2) {
    print(shapiro.test(DF[,y]))
}

さらにテストを出力する場合は、ループ内に追加の行として追加するだけです。

for(y in 1:2) {
    writeLines(paste("Shapiro Wilks Test for column", y))
    print(shapiro.test(DF[,y]))
    writeLines(paste("Anderson Darling Test for column", y))
    print(ad.test(DF[,y]))
}

しかし、大量の出力を読むのが好きでない限り、それはあまり魅力的ではありません。代わりに、フィットしたテストオブジェクトを保存してから印刷して調査し、テスト統計とp値をテーブルに集約するように処理することもできます。ループを使用してそれを行うことができます。

## object of save fitted objects in
obj <- vector(mode = "list", length = 2)
## loop
for(y in seq_along(obj)) {
    obj[[y]] <- shapiro.test(DF[,y])
}

次に、以下を使用してモデルを見ることができます

> obj[[1]]

    Shapiro-Wilk normality test

data:  DF[, y] 
W = 0.9891, p-value = 0.5895

たとえば、またはlapplyを使用して、結果を保存するために使用するオブジェクトを設定します。

> obj2 <- lapply(DF, shapiro.test)
> obj2[[1]]

    Shapiro-Wilk normality test

data:  X[[1L]] 
W = 0.9891, p-value = 0.5895

Wおよびp-valueデータを抽出したい場合、すべての結果を格納するオブジェクトを処理して、必要なビットを抽出できます。

> tab <- t(sapply(obj2, function(x) c(x$statistic, x$p.value)))
> colnames(tab) <- c("W", "p.value")
> tab
          W      p.value
A 0.9890621 5.894563e-01
B 0.4589731 1.754559e-17

または、重要な星を好む人：

> tab2 <- lapply(obj2, function(x) c(W = unname(x$statistic), 
+                                    `p.value` = x$p.value))
> tab2 <- data.frame(do.call(rbind, tab2))
> printCoefmat(tab2, has.Pvalue = TRUE)
       W p.value    
A 0.9891  0.5895    
B 0.4590  <2e-16 ***
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

これは、画面に出力を送信するよりも優れている必要があります。

56
Gavin Simpson

新しい答えではありませんが、上記に加えて、「flush.console（）」は、ループの後ではなく、強制的に印刷を実行するために必要です。ループ中にprint（）を使用する唯一の理由は、たとえば、多くのファイルの読み取りの進行状況を表示することです。

for (i in 1:10) {
  print(i)
  flush.console()
  for(j in 1:100000)
    k <- 0
}
37
J. Win.

Gavin Simpsonからの素晴らしい回答。私は魔法の最後のビットを取り、それを機能に変えました。

sw.df <- function ( data ) { 
   obj <- lapply(data, shapiro.test)
   tab <- lapply(obj, function(x) c(W = unname(x$statistic), `p.value` = x$p.value))
   tab <- data.frame(do.call(rbind, tab))
   printCoefmat(tab, has.Pvalue = TRUE)
}

次に、データフレームsw.df（df）で呼び出すことができます。

そして、変換を試してみたい場合：sw.df（log（df））

5
Rolando