ビーガンを使用してRでrdaを実行したい。
私のコードは次のようになります:
species<- read.delim("springspecies1.txt", header=T)
envdata<- read.delim("springenv1.txt", header=T)
RDA <- rda(species~Temperature + Salinity + O2 + Phosphate + Nitrate + Silica, envdata, scale=T, na.action=na.omit)
そして私はエラーメッセージを受け取ります:
Error in colMeans(x, na.rm = TRUE) : 'x' must be numeric
私が私のデータをチェックするとき、私は得ます:
sapply(species, mode)
Station Year Month S.marinoi C.tripos
"numeric" "numeric" "numeric" "numeric" "numeric"
P.alata P.seriata R.setigera C.pelagica D.confervacea
"numeric" "numeric" "numeric" "numeric" "numeric"
C.decipiens P.farcimen C.furca
"numeric" "numeric" "numeric"
データセットにNAまたは空白がありません。しかし、種のデータセットが問題のようです。種を使用して新しいデータセットをコンパイルしましたが、同じ問題が再び発生します。何か案は?
「モード」を使用する代わりに、「クラス」でテストする必要があります。おそらく因子列があります。これらは数値モードですが、「is.numeric」でFALSEをテストします。