Rstudioでコンパイルしようとしている次のドキュメントがあります。
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title:
shorttitle:
author:
bibliography:
- library.bib
output: papaja::apa6_pdf
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```{r message = FALSE, warning = FALSE}
library("papaja")
apa_prepare_doc() # Prepare document for rendering
```
# Introduction
@Bakan1966
# References
```{r create_r-references}
r_refs(file = "r-references.bib")
```
Knitを実行すると、.mdファイルがコンパイルされますが、pandocでエラーが発生します。
pandoc-citeproc: "stdin" (line 232, column 2):
unexpected "a"
expecting "c", "C", "p", "P", "s" or "S"
pandoc: Error running filter /Applications/RStudio.app/Contents/MacOS/pandoc/pandoc-citeproc
Error: pandoc document conversion failed with error 83
In addition: Warning messages:
1: In yaml::yaml.load(enc2utf8(string), ...) :
NAs introduced by coercion: 1,2,3 is not an integer
2: In yaml::yaml.load(enc2utf8(string), ...) :
NAs introduced by coercion: 1,2,3 is not an integer
Execution halted
周りのさまざまなトピックで同様の問題を見つけましたが、提案された解決策はどれもうまくいきませんでした...
「解決済み」。
私のlibrary.bibファイルに問題があります。
私はMendeleyを使用して生成しました。これは、pandoc-citeprocでサポートされていない多くの特殊文字を挿入しています...
これはpandoc-citeprocの問題である可能性があります。診断するには、_rmarkdown::render
_を手動で実行します。例:rmarkdown::render(output_format = "html_document", input = your_vignette, clean = FALSE)
私の場合、ビネットのYAMLヘッダーの_.bib
_行に_bibliography: bibfile
_を追加する必要がありました。
HTMLファイルをレンダリングするときに同じエラーに直面しましたが、私の問題の解決策は異なりました。
YAMLヘッダーでcsl: nature.csl
を指定しました。私が知らなかったことは、nature.csl
ファイルもダウンロードして、YAMLヘッダーでそのファイルへのパスを指定する必要があるということでした。だから、代わりに:
bibliography: references/library.bib
csl: nature.csl
nature.csl
ファイルをダウンロードし、library.bib
と同じフォルダに入れました。正しいYAMLヘッダーは次のようになります
bibliography: references/library.bib
csl: references/nature.csl
arules::apriori()
を適用するrmarkdownファイルを編成すると、エラー83が発生しました。
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title: "[**Pattern Discovery in Data Mining** *Programming Assignment: Frequent Itemset Mining Using Apriori*](https://www.coursera.org/learn/data-patterns)"
subtitle: "[**Data Mining** *by University of Illinois at Urbana-Champaign*](https://www.coursera.org/specializations/data-mining)"
author: "[®γσ, Eng Lian Hu](http://englianhu.wordpress.com) <img src='figure/ShirotoNorimichi2.jpg' width='24'> 白戸則道®"
date: "`r Sys.Date()`"
output:
tufte::tufte_html:
toc: yes
tufte::tufte_handout:
citation_package: natbib
latex_engine: xelatex
tufte::tufte_book:
citation_package: natbib
latex_engine: xelatex
bibliography: skeleton.bib
link-citations: yes
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行を削除した後、正常に動作します:bibliography: skeleton.bib
。
Macを使用している場合は、ターミナルを開いて次のように入力します。
brew install pandoc-citeproc
または
brew upgrade pandoc-citeproc
機能しない場合は、pandoc-citeprocの特定の機能しているバージョンにダウングレードする必要があります。