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write.tableは、行名があるときにヘッダーに不要な先頭の空の列を書き込みます

この例を確認してください：

_> a = matrix(1:9, nrow = 3, ncol = 3, dimnames = list(LETTERS[1:3], LETTERS[1:3]))
> a
  A B C
A 1 4 7
B 2 5 8
C 3 6 9
_

テーブルが正しく表示されます。ファイルに書き込むには2つの異なる方法があります...

write.csv(a, 'a.csv')これは予想通りに与えます：

_"","A","B","C"
"A",1,4,7
"B",2,5,8
"C",3,6,9
_

write.table(a, 'a.txt')ねじ込みます

_"A" "B" "C"
"A" 1 4 7
"B" 2 5 8
"C" 3 6 9
_

確かに、空のタブがありません..。これはバグですか、それとも機能ですか？回避策はありますか？ （write.table(cbind(rownames(a), a), 'a.txt', row.names=FALSE以外）

乾杯、ヤニック

rexport-to-csvwrite.table
80
Yannick Wurm

引用?write.table、セクションCSVファイル：

デフォルトでは、行名の列には列名はありません。 col.names = NAおよびrow.names = TRUE空白の列名が追加されます。これは、スプレッドシートで読み込まれるCSVファイルに使用される規則です。

だからあなたはしなければならない

write.table(a, 'a.txt', col.names=NA)

そしてあなたは得る

"" "A" "B" "C"
"A" 1 4 7
"B" 2 5 8
"C" 3 6 9
123
Marek

@Marekへの非常に役立つ回答を少し変更すると、rownames列にヘッダーが追加されます。data.frameの最初の列としてrownamesを一時的に追加し、実際のrownamesを無視して書き込みます。

> a = matrix(1:9, nrow = 3, ncol = 3, dimnames = list(LETTERS[1:3], LETTERS[1:3]))
> write.table(data.frame("H"=rownames(a),a),"a.txt", row.names=FALSE)

そしてあなたは得る

"H" "A" "B" "C"
"A" 1 4 7
"B" 2 5 8
"C" 3 6 9
6
rusalkaguy

tidyverse （dplyrなど）で作業している場合は、 tibble パッケージのrownames_to_column()関数を使用して、row.namesを簡単に変換できます。列、たとえば：

_library('tibble')
a = as.data.frame(matrix(1:9, nrow=3, ncol=3, 
                  dimnames=list(LETTERS[1:3], LETTERS[1:3])))

a %>% rownames_to_column('my_id')

  my_id A B C
1     A 1 4 7
2     B 2 5 8
3     C 3 6 9
_

これをwrite.table()の_row.names=FALSE_オプションと組み合わせると、すべての列のヘッダー名が出力されます。

3
Keith Hughitt

write.table()で行列を保存するときに同じ問題が発生し、row.names列を保持したい場合、実際には非常に簡単な解決策があります。

 write.table(matrix,file="file.csv",quote=F,sep=";", row.names=T
             col.names=c("row_name_col;val1_col","val2_col"))

それを行うことで、基本的にwrite.table関数は、row.names列のヘッダーラベルを作成します。結果の.csvファイルは次のようになります。

row_name_col;val1_col;val2_col
row1;1;4 
row2;2;5 
row3;3;6
1
Landry BETE

接続を使用して柔軟性を追加する@mnelの単純な関数を修正しました。関数は次のとおりです。

my.write <- function(x, file, header, f = write.csv, ...){
# create and open the file connection
datafile <- file(file, open = 'wt')
# close on exit 
on.exit(close(datafile))
# if a header is defined, write it to the file (@CarlWitthoft's suggestion)
if(!missing(header)) {
writeLines(header,con=datafile, sep='\t')
writeLines('', con=datafile, sep='\n')
}
# write the file using the defined function and required addition arguments  
f(x, datafile,...)
}

関数を「write.table」、「write.csv」、「write.delim」などに指定できます。

乾杯！

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yuanhangliu1