文字列と正規表現を受け取る関数を書く必要があります。一致があるかどうかを確認し、一致の開始位置と終了位置を返す必要があります。 (正規表現はすでにqr//
によってコンパイルされています。)
関数は「グローバル」フラグも受け取る可能性があり、すべての一致の(開始、終了)ペアを返す必要があります。
ユーザーが()
と()
を使用する可能性があるため、正規表現を変更することはできず、その周りに\1
を追加することもできません。多分私は(?:)
を使うことができます。
例:「ababab」と正規表現qr/ab/
が与えられた場合、グローバルの場合、(開始、終了)の3つのペアを取得する必要があります。
組み込み変数@-
および@+
は、最後に成功した一致の開始位置と終了位置をそれぞれ保持します。 $-[0]
および$+[0]
はパターン全体に対応し、$-[N]
および$+[N]
は$N
($1
、$2
などに対応します。 。)サブマッチ。
私の以前の投稿を忘れて、私はより良い考えを持っています。
sub match_positions {
my ($regex, $string) = @_;
return if not $string =~ /$regex/;
return ($-[0], $+[0]);
}
sub match_all_positions {
my ($regex, $string) = @_;
my @ret;
while ($string =~ /$regex/g) {
Push @ret, [ $-[0], $+[0] ];
}
return @ret
}
この手法は、正規表現をまったく変更しません。
追加するように編集:$ 1 .. $ 9でperlvarから引用する"これらの変数はすべて読み取り専用で、現在のBLOCKに動的にスコープされます。"つまり、$ 1 .. $ 9を使用する場合、サブルーチンを使用して照合を行うことはできません。
Pos関数は、マッチの位置を示します。正規表現を括弧で囲んだ場合、length $1
を使用して長さ(つまり、末尾)を取得できます。このような
sub match_positions {
my ($regex, $string) = @_;
return if not $string =~ /($regex)/;
return (pos($string), pos($string) + length $1);
}
sub all_match_positions {
my ($regex, $string) = @_;
my @ret;
while ($string =~ /($regex)/g) {
Push @ret, [pos($string), pos($string) + length $1];
}
return @ret
}
#!/usr/bin/Perl
# search the postions for the CpGs in human genome
sub match_positions {
my ($regex, $string) = @_;
return if not $string =~ /($regex)/;
return (pos($string), pos($string) + length $1);
}
sub all_match_positions {
my ($regex, $string) = @_;
my @ret;
while ($string =~ /($regex)/g) {
Push @ret, [(pos($string)-length $1),pos($string)-1];
}
return @ret
}
my $regex='CG';
my $string="ACGACGCGCGCG";
my $cgap=3;
my @pos=all_match_positions($regex,$string);
my @hgcg;
foreach my $pos(@pos){
Push @hgcg,@$pos[1];
}
foreach my $i(0..($#hgcg-$cgap+1)){
my $len=$hgcg[$i+$cgap-1]-$hgcg[$i]+2;
print "$len\n";
}
プログラム内のすべてのREの実行を遅くしたい場合は、廃止された$ `変数を使用することもできます。 perlvarから:
$‘ The string preceding whatever was matched by the last successful pattern match (not
counting any matches hidden within a BLOCK or eval enclosed by the current BLOCK).
(Mnemonic: "`" often precedes a quoted string.) This variable is read-only.
The use of this variable anywhere in a program imposes a considerable performance penalty
on all regular expression matches. See "BUGS".