私は火花でCSVを読み、それをDataFrameとして変換し、df.registerTempTable("table_name")
を使ってHDFSに保存したいと思います。
scala> val df = sqlContext.load("hdfs:///csv/file/dir/file.csv")
Java.lang.RuntimeException: hdfs:///csv/file/dir/file.csv is not a Parquet file. expected magic number at tail [80, 65, 82, 49] but found [49, 59, 54, 10]
at parquet.hadoop.ParquetFileReader.readFooter(ParquetFileReader.Java:418)
at org.Apache.spark.sql.parquet.ParquetRelation2$MetadataCache$$anonfun$refresh$6.apply(newParquet.scala:277)
at org.Apache.spark.sql.parquet.ParquetRelation2$MetadataCache$$anonfun$refresh$6.apply(newParquet.scala:276)
at scala.collection.parallel.mutable.ParArray$Map.leaf(ParArray.scala:658)
at scala.collection.parallel.Task$$anonfun$tryLeaf$1.apply$mcV$sp(Tasks.scala:54)
at scala.collection.parallel.Task$$anonfun$tryLeaf$1.apply(Tasks.scala:53)
at scala.collection.parallel.Task$$anonfun$tryLeaf$1.apply(Tasks.scala:53)
at scala.collection.parallel.Task$class.tryLeaf(Tasks.scala:56)
at scala.collection.parallel.mutable.ParArray$Map.tryLeaf(ParArray.scala:650)
at scala.collection.parallel.AdaptiveWorkStealingTasks$WrappedTask$class.compute(Tasks.scala:165)
at scala.collection.parallel.AdaptiveWorkStealingForkJoinTasks$WrappedTask.compute(Tasks.scala:514)
at scala.concurrent.forkjoin.RecursiveAction.exec(RecursiveAction.Java:160)
at scala.concurrent.forkjoin.ForkJoinTask.doExec(ForkJoinTask.Java:260)
at scala.concurrent.forkjoin.ForkJoinPool$WorkQueue.runTask(ForkJoinPool.Java:1339)
at scala.concurrent.forkjoin.ForkJoinPool.runWorker(ForkJoinPool.Java:1979)
at scala.concurrent.forkjoin.ForkJoinWorkerThread.run(ForkJoinWorkerThread.Java:107)
Apache SparkでDataFrameとしてCSVファイルをロードするための正しいコマンドは何ですか?
spark-csvはSparkのコア機能の一部であり、別のライブラリを必要としません。だからあなたはちょうど例えばできる
df = spark.read.format("csv").option("header", "true").load("csvfile.csv")
Scalaでは、(これはcsvの場合は "、"、tsvの場合は "\ t"など、フォーマットインの区切り文字に使用できます)val df = sqlContext.read.format("com.databricks.spark.csv") .option("delimiter", ",") .load("csvfile.csv")
最初にSparkSession
オブジェクトを初期化します デフォルトではspark
としてシェルで利用可能になります
val spark = org.Apache.spark.sql.SparkSession.builder
.master("local")
.appName("Spark CSV Reader")
.getOrCreate;
CSVを
DataFrame/DataSet
として読み込むには、以下のいずれかの方法を使用します
val df = spark.read
.format("csv")
.option("header", "true") //first line in file has headers
.option("mode", "DROPMALFORMED")
.load("hdfs:///csv/file/dir/file.csv")
val df = spark.sql("SELECT * FROM csv.`hdfs:///csv/file/dir/file.csv`")
依存関係 :
"org.Apache.spark" % "spark-core_2.11" % 2.0.0,
"org.Apache.spark" % "spark-sql_2.11" % 2.0.0,
val df = sqlContext.read
.format("com.databricks.spark.csv")
.option("header", "true")
.option("mode", "DROPMALFORMED")
.load("csv/file/path");
依存関係
"org.Apache.spark" % "spark-sql_2.10" % 1.6.0,
"com.databricks" % "spark-csv_2.10" % 1.6.0,
"com.univocity" % "univocity-parsers" % LATEST,
それはHadoopが2.6でSparkが1.6で "databricks"パッケージなしのものです。
import org.Apache.spark.sql.types.{StructType,StructField,StringType,IntegerType};
import org.Apache.spark.sql.Row;
val csv = sc.textFile("/path/to/file.csv")
val rows = csv.map(line => line.split(",").map(_.trim))
val header = rows.first
val data = rows.filter(_(0) != header(0))
val rdd = data.map(row => Row(row(0),row(1).toInt))
val schema = new StructType()
.add(StructField("id", StringType, true))
.add(StructField("val", IntegerType, true))
val df = sqlContext.createDataFrame(rdd, schema)
Spark 2.0では、以下はCSVの読み方です。
val conf = new SparkConf().setMaster("local[2]").setAppName("my app")
val sc = new SparkContext(conf)
val sparkSession = SparkSession.builder
.config(conf = conf)
.appName("spark session example")
.getOrCreate()
val path = "/Users/xxx/Downloads/usermsg.csv"
val base_df = sparkSession.read.option("header","true").
csv(path)
Java 1.8では、このコードはCSVファイルを読むために完璧に動作します。
POM.xml
<dependency>
<groupId>org.Apache.spark</groupId>
<artifactId>spark-core_2.11</artifactId>
<version>2.0.0</version>
</dependency>
<!-- https://mvnrepository.com/artifact/org.Apache.spark/spark-sql_2.10 -->
<dependency>
<groupId>org.Apache.spark</groupId>
<artifactId>spark-sql_2.10</artifactId>
<version>2.0.0</version>
</dependency>
<!-- https://mvnrepository.com/artifact/org.scala-lang/scala-library -->
<dependency>
<groupId>org.scala-lang</groupId>
<artifactId>scala-library</artifactId>
<version>2.11.8</version>
</dependency>
<dependency>
<groupId>com.databricks</groupId>
<artifactId>spark-csv_2.10</artifactId>
<version>1.4.0</version>
</dependency>
Java
SparkConf conf = new SparkConf().setAppName("JavaWordCount").setMaster("local");
// create Spark Context
SparkContext context = new SparkContext(conf);
// create spark Session
SparkSession sparkSession = new SparkSession(context);
Dataset<Row> df = sparkSession.read().format("com.databricks.spark.csv").option("header", true).option("inferSchema", true).load("hdfs://localhost:9000/usr/local/hadoop_data/loan_100.csv");
//("hdfs://localhost:9000/usr/local/hadoop_data/loan_100.csv");
System.out.println("========== Print Schema ============");
df.printSchema();
System.out.println("========== Print Data ==============");
df.show();
System.out.println("========== Print title ==============");
df.select("title").show();
Penny's Spark 2の例はspark2でそれをする方法です。もう1つのトリックがあります。オプションinferSchema
をtrue
に設定することによって、データの最初のスキャンを実行することによって、そのヘッダーを生成することです。
ここで、spark
があなたが設定したスパークセッションであると仮定して、S3上のAmazonがホストするすべてのLandsatイメージのCSVインデックスファイルをロードする操作です。
/*
* Licensed to the Apache Software Foundation (ASF) under one or more
* contributor license agreements. See the NOTICE file distributed with
* this work for additional information regarding copyright ownership.
* The ASF licenses this file to You under the Apache License, Version 2.0
* (the "License"); you may not use this file except in compliance with
* the License. You may obtain a copy of the License at
*
* http://www.Apache.org/licenses/LICENSE-2.0
*
* Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
* distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
* WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
* See the License for the specific language governing permissions and
* limitations under the License.
*/
val csvdata = spark.read.options(Map(
"header" -> "true",
"ignoreLeadingWhiteSpace" -> "true",
"ignoreTrailingWhiteSpace" -> "true",
"timestampFormat" -> "yyyy-MM-dd HH:mm:ss.SSSZZZ",
"inferSchema" -> "true",
"mode" -> "FAILFAST"))
.csv("s3a://landsat-pds/scene_list.gz")
悪い知らせは、ファイルをスキャンすることです。この20 MB以上の圧縮CSVファイルのような大きなファイルでは、長距離の接続で30秒かかることがあります。それを心に留めておいてください:スキーマを手に入れたら、手動でスキーマをコーディングするほうが賢明です。
(コードスニペットApache Software License 2.0は、あいまいさを避けるためにライセンスされています。S3統合のデモ/統合テストとして行ったことです)
CSVファイルの解析には多くの課題があります。ファイルサイズが大きい場合、列の値に英語以外の文字、/ escape/separator、その他の文字が含まれていると、解析エラーの原因となる可能性があります。
その魔法は使用されるオプションにあります。私のために働いていて期待しているのは、Edgeのケースのほとんどをカバーするはずです。
### Create a Spark Session
spark = SparkSession.builder.master("local").appName("Classify Urls").getOrCreate()
### Note the options that are used. You may have to Tweak these in case of error
html_df = spark.read.csv(html_csv_file_path,
header=True,
multiLine=True,
ignoreLeadingWhiteSpace=True,
ignoreTrailingWhiteSpace=True,
encoding="UTF-8",
sep=',',
quote='"',
escape='"',
maxColumns=2,
inferSchema=True)
それが役立つことを願っています。 PySpark 2を使ってHTMLソースコードを持つCSVを読む
注:上記のコードはSpark 2 APIからのもので、そこではCSVファイル読み取りAPIがSparkインストール可能の組み込みパッケージにバンドルされています。
注意:PySparkはSparkのPythonラッパーであり、Scala/Javaと同じAPIを共有しています。
CSVファイルをロードして結果をDataFrameとして返します。
df=sparksession.read.option("header", true).csv("file_name.csv")
Dataframeはファイルをcsvフォーマットとして扱いました。
あなたがscala 2.11とApache 2.0以上でjarファイルを作成している場合。
sqlContext
またはsparkContext
オブジェクトを作成する必要はありません。 SparkSession
オブジェクトだけで、すべてのニーズに対する要件を満たすことができます。
以下は、うまく機能するmycodeです。
import org.Apache.spark.sql.{DataFrame, Row, SQLContext, SparkSession}
import org.Apache.log4j.{Level, LogManager, Logger}
object driver {
def main(args: Array[String]) {
val log = LogManager.getRootLogger
log.info("**********JAR EXECUTION STARTED**********")
val spark = SparkSession.builder().master("local").appName("ValidationFrameWork").getOrCreate()
val df = spark.read.format("csv")
.option("header", "true")
.option("delimiter","|")
.option("inferSchema","true")
.load("d:/small_projects/spark/test.pos")
df.show()
}
}
sparkBuilder
オブジェクトを定義しながら、クラスタで実行している場合は.master("local")
を.master("yarn")
に変更するだけです。
Spark Docはこれをカバーします: https://spark.Apache.org/docs/2.2.0/sql-programming-guide.html
spark 2.0+を使用している場合はこれを試してください
For non-hdfs file:
df = spark.read.csv("file:///csvfile.csv")
For hdfs file:
df = spark.read.csv("hdfs:///csvfile.csv")
For hdfs file (with different delimiter than comma:
df = spark.read.option("delimiter","|")csv("hdfs:///csvfile.csv")
注:-これは、区切り記号付きファイルに対して機能します。 option(“ delimiter”、)を使用して値を変更します。
これが役に立てば幸いです。
デフォルトのファイル形式は、spark.readを持つParquetとcsvを使ったファイル形式で、例外が発生します。使用しようとしているAPIでcsv形式を指定します