セキュリティのためにこのファイルはどこに保管すればよいですか?現時点ではそれは私のデスクトップ上にあります-他の場所に置くべきですか?
「標準」の場所は、$ HOMEの.sshディレクトリです。つまり.
/Users/$USER/.ssh/
このディレクトリは、アクセス許可700で保護する必要があります。pemを自動的に使用するように構成ファイルをセットアップし、EC2インスタンスに送信するときにユーザー名を設定できます。