以下のデータブロックがあります(複数)
chr1.trna4 (17188416-17188486) Length: 71 bp
Type: Gly Anticodon: CCC at 33-35 (17188448-17188450) Score: 78.3
HMM Sc=56.60 Sec struct Sc=21.70
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: GCATTGGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCCTCCCACGCGGGAGaCCCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGCA
Str: >>>>>>>..>>>>.......<<<<.>>>>>.......<<<<<....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
各ブロックについて、Str
で始まるブロックの最後の行で8番目のパターンを見つける必要があります。上記の場合、8番目のパターンは.......
(7周期)です。これは、>
シンボルの最初のセットが1つのパターンを作成し、2番目のピリオドのセットが2番目のパターンを作成する、というように続きます。
次に、これらの7文字を、パターン行のすぐ上のSeq
行から抽出する必要があります。例では、これはサブシーケンスCTCCCAC
に対応しています。
出力はSeq is CTCCCAC and Anticodon: CCC
である必要があります
これはbash
または任意のシェルで可能ですか?
データブロックのその他の例
chr19.trna11 (4724719-4724647) Length: 73 bp
Type: Val Anticodon: CAC at 34-36 (4724686-4724684) Score: 79.2
HMM Sc=49.10 Sec struct Sc=30.10
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: GTTTCCGTAGTGTAGCGGTtATCACATTCGCCTCACACGCGAAAGGtCCCCGGTTCGATCCCGGGCGGAAACA
Str: >>>>>>>..>>>..........<<<.>>>>>.......<<<<<.....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
chr19.trna12 (1383433-1383361) Length: 73 bp
Type: Phe Anticodon: GAA at 34-36 (1383400-1383398) Score: 88.9
HMM Sc=68.40 Sec struct Sc=20.50
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: GCCGAAATAGCTCAGTTGGGAGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAGGtCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA
Str: >>>>>>>..>>>>........<<<<.>>>>>.......<<<<<.....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
chr21.trna1 (18827177-18827107) Length: 71 bp
Type: Gly Anticodon: GCC at 33-35 (18827145-18827143) Score: 80.9
HMM Sc=60.10 Sec struct Sc=20.80
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: GCATGGGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAGGCCCGGGTTCGATTCCCGGCCCATGCA
Str: >>>>>>>..>>>>.......<<<<.>>>>>.......<<<<<....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
chrX.trna4 (18693101-18693029) Length: 73 bp
Type: Val Anticodon: TAC at 34-36 (18693068-18693066) Score: 82.9
HMM Sc=54.70 Sec struct Sc=28.20
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: GGTTCCATAGTGTAGTGGTtATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAGGtCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACCA
Str: >>>>>>>..>>>..........<<<.>>>>>.......<<<<<.....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
chrX.trna6 (3833344-3833271) Length: 74 bp
Type: Ile Anticodon: GAT at 35-37 (3833310-3833308) Score: 75.5
HMM Sc=50.20 Sec struct Sc=25.30
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: GGCCGGTTAGCTCAGTTGGTaAGAGCGTGGTGCTGATAACACCAAGGtCGCGGGCTCGACTCCCGCACCGGCCA
Str: >>>>>>>..>>>>.........<<<<.>>>>>.......<<<<<.....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
chrX.trna8 (3794915-3794842) Length: 74 bp
Type: Ile Anticodon: GAT at 35-37 (3794881-3794879) Score: 75.5
HMM Sc=50.20 Sec struct Sc=25.30
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: GGCCGGTTAGCTCAGTTGGTaAGAGCGTGGTGCTGATAACACCAAGGtCGCGGGCTCGACTCCCGCACCGGCCA
Str: >>>>>>>..>>>>.........<<<<.>>>>>.......<<<<<.....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
chrX.trna10 (3756491-3756418) Length: 74 bp
Type: Ile Anticodon: GAT at 35-37 (3756457-3756455) Score: 75.5
HMM Sc=50.20 Sec struct Sc=25.30
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: GGCCGGTTAGCTCAGTTGGTaAGAGCGTGGTGCTGATAACACCAAGGtCGCGGGCTCGACTCCCGCACCGGCCA
Str: >>>>>>>..>>>>.........<<<<.>>>>>.......<<<<<.....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
chr19.trna8 (45981945-45981859) Length: 87 bp
Type: SeC Anticodon: TCA at 36-38 (45981910-45981908) Score: 146.9
HMM Sc=0.00 Sec struct Sc=0.00
* | * | * | * | * | * | * | * | *
Seq: GCCCGGATGATCCTCAGTGGTCTGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGCTGTCTAGCGACAGAGTGGTTCAATTCCACCTTTCGGGCG
Str: >>>>>>>.>..>>>>>>....<<<<<<<<<<<<.......<<<<<<.>>>>>....<<<<<.>>>>.......<<<<<.<<<<<<<.
アンチコドンとともに開始インデックスを抽出できるとすると、
len=7
prior=2
while IFS= read -r line; do
if [[ $line =~ Anticodon:" "([[:alpha:]]+)" at "([0-9]+) ]]; then
anticodon=${BASH_REMATCH[1]}
start=$(( BASH_REMATCH[2] - 1)) # string indexing is zero-based
Elif [[ $line == "Seq: "* ]]; then
seq=${line#Seq: }
printf "Seq: %s, Anticodon: %s\n" "${seq:start-prior:len}" "$anticodon"
fi
done < file
"Str:"行を毎回解析するより複雑なソリューションですが、長さを7にハードコードしません( "n番目"のパターンをハードコードします)。
8thSeq() {
local seq=$1 str=$2
local last=${str:0:1}
local nth=8 n=1 start
for (( i=1; i < ${#str}; i++)); do
if [[ "${str:i:1}" != "$last" ]]; then
((n++))
if ((n == nth)); then
start=$i
Elif ((n == nth+1)); then
echo "${seq:start:i-start}"
break
fi
fi
last=${str:i:1}
done
}
while IFS= read -r line; do
if [[ $line =~ Anticodon:" "([[:alpha:]]+) ]]; then
anticodon=${BASH_REMATCH[1]}
Elif [[ $line == "Seq: "* ]]; then
seq=${line#Seq: }
Elif [[ $line == "Str: "* ]]; then
str=${line#Str: }
printf "Seq: %s, Anticodon: %s\n" "$(8thSeq "$seq" "$str")" "$anticodon"
fi
done < file
「より多くの」データを使用して、両方のソリューションが出力します
Seq: CTCACAC, Anticodon: CAC
Seq: CTGAAGA, Anticodon: GAA
Seq: CTGCCAC, Anticodon: GCC
Seq: TTTACAC, Anticodon: TAC
Seq: CTGATAA, Anticodon: GAT
Seq: CTGATAA, Anticodon: GAT
Seq: CTGATAA, Anticodon: GAT
Seq: CTTCAAA, Anticodon: TCA
awk
の使用:
$ awk -f script.awk file
Sequence: CTCACAC, Anticodon: CAC, Type: Val
Sequence: CTGAAGA, Anticodon: GAA, Type: Phe
Sequence: CTGCCAC, Anticodon: GCC, Type: Gly
Sequence: TTTACAC, Anticodon: TAC, Type: Val
Sequence: CTGATAA, Anticodon: GAT, Type: Ile
Sequence: CTGATAA, Anticodon: GAT, Type: Ile
Sequence: CTGATAA, Anticodon: GAT, Type: Ile
Sequence: CTTCAAA, Anticodon: TCA, Type: SeC
ここで、script.awk
は次のawk
プログラムです。
/^Type:/ {
type = $2
anticodon = $4
split($6, pos, "-")
}
/^Seq:/ {
seq = substr($2, pos[1]-2, length(anticodon) + 4)
# or: seq = substr($2, pos[1]-2, pos[2]-pos[1]+5)
printf "Sequence: %s, Anticodon: %s, Type: %s\n", seq, anticodon, type
}
最初のブロックは、文字列Type:
で始まる任意の行によってトリガーされ、2番目と4番目の空白区切りフィールドからタイプとアンチコドンシーケンスを取り出し、-
でそのような6番目のフィールドを分割して、シーケンスの開始座標と終了座標。
2番目のブロックは、文字列Seq:
で始まる行によってトリガーされ、アンチコドンの開始位置と最新のType:
から読み取られたアンチコドンの長さを使用して、2番目の空白区切りフィールドからシーケンスを取り出します。行、どちらかの側でいくつかの塩基対を取得することを確認します。
その後、出力が生成されます。
次のsed
スクリプトは、Str:
行の8番目の「パターン」を使用して、Type:
行で指定されたアンチコドンの数値位置ではなく、必要なシーケンスを抽出します。
/^Type:[[:blank:]]*/ {
s/.*Type: \([^[:blank:]]*\)[[:blank:]]*Anticodon: \([^[:blank:]]*\).*/ Anticodon: \2, Type: \1/
h
}
/^Seq:[[:blank:]]*/ {
s//Sequence: /
G
y/\n/,/
w data.tmp
}
/^Str:[[:blank:]]*/ {
s///
s,\(\(\([<>.]\)\3*\)\{7\}\)\(\([<>.]\)\5*\).*,s/: \1\\(\4\\)[^\,]*/: \\1/;n,
y/<>/../
w pass2.sed
}
d
(末尾のd
はタイプミスではありません)。
これは2つのパスで行われます。
最初のパスでは、2つの新しいファイルdata.tmp
とpass2.sed
が作成されます。
$ sed -f script.sed file
(これからのターミナル出力はありません)
指定されたデータの場合、data.tmp
は次のようになります
Sequence: GTTTCCGTAGTGTAGCGGTtATCACATTCGCCTCACACGCGAAAGGtCCCCGGTTCGATCCCGGGCGGAAACA, Anticodon: CAC, Type: Val
Sequence: GCCGAAATAGCTCAGTTGGGAGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAGGtCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA, Anticodon: GAA, Type: Phe
Sequence: GCATGGGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAGGCCCGGGTTCGATTCCCGGCCCATGCA, Anticodon: GCC, Type: Gly
Sequence: GGTTCCATAGTGTAGTGGTtATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAGGtCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACCA, Anticodon: TAC, Type: Val
Sequence: GGCCGGTTAGCTCAGTTGGTaAGAGCGTGGTGCTGATAACACCAAGGtCGCGGGCTCGACTCCCGCACCGGCCA, Anticodon: GAT, Type: Ile
Sequence: GGCCGGTTAGCTCAGTTGGTaAGAGCGTGGTGCTGATAACACCAAGGtCGCGGGCTCGACTCCCGCACCGGCCA, Anticodon: GAT, Type: Ile
Sequence: GGCCGGTTAGCTCAGTTGGTaAGAGCGTGGTGCTGATAACACCAAGGtCGCGGGCTCGACTCCCGCACCGGCCA, Anticodon: GAT, Type: Ile
Sequence: GCCCGGATGATCCTCAGTGGTCTGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGCTGTCTAGCGACAGAGTGGTTCAATTCCACCTTTCGGGCG, Anticodon: TCA, Type: SeC
一方、pass2.sed
は、これを後処理するsed
スクリプトです。
s/: ...............................\(.......\)[^,]*/: \1/;n
s/: ...............................\(.......\)[^,]*/: \1/;n
s/: ..............................\(.......\)[^,]*/: \1/;n
s/: ...............................\(.......\)[^,]*/: \1/;n
s/: ................................\(.......\)[^,]*/: \1/;n
s/: ................................\(.......\)[^,]*/: \1/;n
s/: ................................\(.......\)[^,]*/: \1/;n
s/: .................................\(.......\)[^,]*/: \1/;n
pass2.sed
をdata.sed
に適用すると、最終結果が得られます。
$ sed -f pass2.sed data.tmp
Sequence: CTCACAC, Anticodon: CAC, Type: Val
Sequence: CTGAAGA, Anticodon: GAA, Type: Phe
Sequence: CTGCCAC, Anticodon: GCC, Type: Gly
Sequence: TTTACAC, Anticodon: TAC, Type: Val
Sequence: CTGATAA, Anticodon: GAT, Type: Ile
Sequence: CTGATAA, Anticodon: GAT, Type: Ile
Sequence: CTGATAA, Anticodon: GAT, Type: Ile
Sequence: CTTCAAA, Anticodon: TCA, Type: SeC
注:2番目のステップがvery大規模なデータセットでどのように実行されるかはわかりません。
Str文字列の繰り返しを解析する必要があると仮定します。
パターンのシーケンスはブロックごとに変わる可能性があるため、8番目のパターンを見つける方法が必要です。
(GNU)grepを使用して、繰り返される「パターン」(説明から文字で始まり、同じ文字で終わるもの)をstrから抽出することができます。
$ str='>>>>>>>..>>>>.......<<<<.>>>>>.......<<<<<....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.'
$ grep -Eo '(.)\1+' <<<"$str"
>>>>>>>
..
>>>>
.......
<<<<
>>>>>
.......
<<<<<
....
>>>>>
.......
<<<<<<<<<<<<
したがって、(シェルを使用した)8
パターンの開始と長さは次のようになります。
pattern=8
splitstr=( $(grep -Eo '(.)\1+' <<<"$str") )
for((i=1;i<=pattern-2;i++)); do
start=$((start+${#splistr[i]}))
done
len=${splitstr[pattern-1]}
すべてのパターン(8回以上の繰り返し)。
または、短く、開始と終了:
start=$(echo "$str" | grep -Eo '^((.)\2+|.){7}'); start=${#start}
end=$(echo "$str" | grep -Eo '^((.)\2+|.){8}'); end=${#end}
AWKの場合:RS
を空の""
に設定することで、ファイルをブロック(空の行で区切られた行)に分割することができます(簡単です)。
RS
が""
の場合、各ブロックはawkによってさらにフィールドに自動的に分割されます。最後のフィールド(awkの用語では$NF
)であるため、繰り返される文字を含むstr。
したがって、awkで:
$ awk -vRS="" '{str=$NF; pat=8
cmd1="echo \"" str "\" | grep -Eo '\''^((.)\\2+|.){" pat-1 "}'\''";
cmd2="echo \"" str "\" | grep -Eo '\''^((.)\\2+|.){" pat "}'\''";
cmd1 | getline start ; close(cmd1) ; start=length(start)
cmd2 | getline end ; close(cmd2) ; end=length(end)
print "Start:",start,"End:",end,"Sequence:",substr($(NF-2),start,end-start),"Anticodon:",$9,"Type:",$7
}' biopattern.txt
Start: 30 End: 37 Sequence: CCTCCCA Anticodon: CCC Type: Gly
Start: 31 End: 38 Sequence: CCTCACA Anticodon: CAC Type: Val
Start: 31 End: 38 Sequence: ACTGAAG Anticodon: GAA Type: Phe
Start: 30 End: 37 Sequence: CCTGCCA Anticodon: GCC Type: Gly
Start: 31 End: 38 Sequence: CTTTACA Anticodon: TAC Type: Val
Start: 32 End: 39 Sequence: GCTGATA Anticodon: GAT Type: Ile
Start: 32 End: 39 Sequence: GCTGATA Anticodon: GAT Type: Ile
Start: 32 End: 39 Sequence: GCTGATA Anticodon: GAT Type: Ile
Start: 33 End: 40 Sequence: GCTTCAA Anticodon: TCA Type: SeC
at
の後の数字に基づく他の回答の結果とは異なります。
たぶん:これはあなたが意図したことですか?
これは、元の質問で要求されたように、実際にこれらの>>.......<<
を使用して目的のシーケンスを見つける方法です。 このショートカット が見つかる前に、私はそれに取り組み始めました。 sed
を使用した楽しい演習であることが判明しました(ただし、このアプローチは最適とはほど遠い場合があります)。 sed
がこれを実行できる例として、ここに投稿します。
<data sed -E '
/^Type:|^Seq:|^Str:/ ! d
/^Type:/ {
s/.*(Anticodon: [CGAT]*).*/\1/
p; d
}
/^Seq:/ {
s/[^CGATcgat]*([CGATcgat]*).*/-\1-/
h; d
}
/^Str:/ {
s/[^><\.]*([><\.]*).*/\1/
s/([^>])(>)/\1X\2/g
s/([^<])(<)/\1X\2/g
s/([^.])(\.)/\1X\2/g
s/X./X/g
s/./X/
s/((X[^X]*){7})X/\1M/
: deleting
x; s/.//
t forget
: forget
x; s/^[^M]//
t deleting
s/M//
: moving
x; s/(.)(.*)/\2\1/
t forget2
: forget2
x; s/^[^X]//
t moving
g; s/.*-//
}
' | sed -E '
/^Anticodon:/ { h; d}
/^Anticodon:/ ! {
s/^/Seq: /
s/$/, /
G
s/\n//
}
'
それはこのように動作します:
最初のsed
Type:
、Seq:
、またはStr:
で始まらない行は削除されます。Type:
で始まる行の場合、Anticodon:
情報が抽出されて出力されます。Seq:
で始まる行の場合、CGAT…
のような便利な文字列が抽出され、-
文字が埋め込まれます(後で役立つでしょう)。結果はホールドスペースに保存されます。Str:
:で始まる行の場合>>...<<…
の有用な文字列が抽出されます。X
は、シーケンスが変更されるたびに挿入されます。連続する文字は削除されます。 X
は最初の文字を置き換えます。結果では、すべての「パターン」の最初の文字の代わりにX
があります。X
はM
に置き換えられます。deleting
ループは、2つの行を切り替え、M
が見つかるまで先頭の文字を1つずつ削除します。 M
が検出された場合、他の文字列はすでに1回過剰に削減されています。これを補うために、先行する-
が以前に追加されました。moving
ループは、2つの行の間も切り替えます。 CGAT
文字を1つずつ最後に移動するため、末尾の-
の後にポップアップします。同じループは、X
が検出されるまで、「パターン」行から文字を1つずつ削除します。以前のM
と同様に、X
が検出されたとき、もう一方の文字列はすでに1回余分にシフトされています。これを補うために、ループの外のコマンド(s/M//
)でM
が削除されました。-
(以前は-
でした)の後ろにあります。それをパターンスペースにコピーし、-
までをすべて削除します。結果が出力されます。2番目のsed
段落モード-00
でPerl
を操作し、すべての段落を1つずつループ-n
します。最初に、現在のパラ、別名$_
のプロパティを確認して、タイプ、アンチコドン、シーケンス、およびstr変数を入力します。
$ Perl -n00e '
my($type, $anticodon, $seq, $str) =
/ (?= .*\nType: \h+ (\S+) )
(?= .*\hAnticodon: \h+ (\S+) )
(?= .*\nSeq: \h+ (\S+)$ )
(?= .*\nStr: \h+ (\S+)$ )
/xms;
$str =~ /^((.)\2*){7}((.)\4*)/g;
my($pos_codon, $len_codon) = (pos($str), length($3));
my $codon = substr($seq, $pos_codon-$len_codon, $len_codon);
print "Codon:[$codon] Anticodon:[$anticodon] Type:[$type]\n";
' file
結果:
Codon:[CTCACAC] Anticodon:[CAC] Type:[Val]
Codon:[CTGAAGA] Anticodon:[GAA] Type:[Phe]
Codon:[CTGCCAC] Anticodon:[GCC] Type:[Gly]
Codon:[TTTACAC] Anticodon:[TAC] Type:[Val]
Codon:[CTGATAA] Anticodon:[GAT] Type:[Ile]
Codon:[CTGATAA] Anticodon:[GAT] Type:[Ile]
Codon:[CTGATAA] Anticodon:[GAT] Type:[Ile]
Codon:[CTTCAAA] Anticodon:[TCA] Type:[SeC]
私の2セント
while IFS= read -r line; do
[[ "$(echo $line | grep "Type:")" ]] && codon="$(echo $line | cut -d' ' -f4)" && start="$(echo $line | cut -d' ' -f6)" && type="$(echo $line | cut -d' ' -f2)" && continue
[[ "$(echo $line | grep "Seq:")" ]] && seq="${line##Seq: }" && continue
if [[ -n "$seq" && -n "$codon" ]]; then
pos="${start%-*}" && pos="$((${pos}-3))"
echo Seq: "${seq:$pos:7}" Codon: "$codon" Type: "$type"
seq=
codon=
continue
fi
done < file
出力:
Seq: CTCACAC Codon: CAC Type: Val
Seq: CTGAAGA Codon: GAA Type: Phe
Seq: CTGCCAC Codon: GCC Type: Gly
Seq: TTTACAC Codon: TAC Type: Val
Seq: CTGATAA Codon: GAT Type: Ile
Seq: CTGATAA Codon: GAT Type: Ile
Seq: CTGATAA Codon: GAT Type: Ile
Seq: CTTCAAA Codon: TCA Type: SeC
「タイプ」で始まる行を見つけ、「タイプ」、「コドン」、「位置(33-35から33だけ)」を抽出します。
[[ "$(echo $line | grep "Type:")" ]] && codon="$(echo $line | cut -d' ' -f4)" && start="$(echo $line | cut -d' ' -f6)" && type="$(echo $line | cut -d' ' -f2)" && continue
"Seq:"で始まる行を取得して、dnaシーケンスを抽出します。
[[ "$(echo $line | grep "Seq:")" ]] && seq="${line##Seq: }" && continue
$ seqと$ codonの両方の変数が設定されている場合は、結果を出力し、変数の設定を解除してから続行します。
if [[ -n $seq && -n $codon ]]; then
pos="${start%-*}" && pos="$((${pos}-3))"
echo Seq: ${seq:$pos:7} Codon: $codon Type: $type
seq=
codon=
continue
fi
1つのアプローチは、段落モードでPerlを使用して、パラを改行に分割することです。コルドンの位置と長さを決定するために使用するパラの最後の行。次にこれらの数値を使用して、直前の行からデータを取得します。
$ Perl -F\\n -l -00 -nae '
$F[-1] =~ /^Str:\s+((.)\2*){7}((.)\4*)/g;
my $c = substr($F[-2],pos($F[-1])-length($3),length($3));
my $a = substr($c, 2, 3);
print "seq:$c anti:$a";
' file.gene
seq:CTCCCAC anti:CCC
簡単な説明:
Each record is a paragraph. Then that
レコードは改行で分割され、結果の断片はゼロインデックス配列@Fに格納されます。次に、最後の要素$ F [-1]が繰り返されるシーケンスについてスキャンされます。
((.)\1*) is a regex for one set if
連続した文字。ブレース{7}をこのn uに適用して、7つのシーケンスを取得します。次は8日で、私たちが望むものです。
次に、Type:
ショートカットに依存しないawk
スクリプトを示します。
function getpos( str, seqndx )
{
ndx = 1
i = 1
strlen = length($tr)
split(str, chars, "")
mchar = chars[1]
for (; i <= strlen; i++) {
if (mchar != chars[i]) {
mchar = chars[i]
if (++ndx == seqndx)
break
}
}
seqstart = i
for (; i <= strlen; i++) {
if (mchar != chars[i])
break
}
return seqstart " " --i
}
/^Type:/ {
anticodon = $4
}
/^Seq:/ {
seqstr = $2
}
/^Str:/ {
posstr = getpos( $2, 8 )
split(posstr, pos)
seq = substr(seqstr, pos[1], pos[2] - pos[1] + 1)
printf "Sequence: %s, Anticodon: %s\n", seq, anticodon
}
このスクリプトによって生成される出力は次のとおりです。
$ awk -f script.awk infile
Sequence: CTCACAC, Anticodon: CAC
Sequence: CTGAAGA, Anticodon: GAA
Sequence: CTGCCAC, Anticodon: GCC
Sequence: TTTACAC, Anticodon: TAC
Sequence: CTGATAA, Anticodon: GAT
Sequence: CTGATAA, Anticodon: GAT
Sequence: CTGATAA, Anticodon: GAT
Sequence: CTTCAAA, Anticodon: TCA
$